llExtractCtrlFileCreate
提供: Eospedia
llExtractCtrlFileCreateとはmrcImage(FFT)をLLに変換する際に必要なコンフィグファイルを作成するEosのコマンドである。出力ファイルはllExtract(-c)にて使用することが出来る。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: [テキスト] | stdout |
| -t | 選択 | Turn | -6 |
| -u | 選択 | Unit | 13 |
| -N | 選択 | N-strand | 1 |
| -Y1 | 選択 | Y1 [pixel]: The Position of LayerLine which l = |t| i.e., |n|=1&&m=0 for the first time |
36 |
| -Y0 | 選択 | Y0 [pixel]: The Position of LayerLine which n = 0 , l != 0 for the first time |
78 |
| -rmax | 選択 | rmax[A] | 250 |
| -Rmax | 選択 | Rmax[/A] | 0.1 |
| -lx | 選択 | ピクセルサイズ x | 5.0 |
| -ly | 選択 | ピクセルサイズ y | 5.0 |
| -nx | 選択 | Image Size x [Pixel] | 1000.0 |
| -ny | 選択 | Image Size y [Pixel] | 1000.0 |
| -center | 選択 | nxの中心(フィラメントの中心)[Pixel] | 500.0 |
| -layerline | 選択 | Number of Layer Line | 21.0 |
| -Ax | 選択 | nxの長さ(lx * nx): [A] | 5000.0 |
| -dY | 選択 | Range of Layer Line[pixel] | 12.0 |
| -truePitch | 選択 | True Pitch | 430 |
| -PixelSize | 選択 | ピクセルサイズ: [A] | 5 |
| -deltadY | 選択 | A range of deltadY to determine dY.[pixel] | 0.5 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | ミオシン: t=1, u=9 |
| 1 | それ以外 |
