「mrc3Dto2D」の版間の差分

2010年11月10日 (水) 07:45時点における版

mrc3Dto2Dとは3D画像から2D画像を生成するEosのコマンドである。ここでいう3D画像と2D画像とは、それぞれ主に参照像、投影像のことを指す。類似構造や結晶構造(PDBファイル)から様々な角度の投影像を取得できる。得られた投影像は、単粒子解析において粒子の角度決定に用いられる。

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル設定	NULL
-o	必須	出力ファイル設定	NULL
-Rot1	選択	最初の回転	0.0 360.0 10
-Rot2	選択	２度目の回転	0.0 360.0 10
-Rot3	選択	最後の回転	0.0 360.0 10
-EulerMode	選択	オイラー角の回転モード設定	ZOYS
-InterpolationMode	選択	展開モード	1
-AreaMode	選択	エリアモード：投影をする全空間の形 0：立方体　1：球	0
-m	選択	モード	0
-h	選択	ヘルプを表示

モード	説明
0	投影像の数はそのまま
1	回転角を減少させる nRot3=1とRot2の軸が2D画像平面に垂直であるなら、投影像の数を減少させることができる

一桁目：	どの軸から回転を始めるか設定
二桁目：	回転軸の順番を設定１
O…Z→Y→Xの順に回転軸を変更する
E…Z→X→Yの順に回転軸を変更する
三桁目：	回転軸の順番の設定２
Y…順番を維持する
N…順番を逆順にする
四桁目：	回転方法を設定
Y…物体そのものをまわす
D…座標を移動させる

pdbInfoでみた入力ファイルの詳細

pdb2mrcで3Dのmrcファイルに変更

XY平面	YZ平面

@@ 行131: / 行131: @@
 	[[画像:121p.png]]
-	●[[pdbInfo]]でみた入力ファイルの詳細
+	[[pdbInfo]]でみた入力ファイルの詳細
 	[[画像:121p-Info.png]]
-	●[[pdb2mrc]]で3Dの[[mrc]]ファイルに変更
+	[[pdb2mrc]]で3Dの[[mrc]]ファイルに変更
 	<table>
 		<tr>