「mrcImageParticleCandidateExtract」の版間の差分

2013年10月30日 (水) 01:44時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) (ページの作成:「'''mrcImageParticleCandidateExtract'''とは周辺に比べて密度が有意に高いところを見出すEosのコマンドである。 == オプション一...」)		2013年11月20日 (水) 08:06時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) 新しい編集→
行101:		行101:
	===オプション必須項目のみの場合===		===オプション必須項目のみの場合===
		+	====出力ファイルの画像====
	<table>		<table>
	<tr>		<tr>
行118:		行119:
	</tr>		</tr>
	</table>		</table>
		+
		+	====-out のデータ====
		+	<pre>
		+	38.000000 24.000000 0.000000 3.285927
		+	39.000000 24.000000 0.000000 5.289909
		+	40.000000 24.000000 0.000000 6.301086
		+	41.000000 24.000000 0.000000 5.084664
		+	51.000000 24.000000 0.000000 3.458355
		+	52.000000 24.000000 0.000000 3.290684
		+
		+	-中略-
		+
		+	36.000000 58.000000 0.000000 7.257681
		+	37.000000 58.000000 0.000000 6.887584
		+	38.000000 58.000000 0.000000 5.179653
		+	39.000000 58.000000 0.000000 3.826627
		+	35.000000 59.000000 0.000000 3.485140
		+	36.000000 59.000000 0.000000 4.024090
		+	</pre>
	===オプション　-RR===		===オプション　-RR===
行158:		行178:
	</tr>		</tr>
	</table>		</table>
		+
		+	===オプション　-thres===
		+	====thres=1で実行====
		+	=====出力ファイルの画像=====
		+	<table>
		+	<tr>
		+	<td>[[画像:Outdata-thres-mrcImageParticleCandidateExtract.png]]</td>
		+	<td><p align="left">最小<br>
		+	最大<br>
		+	平均値<br>
		+	標準偏差<br>
		+	標準誤差<br></p>
		+	</td>
		+	<td><p align="left">0<br>
		+	255<br>
		+	9.36703<br>
		+	42.704<br>
		+	0.5338<br></p>
		+	</td>
		+	</tr>
		+	</table>
		+
		+	=====-out の出力データ=====
		+	<pre>
		+	47.000000 19.000000 0.000000 1.098040
		+	48.000000 19.000000 0.000000 1.125516
		+	46.000000 20.000000 0.000000 1.035438
		+	47.000000 20.000000 0.000000 1.264296
		+	48.000000 20.000000 0.000000 1.169891
		+	49.000000 20.000000 0.000000 1.004437
		+
		+	-中略-
		+
		+	29.000000 62.000000 0.000000 1.318240
		+	30.000000 62.000000 0.000000 1.408884
		+	31.000000 62.000000 0.000000 1.180901
		+	33.000000 62.000000 0.000000 1.042541
		+	34.000000 62.000000 0.000000 1.174146
		+	35.000000 62.000000 0.000000 1.107767
		+	</pre>

---

2013年11月20日 (水) 08:06時点における版

mrcImageParticleCandidateExtractとは周辺に比べて密度が有意に高いところを見出すEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-RR	選択	入力: [A]	100.0
-RW	選択	入力: [A]	10.0
-thres	選択	入力: IQの閾値	3.0
-out	選択	出力	stdout
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 21.0538 47.6709 0.595886

オプション必須項目のみの場合

出力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 9.36703 42.704 0.5338

-out のデータ

38.000000 24.000000 0.000000 3.285927
39.000000 24.000000 0.000000 5.289909
40.000000 24.000000 0.000000 6.301086
41.000000 24.000000 0.000000 5.084664
51.000000 24.000000 0.000000 3.458355
52.000000 24.000000 0.000000 3.290684

-中略-

36.000000 58.000000 0.000000 7.257681
37.000000 58.000000 0.000000 6.887584
38.000000 58.000000 0.000000 5.179653
39.000000 58.000000 0.000000 3.826627
35.000000 59.000000 0.000000 3.485140
36.000000 59.000000 0.000000 4.024090

オプション　-RR

RR=50で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 7 0.217344 0.741059 0.00926323

オプション　-RW

RW=30で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 6.42328 32.0784 0.40098

オプション　-thres

thres=1で実行

出力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 255 9.36703 42.704 0.5338

-out の出力データ

47.000000 19.000000 0.000000 1.098040
48.000000 19.000000 0.000000 1.125516
46.000000 20.000000 0.000000 1.035438
47.000000 20.000000 0.000000 1.264296
48.000000 20.000000 0.000000 1.169891
49.000000 20.000000 0.000000 1.004437

-中略-

29.000000 62.000000 0.000000 1.318240
30.000000 62.000000 0.000000 1.408884
31.000000 62.000000 0.000000 1.180901
33.000000 62.000000 0.000000 1.042541
34.000000 62.000000 0.000000 1.174146
35.000000 62.000000 0.000000 1.107767