「mrcImageTransformDescartesIntoPolar」の版間の差分

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(→‎dthetaで実行)
 
(同じ利用者による、間の3版が非表示)
行14: 行14:
 
<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>入力ファイル</td>  
+
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>出力ファイル</td>  
+
<td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行26: 行26:
 
<td>-dr</td>  
 
<td>-dr</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Delta r of outputfile[A].</td>  
+
<td>出力ファイルの rの間隔[A].</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行32: 行32:
 
<td>-dtheta</td>  
 
<td>-dtheta</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Delta theta of outputfile[degree].</td>  
+
<td>出力ファイルの thetaの間隔[degree].</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行38: 行38:
 
<td>-dphi</td>  
 
<td>-dphi</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Delta phi of outputfile[degree].</td>  
+
<td>出力ファイルの phiの間隔[degree].</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行103: 行103:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===[[Media:1VOM.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-1VOM.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3398.12 (23, 55, 41)<br>
 +
72.129<br>
 +
294.805<br>
 +
0.368507<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
106990 (217, 134, 38)<br>
 +
945.995<br>
 +
4903.65<br>
 +
3.0458<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-dr===
 +
====dr=0.5で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-dr-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dr-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
106990 (217, 134, 76)<br>
 +
963.711<br>
 +
4966.22<br>
 +
2.18119<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-dtheta===
 +
====dtheta=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-dtheta-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dtheta-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
100562 (10, 57, 38)<br>
 +
947.037<br>
 +
4908.58<br>
 +
4.31175<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-dphi===
 +
====dphi=3で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-dphi-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dphi-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
95524.3 (53, 84, 36)<br>
 +
936.398<br>
 +
4885.31<br>
 +
5.27779<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1で実行====
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-m1-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m1-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2834.1 (341, 105, 17)<br>
 +
32.6544<br>
 +
163.49<br>
 +
0.101548<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
=====zaxis=(0, 0, -1)で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-m1zaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m1zaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2834.1 (19, 73, 17)<br>
 +
32.6544<br>
 +
163.49<br>
 +
0.101548<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
=====xaxis=(1.7, 0, -1)で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-m1xaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m1xaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2924.82 (32, 100, 23)<br>
 +
23.4798<br>
 +
139.162<br>
 +
0.0864377<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-rweight===
 +
=====-rweight, m=1, xaxis=(1.7, 0, -1)で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-rweight-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-rweight-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
100365 (34, 132, 39)<br>
 +
693.379<br>
 +
4235.18<br>
 +
2.6306<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>

2014年8月4日 (月) 02:55時点における最新版

mrcImageTransformDescartesIntoPolarとは直交座標系から極座標系に画像を変換するEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-dr 選択 出力ファイルの rの間隔[A]. 1
-dtheta 選択 出力ファイルの thetaの間隔[degree]. 1
-dphi 選択 出力ファイルの phiの間隔[degree]. 1
-zaxis 選択 z軸のベクトル: (zx, zy, zz) (0, 0, 1)
-xaxis 選択 x軸のベクトル: (xx, xy, xz) (1, 0, 0)
-centre 選択 中心軸のベクトル: (cx, cy, cz) (0, 0, 0)
-rweight 選択 r-weighted
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0 重心を画像の中心とする
1 -axis, -centreで画像の中心を定義する


実行例

入力ファイルの画像

Input-1VOM.png
xy平面

Input1-1VOM.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3398.12 (23, 55, 41)
72.129
294.805

0.368507


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

106990 (217, 134, 38)
945.995
4903.65

3.0458


オプション　-dr

dr=0.5で実行

Outdata-dr-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-dr-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

106990 (217, 134, 76)
963.711
4966.22

2.18119


オプション　-dtheta

dtheta=2で実行

Outdata-dtheta-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-dtheta-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

100562 (10, 57, 38)
947.037
4908.58

4.31175


オプション　-dphi

dphi=3で実行

Outdata-dphi-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-dphi-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

95524.3 (53, 84, 36)
936.398
4885.31

5.27779


オプション　-m

m=1で実行

その他のオプション設定なし

Outdata-m1-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-m1-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2834.1 (341, 105, 17)
32.6544
163.49

0.101548


zaxis=(0, 0, -1)で実行

Outdata-m1zaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-m1zaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2834.1 (19, 73, 17)
32.6544
163.49

0.101548


xaxis=(1.7, 0, -1)で実行

Outdata-m1xaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-m1xaxis-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2924.82 (32, 100, 23)
23.4798
139.162

0.0864377


オプション　-rweight

-rweight, m=1, xaxis=(1.7, 0, -1)で実行

Outdata-rweight-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
xy平面

Outdata1-rweight-mrcImageTransformDescartesIntoPolar.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

100365 (34, 132, 39)
693.379
4235.18

2.6306



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