「ctfWeightMapCreation」の版間の差分
提供: Eospedia
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<tr> | <tr> | ||
<td>-dRinv</td> | <td>-dRinv</td> | ||
| − | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>dRinv[A]</td> | <td>dRinv[A]</td> | ||
<td>1024*5/3</td> | <td>1024*5/3</td> | ||
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<tr> | <tr> | ||
<td>-dRmaxInv</td> | <td>-dRmaxInv</td> | ||
| − | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>dRmaxInv[A]</td> | <td>dRmaxInv[A]</td> | ||
<td>10.0</td> | <td>10.0</td> | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=10.0で実行=== | ||
| + | ====他のオプション設定なし==== | ||
| + | <pre> | ||
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| + | -中略- | ||
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| + | ====オプション -kV==== | ||
| + | =====kV=100で実行===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0.000000 1.000000 1.000000 | ||
| + | 0.000977 1.000000 -0.000000 | ||
| + | 0.001953 1.000000 -0.000001 | ||
| + | 0.002930 1.000000 -0.000003 | ||
| + | 0.003906 1.000000 -0.000004 | ||
| + | 0.004883 1.000000 -0.000007 | ||
| + | 0.005859 1.000000 -0.000009 | ||
| + | 0.006836 1.000000 -0.000012 | ||
| + | 0.007812 1.000000 -0.000014 | ||
| + | 0.008789 1.000000 -0.000016 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 0.090820 1.000000 0.089324 | ||
| + | 0.091797 1.000000 0.093274 | ||
| + | 0.092773 1.000000 0.097352 | ||
| + | 0.093750 1.000000 0.101561 | ||
| + | 0.094727 1.000000 0.105902 | ||
| + | 0.095703 1.000000 0.110378 | ||
| + | 0.096680 1.000000 0.114993 | ||
| + | 0.097656 1.000000 0.119748 | ||
| + | 0.098633 1.000000 0.124646 | ||
| + | 0.099609 1.000000 0.129690 | ||
| + | </pre> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ====オプション -Cs==== | ||
| + | =====Cs=で実行===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0.000000 1.000000 1.000000 | ||
| + | 0.000977 1.000000 -0.000000 | ||
| + | 0.001953 1.000000 -0.000001 | ||
| + | 0.002930 1.000000 -0.000002 | ||
| + | 0.003906 1.000000 -0.000003 | ||
| + | 0.004883 1.000000 -0.000005 | ||
| + | 0.005859 1.000000 -0.000007 | ||
| + | 0.006836 1.000000 -0.000009 | ||
| + | 0.007812 1.000000 -0.000011 | ||
| + | 0.008789 1.000000 -0.000013 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 0.090820 1.000000 0.031918 | ||
| + | 0.091797 1.000000 0.033352 | ||
| + | 0.092773 1.000000 0.034832 | ||
| + | 0.093750 1.000000 0.036361 | ||
| + | 0.094727 1.000000 0.037939 | ||
| + | 0.095703 1.000000 0.039567 | ||
| + | 0.096680 1.000000 0.041247 | ||
| + | 0.097656 1.000000 0.042979 | ||
| + | 0.098633 1.000000 0.044765 | ||
| + | 0.099609 1.000000 0.046605 | ||
| + | </pre> | ||
2013年12月9日 (月) 00:50時点における版
ctfWeightMapCreationとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -o | 選択 | 出力ファイル設定 | stdout |
| -kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
| -Cs | 選択 | 球面収差係数: [mm] | 1.7 |
| -df | 必須 | デフォーカス量: [A] (+がアンダーフォーカス) | 2.7 |
| -white | 選択 | 白色ノイズ比(Noise/Signal) | 1.0 |
| -noise | 選択 | Noise Power Spectrum | NULL |
| -splusn | 選択 | Signal+Noise Power Spectrum | NULL |
| -dRinv | 必須 | dRinv[A] | 1024*5/3 |
| -dRmaxInv | 必須 | dRmaxInv[A] | 10.0 |
| -SinWin | 選択 | (RminInv[A], RmaxInv[A]) | (20.0, 10.0) |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | No correction : F = G |
| 1 | Phase contrast : F = G*(H/abs(H))(Only 1 or -1) |
| 2 | Phase contrast : F = G*H (Winer filter (S/N << 1)) |
| 3 | Phase contrast : F = G/H (Inverse filter) |
| 4 | Phase contrast : F = G*(H/(H*H + N*N)) (Winer filter (white noise : Required Option -white)) |
| 5 | Phase contrast : F = G*(H/abs(H)*abs(G*G-N*N)/(G*G)) (Winer filter: Required Option -noise, -splusn)) |
実行例
df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=10.0で実行
他のオプション設定なし
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 1.000000 -0.000000
0.001953 1.000000 -0.000001
0.002930 1.000000 -0.000002
0.003906 1.000000 -0.000003
0.004883 1.000000 -0.000005
0.005859 1.000000 -0.000007
0.006836 1.000000 -0.000009
0.007812 1.000000 -0.000011
0.008789 1.000000 -0.000014
-中略-
0.090820 1.000000 0.026869
0.091797 1.000000 0.028082
0.092773 1.000000 0.029335
0.093750 1.000000 0.030629
0.094727 1.000000 0.031964
0.095703 1.000000 0.033343
0.096680 1.000000 0.034765
0.097656 1.000000 0.036232
0.098633 1.000000 0.037744
0.099609 1.000000 0.039302
オプション -kV
kV=100で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 1.000000 -0.000000
0.001953 1.000000 -0.000001
0.002930 1.000000 -0.000003
0.003906 1.000000 -0.000004
0.004883 1.000000 -0.000007
0.005859 1.000000 -0.000009
0.006836 1.000000 -0.000012
0.007812 1.000000 -0.000014
0.008789 1.000000 -0.000016
-中略-
0.090820 1.000000 0.089324
0.091797 1.000000 0.093274
0.092773 1.000000 0.097352
0.093750 1.000000 0.101561
0.094727 1.000000 0.105902
0.095703 1.000000 0.110378
0.096680 1.000000 0.114993
0.097656 1.000000 0.119748
0.098633 1.000000 0.124646
0.099609 1.000000 0.129690
オプション -Cs
Cs=で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 1.000000 -0.000000
0.001953 1.000000 -0.000001
0.002930 1.000000 -0.000002
0.003906 1.000000 -0.000003
0.004883 1.000000 -0.000005
0.005859 1.000000 -0.000007
0.006836 1.000000 -0.000009
0.007812 1.000000 -0.000011
0.008789 1.000000 -0.000013
-中略-
0.090820 1.000000 0.031918
0.091797 1.000000 0.033352
0.092773 1.000000 0.034832
0.093750 1.000000 0.036361
0.094727 1.000000 0.037939
0.095703 1.000000 0.039567
0.096680 1.000000 0.041247
0.097656 1.000000 0.042979
0.098633 1.000000 0.044765
0.099609 1.000000 0.046605
