mrcImageSymmetryFind
提供: Eospedia
mrcImageSymmetryFindとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-O | 選択 | 出力: [Symmetry Infomation] | stdout |
-A | 選択 | 出力: [Average] | NULL |
-centreMode | 選択 | centreMode | 1 |
-t1 | 選択 | Threshold of CheckByAdd | 1.8 |
-t2 | 選択 | Threshold in deciding the symmetry number | 0.9 |
-m1 | 選択 | Mode of Check | 3 |
-m2 | 選択 | Mode of Substruction | 2 |
-dr | 選択 | Delta r of outputfile. | 1 |
-dtheta | 選択 | Delta theta of outputfile. [degree] | 1 |
-n | 選択 | Check to the number | 10 |
-nRange | 選択 | Checkto the number: (nmin, nmax) | (2, 10) |
-In | 選択 | 入力ファイル: (Image, Back) | (NULL, NULL) |
-rangex | 選択 | 入力: (minx, maxx, delx) | (-3, 3, 1) |
-rangey | 選択 | 入力: (miny, maxy, dely) | (-3, 3, 1) |
-rangez | 選択 | 入力: (minz, maxz, delz) | (0, 0, 1) |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-centreMode の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | Centre is GC (gravity of centre) |
1 | Centre is Rotational Symmetry |
-m1 の詳細
モード | 説明 |
---|---|
1 | Check by Add |
2 | Check by Correlation |
4 | Check by Fourier |
8 | Check by TTest |
16 | Check by SRP |
-m2 の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | No Subtraction |
1 | Mean Subtraction |
2 | Min Subtraction |