「ctfDeterminationFromPhaseComparison」の版間の差分
提供: Eospedia
| (同じ利用者による、間の10版が非表示) | |||
| 行1: | 行1: | ||
| − | '''ctfDeterminationFromPhaseComparison''' | + | '''ctfDeterminationFromPhaseComparison'''とは位相差を利用した[[CTF]]の推定を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
| 行14: | 行14: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル設定</td> | + | <td>入力ファイル設定: [[mrcImage]](FFT)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行20: | 行20: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>参照ファイル設定</td> | + | <td>参照ファイル設定: [[mrcImage]](FFT)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行32: | 行32: | ||
<td>-kV</td> | <td>-kV</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>[[加速電圧]]: [kV]</td> |
<td>200</td> | <td>200</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行38: | 行38: | ||
<td>-Cs</td> | <td>-Cs</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>[[球面収差係数]]: [mm]</td> |
<td>2.1</td> | <td>2.1</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行44: | 行44: | ||
<td>-df</td> | <td>-df</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>デフォーカス量[A]: (mindf, maxdf, deldf)</td> |
<td>(0.0, 200000, 1000)</td> | <td>(0.0, 200000, 1000)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行50: | 行50: | ||
<td>-AoverP</td> | <td>-AoverP</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>AoverP[A](minAoverP, maxAoverP, delAoverP)</td> | + | <td>AoverP: [A]: (minAoverP, maxAoverP, delAoverP)</td> |
<td>(0.0, 1.0, 0.01)</td> | <td>(0.0, 1.0, 0.01)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行56: | 行56: | ||
<td>-Rmax</td> | <td>-Rmax</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>最大空間周波数: [/A]</td> |
<td>0.1</td> | <td>0.1</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行77: | 行77: | ||
<td> </td> | <td> </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| − | </table> | + | </table> |
| + | 現状、-kV, -Cs, -df, -AbovePには未対応<br> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行89: | 行91: | ||
<td></td> | <td></td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| − | + | </table> | |
| − | + | <br> | |
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
| + | == 実行例 == | ||
| + | ===[[Media:Input-B120-CTF.fft | 入力ファイル]]の画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-B120-CTF.png]]<br> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">( 80, 80, 1)<br> | ||
| + | mrcComplexFloatFT <br> | ||
| + | 0.000514398 (78, 51, 0)<br> | ||
| + | 1684.3 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 9.67542<br> | ||
| + | 65.3969<br> | ||
| + | 0.817461<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| − | == | + | ===[[Media:Input-B120.fft | 参照ファイル]]の画像=== |
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-B120-FFT.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">( 80, 80, 1)<br> | ||
| + | mrcComplexFloatFT <br> | ||
| + | 0.00776821 (75, 37, 0)<br> | ||
| + | 1684.3 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 9.41977<br> | ||
| + | 61.1799<br> | ||
| + | 0.764749<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <div>出力結果</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | bunbo = 27020.787541 bunshi = 8814.005537 | ||
| + | RESULT= 0.326194 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -Rmax=== | ||
| + | ====Rmax=0.5で実行==== | ||
| + | <div>出力結果</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | bunbo = 30553.044231 bunshi = 8684.154471 | ||
| + | RESULT= 0.284232 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
2014年9月30日 (火) 03:05時点における最新版
ctfDeterminationFromPhaseComparisonとは位相差を利用したCTFの推定を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage(FFT) | NULL |
| -r | 必須 | 参照ファイル設定: mrcImage(FFT) | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル設定: ASCII | NULL |
| -kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
| -Cs | 選択 | 球面収差係数: [mm] | 2.1 |
| -df | 選択 | デフォーカス量[A]: (mindf, maxdf, deldf) | (0.0, 200000, 1000) |
| -AoverP | 選択 | AoverP: [A]: (minAoverP, maxAoverP, delAoverP) | (0.0, 1.0, 0.01) |
| -Rmax | 選択 | 最大空間周波数: [/A] | 0.1 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
現状、-kV, -Cs, -df, -AbovePには未対応
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
 | サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |
参照ファイルの画像
 |
サイズ モード |
( 80, 80, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション必須項目のみの場合
出力結果
bunbo = 27020.787541 bunshi = 8814.005537 RESULT= 0.326194
オプション -Rmax
Rmax=0.5で実行
出力結果
bunbo = 30553.044231 bunshi = 8684.154471 RESULT= 0.284232
