コマンド
提供: Eospedia
コマンドとはEosにおいて計算機への命令を実行するもの。Eosは基本的にキャラクタユーザインタフェース(CUI)によって操作する。
コマンドの使用例
EosのコマンドはCUIへの標準入力(キーボードからの入力)で使用する。
Display2 -i MicroscopeImage.roi
上記のDisplay2コマンドは、mrcやroiイメージなどを表示する機能を持つ。
他にも粒子の切り出しなどを行うことができる。
Eosのコマンドはオプションに-hをつけるとその場でオプションヘルプを確認することが可能である。
Display2 -h
以下はDisplay2のヘルプの表示例である。
Usage: /home/people/keita1023/Eos/bin/X86LINUX64/Display2 Options: [-i[nput] In (NULL )] :Optional :InputDataFile [-t[epmlate] Template (85.roi )] :Optional :Template for InputFile [-H[ighForThres] ThresHigh (0.0 )] :Optional :Template for InputFile [-L[owForThres] ThresLow (0.0 )] :Optional :Template for InputFile [-Zoom Zoom (1.0 )] :Optional :Zoom for InputFile [-Inverse ] :Optional :Inverse (HighValue(dark)<->LowValue(bright)) for InputFile [-o[utput] Out (.EosLog )] :Optional :OutputLogFile [-display geometry (:0.0 )] :Optional :OutputLogFile [-geometry display (1024x1024+0+0)] :Optional :OutputLogFile [-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile [-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode New wish commands of Display2 mrcInfoSet [z|min|max] value mrcInfoSet [log|pow] mrcInfoGet [Nx|Ny|Nz|Max|Min|Mean|Hist]
Linuxにおけるコマンド
最近はWindowsチックなLinuxとしてUbuntuが急速に普及しているが、まだまだLinuxはCUIに免疫が無い者にとって手が出しにくいOSである。 以下に最低限Eosの使用に必要であるであろうコマンドを並べるが、書籍や専門サイトを参照することを推奨する。
ls
現在開いているディレクトリに含まれるファイルやディレクトリを表示するコマンド。
ls a.txt b.txt