「mrcImageSolventFlattening」の版間の差分

2013年10月31日 (木) 07:03時点における版

mrcImageSolventFlatteningとは溶液と考えられる部分の平滑化を行うEosのコマンドである。

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-rmax	選択	rmax [A]	190
-sd	選択	Assign voxels below MeanOfSolvent+Range*SDofSolvent as Solvent	0
-density	選択	embed mean lower than density value	0
-Floating	選択	data minus mean of Solvent
-oparam	選択	出力: パラメータ	stdout
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-SD range : assign the voxels whose density is less than maen + range*SD as solvent range
-density is stronger than -m

モード	説明
0	mean of all density
1	mean of sphere surface density at rmax
2	mean of cylinder surface density at rmax
6	mean of 2D Edge X=0 or N.x-1

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