mrcImageSmoothing

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2013年10月16日 (水) 05:39時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

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mrcImageSmoothingとはMRC形式の画像を非線形平滑化するためのEosコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル名[MRC] NULL
-o 選択 出力ファイル名[MRC] stdout(設定しなければ標準出力)

モードの詳細

モード 説明
1 Median filter
2 Mean filter
3 Surface Fit filter
4 Lee-Sigma filter


実行例

-h によるヘルプの例

$ mrcImageSmoothing  -h
Usage: /home/people/tacyas/Eos/bin/X86LINUX64/mrcImageSmoothing
Options:
    [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFile
    [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputDataFile
    [-sx                 sx                  (3         )] :Optional  :x of Kernel Size
    [-sy                 sy                  (3         )] :Optional  :y of Kernel Size
    [-sz                 sz                  (3         )] :Optional  :z of Kernel Size
    [-r                  r                   (1         )] :Optional  :Radius of Kernel Size
    [-sigma              sigma               (2.0       )] :Optional  :Sigma for Lee-Sigma
    [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
    [-M[ode2]            mode2               (0         )] :Optional  :Mode
    [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
>>> Mode <<<< 
    1: Median filter
    2: Mean filter 
    3: Surface Fit filter
    4: Lee-Sigma filter
>>> Mode2 <<<< 
    0: Kernel is cube. : required argumnent: -sx, -sy, [-sz]
    1: Kernel is sphere.(Only mode 1 supported) : required argumnent: -r


------入力ファイルの画像------

ファイル:b120.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-65.0178

94.4699
4.85274
20.4635

0.255794

------モード1の1~3での処理画像------

モード1:1
ファイル:smo.m1.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-41.8721

65.9659
4.7617
14.3083

0.178854

モード2:0を選択

-sx=9,-sy=9に変更

  ------>
ファイル:smo.m1M0x9y9.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-54.6403

54.0815
4.773
13.5848

0.16981

モード2:1を選択

-r=5に変更

  ------>
ファイル:smo.m1M1r5.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-54.6403

55.7056
4.73966
13.9823

0.174779

モード1:2
ファイル:smo.m2.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-41.8721

67.5276
4.82079
13.8056

0.17257

モード2:0を選択

-sx=9,-sy=9に変更

  ------>
smo.m2M0x9y9.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-54.6403

54.0644
4.89358
13.5214

0.169018

モード1:3
smo.m3.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-41.8721

83.4967
4.85411
17.5032

0.21879

モード2:0を選択

-sx=9,-sy=9に変更

  ------>
smo.m3M0x9y9.center-mrcImageSmoothing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-54.6403

56.99
4.87303
14.4517

0.180646


※モード1はデフォルト=0になっているが、モード1の選択肢に
0は無いので、指定しなければエラーとなる。