mrcImageDensityNormalizationByImage

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mrcImageDensityNormalizationByImageとは画像ファイルを基準にして密度を標準化するEosコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 NULL デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage NULL
-r 必須 参照ファイル設定: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage NULL
-O 選択 出力ファイル設定: ASCII stdout
-D 選択 DataList to be used stdout
-Cylinder 選択 Cylinder Region: (CCenterX, CCenterY, CMinR, CMaxR) (20, 20, 10, 20)
-testBG 選択 SearchRegion: (tstBGMin, tstBGMax, tstBGDelta) (-3, 3, 0.1)
-M 選択 モード1 0
-m 選択 モード2 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モード1の詳細

モード 説明
0 密度フィッティング法:単線
1 密度フィッティング法:

モード2の詳細

モード 説明
1 Sigma!=1.0
2 Stdout
4 Reversed
8 Robust Test


実行例

------入力ファイルの画像------

B120-2.center-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-65.0178

94.4699
4.85274
20.4635

0.255794

------参照ファイルの画像------

B120-2.center3-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-37.8047

57.1575
2.49049
11.3587

0.141984

------オプション必須項目のみの場合------

Outdata-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-32.2771

47.084
2.49049
10.1827

0.127283

------オプション -O------

指定したファイル内に以下のようなデータが作成される

Outdata-1-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

------オプション -D------

指定したファイル内に以下のようなデータが作成される

Outdata-D-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

------オプション -Cylinder------

CCenterX=10 CCenterY=10 CMinR=50 CMaxR=10に変更し実行

Outdata-Cylinder-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-31.6534

47.337
2.95179
10.1351

0.126689

------オプション -M------

モード:0

Outdata-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-32.2771

47.084
2.49049
10.1827

0.127283

モード:1

Outdata-M1-mrcImageDensityNormalizationByImage.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-31.946

46.8266
2.56378
10.1071

0.126339