「mrcImageRefCreate」の版間の差分

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(ページの作成:「'''mrcImageRefCreate'''とはEosのコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプション=== <table border="1"> <tr> <th>オ...」)
 
行26: 行26:
 
<td>-p</td>  
 
<td>-p</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Position of Center of model creation:(Phi[degree], Omega[degree], Alpha[degree])</td>  
+
<td>中心座標:(Phi[degree], Omega[degree], Alpha[degree])</td>  
 
<td>(0, 0, 0)</td>  
 
<td>(0, 0, 0)</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行32: 行32:
 
<td>-w</td>  
 
<td>-w</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Width:(Phi[degree,plus minus], Omega[degree,plus minus], Alpha[degree,plus minus]) </td>  
+
<td>幅:(Phi[±degree], Omega[±degree], Alpha[±degree]) </td>  
 
<td>(360, 10, 10)</td>  
 
<td>(360, 10, 10)</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行38: 行38:
 
<td>-d</td>  
 
<td>-d</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Interval of model creation[degree]:(Phi[around Z axis], Omega[Y axis], Alpha[X axis])</td>  
+
<td>間隔[degree]:(Phi[Z軸周り], Omega[Y軸], Alpha[X軸])</td>  
 
<td>(5, 5, 5)</td>  
 
<td>(5, 5, 5)</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行44: 行44:
 
<td>-x</td>  
 
<td>-x</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Data length of x in the outputfile.Default:Data length of x in the inputfile</td>  
+
<td>出力ファイルのx長(デフォルト:入力ファイルのx長)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行79: 行79:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
−
<td>Magnification is changed to unchange molecular distance.</td>  
+
<td>分子間距離を変更せずに倍率を変更</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
行85: 行85:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===入力ファイルの画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-mrcImageRefCreate.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2 (4, 4, 3)<br>
 +
0.390933<br>
 +
0.611902<br>
 +
0.0111718<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[http://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/index.php/%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB:Outdata-mrcImageRefCreate.png]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-49.375 (4, 0, 0)<br>
 +
246.875 (3, 0, 0)<br>
 +
58.4295<br>
 +
39.1421<br>
 +
0.153212<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-w===
 +
====w=(10, 5, 15)で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-w-mrcImageRefCreate.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.12463 (4, 0, 62)<br>
 +
15 (8, 0, 0)<br>
 +
4.00604<br>
 +
3.45942<br>
 +
0.0208384<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-p===
 +
====p=(5, 10, 15), w=(10, 5, 15)で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-p-mrcImageRefCreate.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.820199 (18, 2, 28)<br>
 +
15 (2, 0, 0)<br>
 +
4.89738<br>
 +
3.59733<br>
 +
0.0390646<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-d===
 +
====d=(10, 5, 1.25), w=(10, 5, 15)で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-d-mrcImageRefCreate.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.11021 (4, 0, 121)<br>
 +
15 (8, 0, 0)<br>
 +
4.02236<br>
 +
3.45945<br>
 +
0.0142714<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m-mrcImageRefCreate.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.12463 (4, 0, 62)<br>
 +
15 (8, 0, 0)<br>
 +
4.03214<br>
 +
3.45754<br>
 +
0.020827<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>

2013年11月7日 (木) 01:06時点における版

mrcImageRefCreateとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-p 選択 中心座標:(Phi[degree], Omega[degree], Alpha[degree]) (0, 0, 0)
-w 選択 幅:(Phi[±degree], Omega[±degree], Alpha[±degree]) (360, 10, 10)
-d 選択 間隔[degree]:(Phi[Z軸周り], Omega[Y軸], Alpha[X軸]) (5, 5, 5)
-x 選択 出力ファイルのx長(デフォルト:入力ファイルのx長) NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0 通常
1 分子間距離を変更せずに倍率を変更


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2 (4, 4, 3)
0.390933
0.611902

0.0111718

オプション必須項目のみの場合

[1]

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-49.375 (4, 0, 0)

246.875 (3, 0, 0)
58.4295
39.1421

0.153212

オプション　-w

w=(10, 5, 15)で実行

Outdata-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.12463 (4, 0, 62)

15 (8, 0, 0)
4.00604
3.45942

0.0208384

オプション　-p

p=(5, 10, 15), w=(10, 5, 15)で実行

Outdata-p-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.820199 (18, 2, 28)

15 (2, 0, 0)
4.89738
3.59733

0.0390646

オプション　-d

d=(10, 5, 1.25), w=(10, 5, 15)で実行

Outdata-d-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.11021 (4, 0, 121)

15 (8, 0, 0)
4.02236
3.45945

0.0142714

オプション　-m

m=1で実行

Outdata-m-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.12463 (4, 0, 62)

15 (8, 0, 0)
4.03214
3.45754

0.020827

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