「mrcSinogramFETcalcSDforNormalize」の版間の差分

2014年3月12日 (水) 06:16時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) ←古い編集		2014年3月12日 (水) 06:20時点における版 (ソースを閲覧) Kinoshita (トーク | 投稿記録) 新しい編集→
行32:		行32:
	<td>-o</td>		<td>-o</td>
	<td>選択</td>		<td>選択</td>
−	<td>出力ファイル設定(SD)</td>	+	<td>出力ファイル: [[mrcImage]](SD)</td>
	<td>NULL</td>		<td>NULL</td>
	</tr>		</tr>
行38:		行38:
	<td>-ow</td>		<td>-ow</td>
	<td>選択</td>		<td>選択</td>
−	<td>出力ファイル設定(Weight)</td>	+	<td>出力ファイル: [[mrcImage]](Weight)</td>
	<td></td>		<td></td>
	</tr>		</tr>
行60:		行60:
	</tr>		</tr>
	</table>		</table>
		+	<br>
	===モードの詳細===		===モードの詳細===
行82:		行83:
	</tr>		</tr>
	</table>		</table>
		+	<br>
	===-s の詳細===		===-s の詳細===
行102:		行104:
	</tr>		</tr>
	</table>		</table>
−		+	<br>
	== 実行例 ==		== 実行例 ==

---

2014年3月12日 (水) 06:20時点における版

mrcSinogramFETcalcSDforNormalizeとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	選択	入力ファイル: mrcImage(FET)	NULL
-s	選択	selectFETfile	1
-l	必須	SDlibraryFile: mrcImage	NULL
-o	選択	出力ファイル: mrcImage(SD)	NULL
-ow	選択	出力ファイル: mrcImage(Weight)
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	SDfile writeout from liblary file Library(option -l) is Essential weightfile writeout from liblary file when mode 0
1	to overwrite data library Essential options are: -sm, -i, -l if you want to make new data library, you have to make 2Dmrc-format pre-library file using tool "array2mrc" Array: x=(number of feature + 1), y=6, z=0, data: all 0.0

-s の詳細

モード	説明
0	noise-free refarence FETdata
1	no-smoothing FET data
それ以外	smoothed FET data

実行例

入力ファイルのデータ

      0.0528259        0.287465         2.43992 
      0.0530244        0.293207         2.43615 
      0.0531626        0.296749          2.4324 
      0.0536801        0.289733         2.40744 
      0.0538179        0.298354         2.41023 
      0.0545124        0.322229         2.39943 
      0.0546532        0.328165         2.39395 
       0.054684        0.334097         2.39568 
      0.0545885        0.333984         2.39575 
      0.0543876         0.33627         2.40106 

-中略-

      0.0518319       -0.232946         2.44283 
      0.0522862       -0.247554         2.43665 
      0.0525356       -0.256483         2.43349 
      0.0525809        -0.26767         2.43681 
      0.0527164       -0.282587         2.43866 
      0.0528259       -0.287465         2.43992 
      0.0530244       -0.293207         2.43615 
      0.0531626       -0.296749          2.4324 
      0.0536801       -0.289733         2.40744 
      0.0538179       -0.298354         2.41023 

-中略-

      0.0502116        0.210372         2.45587 
      0.0505199        0.218583         2.45832 
      0.0508604        0.223915         2.45576 
      0.0510345        0.229516         2.45911 
      0.0512054         0.23358         2.46195 
      0.0518319        0.232946         2.44283 
      0.0522862        0.247554         2.43665 
      0.0525356        0.256483         2.43349 
      0.0525809         0.26767         2.43681 
      0.0527164        0.282587         2.43866 

        28299.7         7382.14         20943.9 
        20706.4         10440.1         15260.5 

オプション必須項目のみの場合

        7382.14         20943.9 

              0         9.09091