mrcImageSolventFlattening
提供: Eospedia
mrcImageSolventFlatteningとは溶液と考えられる部分の平滑化を行うEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -rmax | 選択 | rmax [A] | 190 |
| -sd | 選択 | Assign voxels below MeanOfSolvent+Range*SDofSolvent as Solvent | 0 |
| -density | 選択 | embed mean lower than density value | 0 |
| -Floating | 選択 | data minus mean of Solvent | |
| -oparam | 選択 | 出力: パラメータ | stdout |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-SD range : assign the voxels whose density is less than maen + range*SD as solvent range
-density is stronger than -m
-density is stronger than -m
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | mean of all density |
| 1 | mean of sphere surface density at rmax |
| 2 | mean of cylinder surface density at rmax |
| 6 | mean of 2D Edge X=0 or N.x-1 |
