「mrcImageDensityNormalizationByImage」の版間の差分
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− | '''mrcImageDensityNormalizationByImage''' | + | '''mrcImageDensityNormalizationByImage'''とは画像ファイルを基準にして密度を標準化する[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>入力ファイル設定</td> | + | <td>入力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
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<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>参照ファイル設定</td> | + | <td>参照ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
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<td>-O</td> | <td>-O</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[ASCII]]</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行38: | 行38: | ||
<td>-D</td> | <td>-D</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>DataList to be used</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行44: | 行44: | ||
<td>-Cylinder</td> | <td>-Cylinder</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>Cylinder Region: (CCenterX, CCenterY, CMinR, CMaxR)</td> |
− | <td> | + | <td>(20, 20, 10, 20)</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-testBG</td> | <td>-testBG</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>SearchRegion: (tstBGMin, tstBGMax, tstBGDelta)</td> |
− | <td> | + | <td>(-3, 3, 0.1)</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
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<tr> | <tr> | ||
<td>1</td> | <td>1</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>Sigma!=1.0</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>2</td> | <td>2</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>Stdout</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>4</td> | <td>4</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>Reversed</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>8</td> | <td>8</td> | ||
− | <td></td> | + | <td>Robust Test</td> |
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2014年7月24日 (木) 00:54時点における最新版
mrcImageDensityNormalizationByImageとは画像ファイルを基準にして密度を標準化するEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | NULL | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage | NULL |
-r | 必須 | 参照ファイル設定: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage | NULL |
-O | 選択 | 出力ファイル設定: ASCII | stdout |
-D | 選択 | DataList to be used | stdout |
-Cylinder | 選択 | Cylinder Region: (CCenterX, CCenterY, CMinR, CMaxR) | (20, 20, 10, 20) |
-testBG | 選択 | SearchRegion: (tstBGMin, tstBGMax, tstBGDelta) | (-3, 3, 0.1) |
-M | 選択 | モード1 | 0 |
-m | 選択 | モード2 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モード1の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 密度フィッティング法:単線 |
1 | 密度フィッティング法: |
モード2の詳細
モード | 説明 |
---|---|
1 | Sigma!=1.0 |
2 | Stdout |
4 | Reversed |
8 | Robust Test |
実行例
------入力ファイルの画像------
![]() |
最小 最大 |
-65.0178 94.4699 |
------参照ファイルの画像------
![]() |
最小 最大 |
-37.8047 57.1575 |
------オプション必須項目のみの場合------
![]() |
最小 最大 |
-32.2771 47.084 |
------オプション -O------
指定したファイル内に以下のようなデータが作成される
------オプション -D------
指定したファイル内に以下のようなデータが作成される
------オプション -Cylinder------
CCenterX=10 CCenterY=10 CMinR=50 CMaxR=10に変更し実行
![]() |
最小 最大 |
-31.6534 47.337 |
------オプション -M------
モード:0
![]() |
最小 最大 |
-32.2771 47.084 |
モード:1
![]() |
最小 最大 |
-31.946 46.8266 |