mrcImagepdbFileReduce

mrcImagepdbFileReduceとはPDBから期待される密度を減算するEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-p	必須	入力ファイル: PDB	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-t	必須	閾値	0
-r	選択	原子半径	1
-v	選択	PDBファイルのピクセル値	0
-IT	選択	Threshold for interface recognition	0
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

-iのファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 21001.7 (30, 26, 27) 213.171 1416 2.67599

-pのファイルの詳細

重心 最大半径 最大半径(座標)

6.727136e+01 3.631518e+01 -2.983928e+01 5.314867e+01 40.92 41.49 48.47

オプション必須項目のみの場合

t=10000で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 21001.7 (30, 26, 27) 102.239 1187.54 2.24424

以降、t=10000

オプション　-r

r=70で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 20982.9 (33, 29, 34) 72.6667 1003.8 1.897

オプション　-v

v=10000で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

10000 (0, 0, 0) 21001.7 (30, 26, 27) 10026.6 362.839 0.685702