「mrcImageSolventFlattening」の版間の差分
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2013年12月10日 (火) 02:09時点における版
mrcImageSolventFlatteningとは溶液と考えられる部分の平滑化を行うEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-rmax | 選択 | rmax [A] | 190 |
-sd | 選択 | Assign voxels below MeanOfSolvent+Range*SDofSolvent as Solvent | 0 |
-density | 選択 | embed mean lower than density value | 0 |
-Floating | 選択 | data minus mean of Solvent | |
-oparam | 選択 | 出力: パラメータ | stdout |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-SD range : assign the voxels whose density is less than maen + range*SD as solvent range
-density is stronger than -m
-density is stronger than -m
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | mean of all density |
1 | mean of sphere surface density at rmax |
2 | mean of cylinder surface density at rmax |
6 | mean of 2D Edge X=0 or N.x-1 |