mrcImageRefCreate

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2013年12月24日 (火) 05:31時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

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mrcImageRefCreateとは3次元再構成にて使用する参照投影像を作成するEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-p 選択 中心軸の角度: [degree]: (Phi, Omega, Alpha) (0, 0, 0)
-w 選択 範囲: [±degree]: (Phi, Omega, Alpha) (360, 10, 10)
-d 選択 間隔: [degree]: (Phi, Omega, Alpha) (5, 5, 5)
-x 選択 出力ファイルのx長 入力ファイルのx長
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
Phi: Z軸周り, Omega: Y軸周り, Alpha: x軸周り

モードの詳細

モード 説明
0 通常
1 分子間距離を変更せずに倍率を変更


実行例

入力ファイルの画像

Input-121P1.png
xy平面

Input1-121P1.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3500.79 (24, 28, 5)
88.3104
323.414

0.914753


オプション -w

w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-618.193 (35, 39, 6)

37724 (22, 29, 11)
4099.57
5776.94

30.879


オプション -d

d=(10, 5, 15), w=(10, 5, 15)で実行

Outdata-d-mrcImageRefCreate.png
xy平面

Outdata1-d-mrcImageRefCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.28686 (30, 27, 1)

15 (5, 0, 0)
0.115617
0.574386

0.00136759


オプション -p

p=(15, 15, 15), d=(10, 5, 15), w=(10, 5, 15)で実行

Outdata-p-mrcImageRefCreate.png
xy平面

Outdata1-p-mrcImageRefCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.03856 (34, 15, 4)

15 (0, 0, 0)
0.155363
0.69747

0.00336977


オプション -m

m=1, d=(10, 5, 15), w=(10, 5, 15)で実行

Outdata-m-mrcImageRefCreate.png
xy平面

Outdata1-m-mrcImageRefCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.68157 (17, 8, 27)

15 (5, 0, 0)
0.116388
0.576202

0.00137191