「mrcImageSmoothing」の版間の差分
提供: Eospedia
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| + | * メジアンフィルタ（指定した範囲の中央値） | ||
| + | * 平均値フィルタ（指定した範囲の平均値） | ||
| + | * ２次曲面フィット | ||
| + | * Lee-Sigmaフィルタ | ||
| + | * 局所重み付き平均 | ||
| + | * エッジ・線構造重み付き平滑化 | ||
| + | * コントラスト依存型重み付き平滑化 | ||
| + | * 勾配逆数重み付き平滑化 | ||
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| + | 関連したツールとして、[[mrcImageLowPassFilter]]や[[mrcImageBilateralFilter]]などがある。 | ||
== オプション一覧 == | == オプション一覧 == | ||
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<tr> | <tr> | ||
<td>1</td> | <td>1</td> | ||
| − | <td> | + | <td>メジアンフィルタ（指定した範囲の中央値）</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>2</td> | <td>2</td> | ||
| − | <td> | + | <td>平均値フィルタ（指定した範囲の平均値）</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>3</td> | <td>3</td> | ||
| − | <td> | + | <td>２次曲面フィット</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>4</td> | <td>4</td> | ||
| − | <td>Lee- | + | <td>Lee-Sigmaフィルタ</td> |
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| + | <tr> | ||
| + | <td>5</td> | ||
| + | <td>局所重み付き平均</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>6</td> | ||
| + | <td>エッジ・線構造重み付き平滑化</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>7</td> | ||
| + | <td>コントラスト依存型重み付き平滑化</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>8</td> | ||
| + | <td>勾配逆数重み付き平滑化</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</div> | </div> | ||
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[-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile | [-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile | ||
>>> Mode <<<< | >>> Mode <<<< | ||
| − | + | 1: Median filter | |
| − | + | 2: Mean filter | |
| − | + | 3: Surface Fit filter | |
| − | + | 4: Lee-Sigma filter(Use sigma) | |
| + | 5: Local weighted mean filter | ||
| + | 6: Edge and line weights smoothing filter(3x3) | ||
| + | 7: Contrast-sensitiveline weights smoothing filter(3x3:Use sigma) | ||
| + | 8: Gradient inverse weighted smoothing filter(3x3) | ||
>>> Mode2 <<<< | >>> Mode2 <<<< | ||
0: Kernel is cube. : required argumnent: -sx, -sy, [-sz] | 0: Kernel is cube. : required argumnent: -sx, -sy, [-sz] | ||
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| − | === | + | ===入力ファイルの画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
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</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
| − | === | + | ===モード１の1～3での処理画像=== |
| + | ====モード１：1==== | ||
<table> | <table> | ||
| − | |||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Smo.m1.center-mrcImageSmoothing.png]]</td> | <td>[[画像:Smo.m1.center-mrcImageSmoothing.png]]</td> | ||
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</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| − | + | ====モード１：2==== | |
| + | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Smo.m2.center-mrcImageSmoothing.png]]</td> | <td>[[画像:Smo.m2.center-mrcImageSmoothing.png]]</td> | ||
| 行264: | 行300: | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| − | + | ====モード１：3==== | |
| + | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>[[画像:Smo.m3.center-mrcImageSmoothing.png]]</td> | <td>[[画像:Smo.m3.center-mrcImageSmoothing.png]]</td> | ||
| 行298: | 行337: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
2015年3月4日 (水) 06:08時点における最新版
mrcImageSmoothingとはmrcImage形式の画像を非線形平滑化するためのEosのコマンドである。 現在、こちらのコマンドで対応している平滑化フィルタは次の通りである。
- メジアンフィルタ（指定した範囲の中央値）
- 平均値フィルタ（指定した範囲の平均値）
- ２次曲面フィット
- Lee-Sigmaフィルタ
- 局所重み付き平均
- エッジ・線構造重み付き平滑化
- コントラスト依存型重み付き平滑化
- 勾配逆数重み付き平滑化
関連したツールとして、mrcImageLowPassFilterやmrcImageBilateralFilterなどがある。
目次
オプション一覧
メインオプション
-m の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 1 | メジアンフィルタ（指定した範囲の中央値） |
| 2 | 平均値フィルタ（指定した範囲の平均値） |
| 3 | ２次曲面フィット |
| 4 | Lee-Sigmaフィルタ |
| 5 | 局所重み付き平均 |
| 6 | エッジ・線構造重み付き平滑化 |
| 7 | コントラスト依存型重み付き平滑化 |
| 8 | 勾配逆数重み付き平滑化 |
※モード１はデフォルト＝０になっているが、モード１の選択肢に
０は無いので、指定しなければエラーとなる。
０は無いので、指定しなければエラーとなる。
-M の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 矩形: -sx, -sy, [-sz]の入力が必要 |
| 1 | 球体(m=1のみ対応): -rの入力が必要 |
実行例
-h によるヘルプの例
$ mrcImageSmoothing -h
Usage: /home/people/tacyas/Eos/bin/X86LINUX64/mrcImageSmoothing
Options:
[-i[nput] In (NULL )] :Essential :InputDataFile
[-o[utput] Out (NULL )] :Essential :OutputDataFile
[-sx sx (3 )] :Optional :x of Kernel Size
[-sy sy (3 )] :Optional :y of Kernel Size
[-sz sz (3 )] :Optional :z of Kernel Size
[-r r (1 )] :Optional :Radius of Kernel Size
[-sigma sigma (2.0 )] :Optional :Sigma for Lee-Sigma
[-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode
[-M[ode2] mode2 (0 )] :Optional :Mode
[-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile
>>> Mode <<<<
1: Median filter
2: Mean filter
3: Surface Fit filter
4: Lee-Sigma filter(Use sigma)
5: Local weighted mean filter
6: Edge and line weights smoothing filter(3x3)
7: Contrast-sensitiveline weights smoothing filter(3x3:Use sigma)
8: Gradient inverse weighted smoothing filter(3x3)
>>> Mode2 <<<<
0: Kernel is cube. : required argumnent: -sx, -sy, [-sz]
1: Kernel is sphere.(Only mode 1 supported) : required argumnent: -r
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
-65.0178 94.4699 |
モード１の1～3での処理画像
モード１：1
 |
最小 最大 |
-41.8721 65.9659 |
モード２：0を選択 -sx=9,-sy=9に変更 |
 |
最小 最大 |
-54.6403 54.0815 |
| モード２：1を選択 -r=5に変更 |
 |
最小 最大 |
-54.6403 55.7056 |
モード１：2
 |
最小 最大 |
-41.8721 67.5276 |
モード２：0を選択 -sx=9,-sy=9に変更 |
 |
最小 最大 |
-54.6403 54.0644 |
モード１：3
 |
最小 最大 |
-41.8721 83.4967 |
モード２：0を選択 -sx=9,-sy=9に変更 |
 |
最小 最大 |
-54.6403 56.99 |
