「mrc3Dto2D」の版間の差分

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'''mrc3Dto2D'''とは[[3D画像]]から[[2D画像]]を生成する[[Eos]]の[[コマンド]]である。ここでいう[[3D画像]]と[[2D画像]]とは、それぞれ主に[[参照像]]、[[投影像]]のことを指す。類似構造や結晶構造(PDBファイル)から様々な[[角度]]の[[投影像]]を取得できる。得られた[[投影像]]は、[[単粒子解析]]において[[粒子]]の[[角度]]決めに用いられる。
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'''mrc3Dto2D'''とは[[3D画像]]から[[2D画像]]を生成する[[Eos]]の[[コマンド]]である。ここでいう[[3D画像]]と[[2D画像]]とは、それぞれ主に[[参照像]]、[[投影像]]のことを指す。類似構造や結晶構造(PDBファイル)から様々な[[角度]]の[[投影像]]を取得できる。得られた[[投影像]]は、[[単粒子解析]]において[[粒子]]の[[角度]]決定に用いられる。
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== オプション一覧 ==
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===メインオプション==
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<th>オプション</th>
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<th>デフォルト</th>
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<td>-i</td>
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<td>必須</td>
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<td>入力ファイル設定</td>
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<td>-o</td>
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<td>必須</td>
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<td>出力ファイル設定</td>
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<td>-Rot1</td>
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<td>選択</td>
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<td>最初の回転</td>
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<td>0.0 360.0 10</td>
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<td>-Rot2</td>
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<td>選択</td>
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<td>2度目の回転</td>
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<td>0.0 360.0 10</td>
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<td>-Rot3</td>
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<td>選択</td>
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<td>最後の回転</td>
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<td>0.0 360.0 10</td>
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<td>-EulerMode</td>
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<td>選択</td>
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<td>オイラー角の回転モード設定</td>
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<td>ZOYS</td>
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<td>-InterpolationMode</td>
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<td>選択</td>
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<td>展開モード</td>
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<td>-AreaMode</td>
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<td>選択</td>
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<td>エリアモード:投影をする全空間の形<br>
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0:立方体 1:球</td>
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<td>0</td>
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<td>-m</td>
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<td>選択</td>
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<td>モード</td>
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<td>-h</td>
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<td>選択</td>
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<td>ヘルプを表示</td>
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<td> </td>
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===モードの詳細===
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<th>モード</th>
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<th>説明</th>
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<td>投影像の数はそのまま</td>
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<td>1</td>
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<td>回転角を減少させる<br>
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nRot3=1とRot2の軸が2D画像平面に垂直であるなら、投影像の数を減少させることができる</td>
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===-InterpolationModeの詳細===
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<th>モード</th>
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<th>説明</th>
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<td>0</td>
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<td>最短距離法</td>
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<td>1</td>
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<td>線形補間法</td>
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<td>2</td>
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<td>3次補間法</td>
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<td>3</td>
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<td>多項式法</td>
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2010年11月10日 (水) 07:36時点における版

mrc3Dto2Dとは3D画像から2D画像を生成するEosコマンドである。ここでいう3D画像2D画像とは、それぞれ主に参照像投影像のことを指す。類似構造や結晶構造(PDBファイル)から様々な角度投影像を取得できる。得られた投影像は、単粒子解析において粒子角度決定に用いられる。

オプション一覧

=メインオプション

</table>

モードの詳細

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定 NULL
-o 必須 出力ファイル設定 NULL
-Rot1 選択 最初の回転 0.0 360.0 10
-Rot2 選択 2度目の回転 0.0 360.0 10
-Rot3 選択 最後の回転 0.0 360.0 10
-EulerMode 選択 オイラー角の回転モード設定 ZOYS
-InterpolationMode 選択 展開モード 1
-AreaMode 選択 エリアモード:投影をする全空間の形
0:立方体 1:球
0
-m 選択 モード 0
-h 選択 ヘルプを表示  
</table>

-InterpolationModeの詳細

モード 説明
0 投影像の数はそのまま
1 回転角を減少させる
nRot3=1とRot2の軸が2D画像平面に垂直であるなら、投影像の数を減少させることができる
モード 説明
0 最短距離法
1 線形補間法
2 3次補間法
3 多項式法