「mrcImageRefCreate」の版間の差分

提供: Eospedia
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<div>z=0(ヘッダ)を[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
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-以下略-
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====w=(0, 15, 0)で実行====  
 
====w=(0, 15, 0)で実行====  
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<div>z=0(ヘッダ)を[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
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0 0 0
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1 0 0
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2 0 0
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3 0 5
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4 0 5
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5 0 5
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6 0 0
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7 0 15
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8 0 0
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-以下略-
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===オプション　-d===
 
===オプション　-d===
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<div>z=0(ヘッダ)を[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
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0 0 0
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1 0 0
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2 0 0
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3 0 30
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4 0 5
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5 0 5
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7 0 0
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8 0 0
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10 0 0
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===オプション　-p===
 
===オプション　-p===
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<div>z=0(ヘッダ)を[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
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<pre>
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0 0 30
 +
1 0 0
 +
2 0 0
 +
3 0 5
 +
4 0 5
 +
5 0 5
 +
6 0 30
 +
7 0 0
 +
8 0 0
 +
9 0 0
 +
10 0 0
 +
11 0 0
 +
12 0 0
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13 0 0
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15 0 0
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-以下略-
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===オプション　-x===
 
===オプション　-x===
行213: 行305:
 
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<div>z=0(ヘッダ)を[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
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<pre>
 +
0 0 0
 +
1 0 0
 +
2 0 0
 +
3 0 5
 +
4 0 5
 +
5 0 5
 +
6 0 30
 +
7 0 0
 +
8 0 0
 +
9 0 0
 +
10 0 0
 +
11 0 0
 +
12 0 0
 +
13 0 0
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14 0 0
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15 0 0
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-以下略-
 +
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===オプション　-m===
 
===オプション　-m===
行234: 行349:
 
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<div>z=0(ヘッダ)を[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
 +
<pre>
 +
0 0 0
 +
1 0 0
 +
2 0 0
 +
3 0 5
 +
4 0 5
 +
5 0 5
 +
6 0 0
 +
7 0 15
 +
8 0 0
 +
9 0 0
 +
10 0 0
 +
11 0 0
 +
12 0 0
 +
13 0 0
 +
14 0 0
 +
15 0 0
 +
 +
-以下略-
 +
</pre>
 +
<br>

2014年2月5日 (水) 02:15時点における版

mrcImageRefCreateとは３次元再構成にて使用する参照投影像を作成するEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage(3D) NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage(2Dセット) NULL
-p 選択 中心軸の角度: [degree]: (Phi, Omega, Alpha) (0, 0, 0)
-w 選択 範囲: [±degree]: (Phi, Omega, Alpha) (360, 10, 10)
-d 選択 間隔: [degree]: (Phi, Omega, Alpha) (5, 5, 5)
-x 選択 出力ファイルのx長 入力ファイルのx長
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　
Phi: Z軸周り, Omega: Y軸周り, Alpha: x軸周り

モードの詳細

モード 説明
0 通常
1 分子間距離を変更せずに倍率を変更


実行例

入力ファイルの画像

Input-121P1.png
xy平面

Input1-121P1.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3500.79 (24, 28, 5)
88.3104
323.414

0.914753


オプション　-w

w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-618.193 (35, 39, 6)

37724 (22, 29, 11)
4099.57
5776.94

30.879


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


w=(0, 15, 0)で実行

Outdata1-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-847.927 (14, 27, 4)

33249 (13, 17, 5)
5834.45
6371.51

59.158


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 15 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション　-d

d=(30, 5, 5), w=(180, 0, 0)で実行

Outdata-d-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-581.161 (19, 13, 3)

36079.7 (23, 28, 5)
4099.7
5771.83

30.8517


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 30 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 180 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション　-p

p=(30, 0, 0), w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-p-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-586.437 (45, 25, 4)

42135.5 (31, 26, 12)
4099.79
5869.56

31.3741


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 30 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション　-x

x=30, w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-x-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-618.193 (25, 39, 6)

37724 (12, 29, 11)
6170.05
6385.51

44.0642


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション　-m

m=1, w=(0, 15, 0)で実行

Outdata-m-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-3757.87 (20, 0, 7)

32675.7 (13, 17, 5)
5959.8
6481.03

60.1748


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 15 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-



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