「pdbMove」の版間の差分
提供: Eospedia
| 行15: | 行15: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル: | + | <td>入力ファイル:[[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行21: | 行21: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td> | + | <td>出力ファイル:[[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行62: | 行62: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| − | |||
=== ヘルプ実行 === | === ヘルプ実行 === | ||
$ pdbMove -h | $ pdbMove -h | ||
| 行75: | 行74: | ||
[-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode | [-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode | ||
----- Additional Usage ----- | ----- Additional Usage ----- | ||
| + | <br> | ||
===------入力ファイルの詳細------=== | ===------入力ファイルの詳細------=== | ||
| − | <div>[[画像:121p.pdb-pdbMove.png]]</div> | + | <div>[[画像:Input-121P-PDB.png]]<br> |
| − | + | <br> | |
| + | [[画像:121p.pdb-pdbMove.png]]</div> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
===------オプション必須項目のみの場合の出力結果------=== | ===------オプション必須項目のみの場合の出力結果------=== | ||
| + | <div>[[画像:Outdata-pdbMove.png]]<br> | ||
| + | <br> | ||
<div>[[画像:121p-pdbMove.png]]<br> | <div>[[画像:121p-pdbMove.png]]<br> | ||
オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない</div> | オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない</div> | ||
| − | + | <br> | |
| + | |||
===------移動させる幅を設定（オプション -x,-y,-z）------=== | ===------移動させる幅を設定（オプション -x,-y,-z）------=== | ||
====移動の幅をすべて1に設定==== | ====移動の幅をすべて1に設定==== | ||
| + | <div>[[画像:Outdata-xyz1-pdbMove.png]]<br> | ||
| + | <br> | ||
[[画像:121p.1xyz-pdbMove.png]]<br> | [[画像:121p.1xyz-pdbMove.png]]<br> | ||
| − | + | <br> | |
| + | |||
====移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定==== | ====移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定==== | ||
| + | <div>[[画像:Outdata-xyz-pdbMove.png]]<br> | ||
| + | <br> | ||
[[画像:121p.-xyz-pdbMove.png]]<br> | [[画像:121p.-xyz-pdbMove.png]]<br> | ||
| + | <br> | ||
2014年1月27日 (月) 06:02時点における版
pdbMoveとはPDBファイルの原子モデルを平行移動するためのEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
ヘルプ実行
$ pdbMove -h
Usage: /Applications/Eos.app/Eos/bin/X86MAC64/pdbMove
Options:
[-i[nput] In (NULL )] :Essential :InputDataFile
[-o[utput] Out (NULL )] :Essential :OutputDataFile
[-x X (0.0 )] :Optional :Move X[A]
[-y Y (0.0 )] :Optional :Move Y[A]
[-z Z (0.0 )] :Optional :Move Z[A]
[-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile
[-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode
Additional Usage -----
------入力ファイルの詳細------
------オプション必須項目のみの場合の出力結果------
オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない
------移動させる幅を設定（オプション -x,-y,-z）------
移動の幅をすべて1に設定
移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定
