「mrcSinogramFET」の版間の差分
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(ページの作成:「'''mrcSinogramFET'''とはEosのコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプション=== <table border="1"> <tr> <th>オプ...」) |
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| (同じ利用者による、間の12版が非表示) | |||
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| − | '''mrcSinogramFET''' | + | '''mrcSinogramFET'''とはシノグラムの特徴量(幅、歪度、尖度)を算出する[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
| 行14: | 行14: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td> | + | <td>入力ファイル: [[mrcImage]](シノグラム)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行20: | 行20: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]](FET)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-ch</td> | <td>-ch</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]](FET)(正規化データ)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行54: | 行54: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行66: | 行67: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | ===出力ファイルのフォーマット=== | ||
| + | <div>シノグラムの各θ毎に以下の値を出力する</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 幅 歪度 尖度 | ||
| + | . . . | ||
| + | . . . | ||
| + | . . . | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <div>幅はθ毎の[[自己相関値]]について[[尖度]]を計算することによって算出している。</div> | ||
| + | <br> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===[[:Media:Input-B120-sin.mrc | 入力ファイル]]の画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-B120-sin.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 65535 (77, 34, 0)<br> | ||
| + | 22776.7<br> | ||
| + | 23232.9<br> | ||
| + | 136.901<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <div>-oのファイルを[[mrcImageMakeDump]](m=8)で見た場合</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0.0614942 0.0325917 1.78762 | ||
| + | 0.0605712 0.0632562 1.93108 | ||
| + | 0.0639257 0.0789107 1.95908 | ||
| + | 0.0634946 -0.0737892 2.01836 | ||
| + | 0.0608277 0.202078 1.89107 | ||
| + | 0.0542547 0.144344 1.85886 | ||
| + | 0.0521331 0.10485 1.82517 | ||
| + | 0.0616536 0.0753629 1.8386 | ||
| + | 0.0620365 0.00882033 1.76001 | ||
| + | 0.0609849 -0.178435 1.8612 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 0.0594001 0.0137078 1.69186 | ||
| + | 0.0641533 -0.0104053 1.8428 | ||
| + | 0.0666817 -0.0237231 1.73576 | ||
| + | 0.0679321 0.135993 1.93031 | ||
| + | 0.0616724 0.0270474 1.75367 | ||
| + | 0.0614942 -0.0325917 1.78763 | ||
| + | 0.0605712 -0.0632519 1.93109 | ||
| + | 0.0639255 -0.0789105 1.95908 | ||
| + | 0.0634947 0.0737856 2.01836 | ||
| + | 0.0608276 -0.202075 1.89107 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 0.0577482 -0.05145 1.85321 | ||
| + | 0.060355 0.0692867 1.93637 | ||
| + | 0.0553964 0.0399175 1.82433 | ||
| + | 0.0564827 0.121926 1.75859 | ||
| + | 0.0580604 -0.00824017 1.65152 | ||
| + | 0.0594001 -0.0137042 1.69186 | ||
| + | 0.0640352 0.0111142 1.84374 | ||
| + | 0.0664901 0.0239018 1.73636 | ||
| + | 0.0676839 -0.135384 1.93055 | ||
| + | 0.0616659 -0.0268808 1.75356 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(幅)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata1-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(歪度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(尖度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>-chのファイルを[[mrcImageMakeDump]](m=8)で見た場合</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | -0.152068 0.261573 -0.50104 | ||
| + | -0.224789 0.537886 0.937449 | ||
| + | 0.0395039 0.678946 1.2182 | ||
| + | 0.00553877 -0.697009 1.81255 | ||
| + | -0.204582 1.78879 0.536229 | ||
| + | -0.722448 1.26855 0.213237 | ||
| + | -0.889606 0.912684 -0.124537 | ||
| + | -0.139506 0.646977 0.01011 | ||
| + | -0.109342 0.0473727 -0.777902 | ||
| + | -0.192197 -1.63996 0.236728 | ||
| + | |||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | -0.546908 -1.13077 -0.792131 | ||
| + | -0.42261 0.0421458 -1.86576 | ||
| + | -0.31706 0.091413 -1.46124 | ||
| + | 0.0574377 -0.125866 0.0522004 | ||
| + | 0.256643 -0.245871 -1.02104 | ||
| + | 0.355158 1.19331 0.929678 | ||
| + | -0.138031 0.211614 -0.841446 | ||
| + | -0.152069 -0.325784 -0.501014 | ||
| + | -0.224792 -0.602058 0.937471 | ||
| + | 0.0394892 -0.743156 1.21819 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | -0.447208 -0.495713 0.156582 | ||
| + | -0.241819 0.592226 0.990494 | ||
| + | -0.632502 0.327584 -0.13293 | ||
| + | -0.546909 1.06655 -0.792107 | ||
| + | -0.422611 -0.106357 -1.86577 | ||
| + | -0.317057 -0.155592 -1.46122 | ||
| + | 0.0481348 0.0680422 0.0616421 | ||
| + | 0.241547 0.183269 -1.01502 | ||
| + | 0.335601 -1.25203 0.932057 | ||
| + | -0.13854 -0.274324 -0.842582 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata3-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(幅)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata4-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(歪度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata5-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(尖度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | -o に対して正規化されているのが分かる。<br> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -sm=== | ||
| + | ====sm=2で実行==== | ||
| + | <div>出力ファイルを[[mrcImageMakeDump]](m=8)で見た場合</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0.0918657 0.0344836 2.73613 | ||
| + | 0.0913183 0.0795521 2.8249 | ||
| + | 0.0925341 0.102712 2.91063 | ||
| + | 0.0939957 0.0341889 2.95426 | ||
| + | 0.0924467 0.0957727 2.92026 | ||
| + | 0.0878268 0.204839 2.84051 | ||
| + | 0.0834795 0.156225 2.80756 | ||
| + | 0.087179 0.121735 2.79743 | ||
| + | 0.0921307 0.0737197 2.76485 | ||
| + | 0.0917963 -0.0531793 2.77615 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 0.0890158 0.0426021 2.63723 | ||
| + | 0.0920623 0.0332794 2.73287 | ||
| + | 0.0957031 0.0145639 2.75482 | ||
| + | 0.0975925 0.0877632 2.79858 | ||
| + | 0.0950878 0.113149 2.80753 | ||
| + | 0.0918689 0.028856 2.73619 | ||
| + | 0.0913183 -0.0162937 2.8249 | ||
| + | 0.0925339 -0.0394531 2.91063 | ||
| + | 0.0939957 0.0290656 2.95426 | ||
| + | 0.0924467 -0.0325166 2.92026 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 0.0912556 -0.0290791 2.76966 | ||
| + | 0.0906757 -0.0484107 2.77224 | ||
| + | 0.0893372 0.0405465 2.86033 | ||
| + | 0.0881613 0.0862302 2.8459 | ||
| + | 0.0862251 0.11255 2.75701 | ||
| + | 0.0875571 0.0884708 2.6706 | ||
| + | 0.0890158 0.0206559 2.63723 | ||
| + | 0.0920033 0.0303331 2.73334 | ||
| + | 0.0955483 0.0491361 2.75559 | ||
| + | 0.0973726 -0.024113 2.799 | ||
| + | 0.0949605 -0.0495043 2.8076 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-sm2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(幅)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata1-sm2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(歪度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata2-sm2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(尖度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>-chのファイルを[[mrcImageMakeDump]](m=8)で見た場合</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | -0.147819 -0.00778411 -0.845133 | ||
| + | -0.191689 0.488046 0.274498 | ||
| + | -0.0942456 0.74284 1.35589 | ||
| + | 0.0229111 -0.0110267 1.90633 | ||
| + | -0.101244 0.666501 1.47737 | ||
| + | -0.471537 1.86642 0.471413 | ||
| + | -0.819977 1.33158 0.0557929 | ||
| + | -0.523461 0.952127 -0.0719755 | ||
| + | -0.126578 0.42388 -0.48294 | ||
| + | -0.153379 -0.972225 -0.340396 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | -0.599897 -0.929452 -0.581873 | ||
| + | -0.493149 -0.664574 -1.6718 | ||
| + | -0.376236 0.0815337 -2.09267 | ||
| + | -0.132058 -0.0210327 -0.886283 | ||
| + | 0.159758 -0.226934 -0.6094 | ||
| + | 0.311195 0.578382 -0.0574679 | ||
| + | 0.110442 0.857664 0.0554982 | ||
| + | -0.147561 -0.0696975 -0.844402 | ||
| + | -0.191692 -0.56642 0.274529 | ||
| + | -0.0942552 -0.821213 1.3559 | ||
| + | 0.0229063 -0.0673908 1.90632 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | -0.243192 -0.919762 -0.389729 | ||
| + | -0.350475 0.0589178 0.721506 | ||
| + | -0.444726 0.561517 0.539406 | ||
| + | -0.599912 0.851075 -0.581846 | ||
| + | -0.49315 0.586167 -1.6718 | ||
| + | -0.376234 -0.159912 -2.09267 | ||
| + | -0.136788 -0.0534466 -0.880331 | ||
| + | 0.147347 0.153418 -0.599668 | ||
| + | 0.293568 -0.652446 -0.0521809 | ||
| + | 0.100236 -0.931793 0.0562801 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata3-sm2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(幅)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata4-sm2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(歪度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata5-sm2-mrcSinogramFET.png]]<br> | ||
| + | gnuplotにて表示(尖度)<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
2014年9月29日 (月) 07:16時点における最新版
mrcSinogramFETとはシノグラムの特徴量(幅、歪度、尖度)を算出するEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage(シノグラム) | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage(FET) | NULL |
| -ch | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(FET)(正規化データ) | NULL |
| -sm | 選択 | SmoothingFilter(move range of column smoothing by moving-average) | 1 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
出力ファイルのフォーマット
シノグラムの各θ毎に以下の値を出力する
幅 歪度 尖度 . . . . . . . . .
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 65535 (77, 34, 0) |
オプション必須項目のみの場合
-oのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0.0614942 0.0325917 1.78762
0.0605712 0.0632562 1.93108
0.0639257 0.0789107 1.95908
0.0634946 -0.0737892 2.01836
0.0608277 0.202078 1.89107
0.0542547 0.144344 1.85886
0.0521331 0.10485 1.82517
0.0616536 0.0753629 1.8386
0.0620365 0.00882033 1.76001
0.0609849 -0.178435 1.8612
-中略-
0.0594001 0.0137078 1.69186
0.0641533 -0.0104053 1.8428
0.0666817 -0.0237231 1.73576
0.0679321 0.135993 1.93031
0.0616724 0.0270474 1.75367
0.0614942 -0.0325917 1.78763
0.0605712 -0.0632519 1.93109
0.0639255 -0.0789105 1.95908
0.0634947 0.0737856 2.01836
0.0608276 -0.202075 1.89107
-中略-
0.0577482 -0.05145 1.85321
0.060355 0.0692867 1.93637
0.0553964 0.0399175 1.82433
0.0564827 0.121926 1.75859
0.0580604 -0.00824017 1.65152
0.0594001 -0.0137042 1.69186
0.0640352 0.0111142 1.84374
0.0664901 0.0239018 1.73636
0.0676839 -0.135384 1.93055
0.0616659 -0.0268808 1.75356
|
|
|
-chのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
-0.152068 0.261573 -0.50104
-0.224789 0.537886 0.937449
0.0395039 0.678946 1.2182
0.00553877 -0.697009 1.81255
-0.204582 1.78879 0.536229
-0.722448 1.26855 0.213237
-0.889606 0.912684 -0.124537
-0.139506 0.646977 0.01011
-0.109342 0.0473727 -0.777902
-0.192197 -1.63996 0.236728
-中略-
-0.546908 -1.13077 -0.792131
-0.42261 0.0421458 -1.86576
-0.31706 0.091413 -1.46124
0.0574377 -0.125866 0.0522004
0.256643 -0.245871 -1.02104
0.355158 1.19331 0.929678
-0.138031 0.211614 -0.841446
-0.152069 -0.325784 -0.501014
-0.224792 -0.602058 0.937471
0.0394892 -0.743156 1.21819
-中略-
-0.447208 -0.495713 0.156582
-0.241819 0.592226 0.990494
-0.632502 0.327584 -0.13293
-0.546909 1.06655 -0.792107
-0.422611 -0.106357 -1.86577
-0.317057 -0.155592 -1.46122
0.0481348 0.0680422 0.0616421
0.241547 0.183269 -1.01502
0.335601 -1.25203 0.932057
-0.13854 -0.274324 -0.842582
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-o に対して正規化されているのが分かる。
オプション -sm
sm=2で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0.0918657 0.0344836 2.73613
0.0913183 0.0795521 2.8249
0.0925341 0.102712 2.91063
0.0939957 0.0341889 2.95426
0.0924467 0.0957727 2.92026
0.0878268 0.204839 2.84051
0.0834795 0.156225 2.80756
0.087179 0.121735 2.79743
0.0921307 0.0737197 2.76485
0.0917963 -0.0531793 2.77615
-中略-
0.0890158 0.0426021 2.63723
0.0920623 0.0332794 2.73287
0.0957031 0.0145639 2.75482
0.0975925 0.0877632 2.79858
0.0950878 0.113149 2.80753
0.0918689 0.028856 2.73619
0.0913183 -0.0162937 2.8249
0.0925339 -0.0394531 2.91063
0.0939957 0.0290656 2.95426
0.0924467 -0.0325166 2.92026
-中略-
0.0912556 -0.0290791 2.76966
0.0906757 -0.0484107 2.77224
0.0893372 0.0405465 2.86033
0.0881613 0.0862302 2.8459
0.0862251 0.11255 2.75701
0.0875571 0.0884708 2.6706
0.0890158 0.0206559 2.63723
0.0920033 0.0303331 2.73334
0.0955483 0.0491361 2.75559
0.0973726 -0.024113 2.799
0.0949605 -0.0495043 2.8076
|
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-chのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
-0.147819 -0.00778411 -0.845133
-0.191689 0.488046 0.274498
-0.0942456 0.74284 1.35589
0.0229111 -0.0110267 1.90633
-0.101244 0.666501 1.47737
-0.471537 1.86642 0.471413
-0.819977 1.33158 0.0557929
-0.523461 0.952127 -0.0719755
-0.126578 0.42388 -0.48294
-0.153379 -0.972225 -0.340396
-中略-
-0.599897 -0.929452 -0.581873
-0.493149 -0.664574 -1.6718
-0.376236 0.0815337 -2.09267
-0.132058 -0.0210327 -0.886283
0.159758 -0.226934 -0.6094
0.311195 0.578382 -0.0574679
0.110442 0.857664 0.0554982
-0.147561 -0.0696975 -0.844402
-0.191692 -0.56642 0.274529
-0.0942552 -0.821213 1.3559
0.0229063 -0.0673908 1.90632
-中略-
-0.243192 -0.919762 -0.389729
-0.350475 0.0589178 0.721506
-0.444726 0.561517 0.539406
-0.599912 0.851075 -0.581846
-0.49315 0.586167 -1.6718
-0.376234 -0.159912 -2.09267
-0.136788 -0.0534466 -0.880331
0.147347 0.153418 -0.599668
0.293568 -0.652446 -0.0521809
0.100236 -0.931793 0.0562801
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