mrc3Dto2D
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mrc3Dto2Dとは3D画像から2D画像を生成するEosのコマンドである。ここでいう3D画像と2D画像とは、それぞれ主に参照像、投影像のことを指す。類似構造や結晶構造(PDBファイル)から様々な角度の投影像を取得できる。得られた投影像は、単粒子解析において粒子の角度決定に用いられる。
オプション一覧
=メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定 | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定 | NULL |
-Rot1 | 選択 | 最初の回転 | 0.0 360.0 10 |
-Rot2 | 選択 | 2度目の回転 | 0.0 360.0 10 |
-Rot3 | 選択 | 最後の回転 | 0.0 360.0 10 |
-EulerMode | 選択 | オイラー角の回転モード設定 | ZOYS |
-InterpolationMode | 選択 | 展開モード | 1 |
-AreaMode | 選択 | エリアモード:投影をする全空間の形 0:立方体 1:球 |
0 |
-m | 選択 | モード | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モード | 説明 |
---|---|
0 | 投影像の数はそのまま |
1 | 回転角を減少させる nRot3=1とRot2の軸が2D画像平面に垂直であるなら、投影像の数を減少させることができる |
モード | 説明 |
---|---|
0 | 最短距離法 |
1 | 線形補間法 |
2 | 3次補間法 |
3 | 多項式法 |