WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram

WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-In1	選択	入力ファイルリスト1: ASCII(正規相関)	NULL
-In2	選択	入力ファイルリスト2: ASCII(1次元微分相関)	NULL
-In3	選択	入力ファイルリスト3: ASCII(2次元微分相関)	NULL
-In4	選択	入力ファイルリスト4: ASCII(相関長)	NULL
-o	必須	出力ファイル: ASCII	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-M	選択	使用する相関ファイルの組み合わせ	15
-v	選択	variance of Gaussian weight function	5
-h	選択	ヘルプを表示

-mの詳細

モード	説明
0	get memory of mrcImage
1	don't get memory of mrcImage

-M の詳細

モード	説明
+1	-In1 を使用
+2	-In2 を使用
+4	-In3 を使用
+8	-In4 を使用
15	全ての入力ファイルを使用

2つ以上のモードを組み合わせて使用する

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

相関ファイル  mrcファイル1  mrcファイル2  Rot1  Rot2  Mode
         .                       .                     .             .        .         .
         .                       .                     .             .        .         .

相関ファイルはリストと同じディレクトリにあることを想定している

ファイル構成についてはmrcImagesSinogramCorrelationを参照

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.925733 (174, 223, 0)

0.986152 (271, 281, 0)
0.203463
0.411921

0.00114423

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.969656 (10, 168, 0)

0.96977 (10, 357, 0)
0.199734
0.487223

0.0013534

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.79716 (206, 183, 0)

0.986575 (190, 120, 0)
0.251101
0.368028

0.0010223

-i2 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.999642 (131, 329, 0)

0.921779 (132, 73, 0)
0.0604004
0.241042

0.00066956

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.995358 (132, 121, 0)

0.991247 (133, 4, 0)
0.0859721
0.247723

0.000688118

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.98175 (356, 217, 0)

0.97865 (0, 217, 0)
0.0731451
0.245175

0.000681042

-i3 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (285, 75, 0)

1 (285, 61, 0)
nan
nan

nan

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (158, 33, 0)

1 (158, 30, 0)
0.0945901
0.227151

0.000630976

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.970911 (132, 30, 0)

1 (135, 30, 0)
0.104829
0.220026

0.000611183

-i4 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.778626 (27, 38, 0)

1 (27, 0, 0)
0.946219
0.047809

0.000132803

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (27, 191, 0)

1 (0, 0, 0)
0.93032
0.0611702

0.000169917

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (0, 191, 0)

1 (67, 0, 0)
0.93353
0.0580325

0.000161201

オプション必須項目のみの場合

出力結果

Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
weight calculation start

deltaweight = 1.414214
FinalCorrelationMin = 10.000000 
weight[0][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

deltaweight = 1.189207
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

deltaweight = 1.090508
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

-中略-

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 3.000000 
weight[0][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[1][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[2][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000
weight[3][0.000000, 0.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.000000

-o のデータ

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000
Weight of I4 is 0.000000

オプション　-M

M=3で実行

他のオプション設定なし

Weight of I1 is 0.771105
Weight of I2 is 3.459215

v=1で実行

Weight of I1 is 0.840896
Weight of I2 is 3.772301

m=1で実行

出力結果

Input data get end : CommonLinePositionData
Input data get end : CommonLinePositionData
weight calculation start

deltaweight = 1.414214
FinalCorrelationMin = 2.628996 
weight[0][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 1.414214
weight[1][1.414214, 8.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 7.071068

deltaweight = 1.189207
FinalCorrelationMin = 2.616069 
weight[0][1.000000, 2.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 1.000000
weight[1][5.000000, 10.000000] >>>> weightMinOfCorrelation = 9.756828

deltaweight = 1.090508
FinalCorrelationMin = 2.612862 
weight[0][0.840896, 1.189207] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.840896
weight[1][8.204482, 11.602890] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.476005

-中略-

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 2.612196 
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 2.612196 
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817

deltaweight = 1.000000
FinalCorrelationMin = 2.612196 
weight[0][0.771105, 0.771105] >>>> weightMinOfCorrelation = 0.771105
weight[1][11.567817, 11.567817] >>>> weightMinOfCorrelation = 11.567817

-o のデータ

Weight of I1 is 0.771105
Weight of I2 is 11.567817

M=5で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000

M=6で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000

M=7で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000

M=9で実行

Weight of I1 is 0.840327
Weight of I2 is 3.769748

M=10で実行

Weight of I1 is 0.840327
Weight of I2 is 3.769748

M=11で実行

Weight of I1 is 0.766941
Weight of I2 is 0.766941
Weight of I3 is 11.505344

M=12で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000

M=13で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000

M=14で実行

Weight of I1 is 0.766941
Weight of I2 is 0.766941
Weight of I3 is 11.505344

WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram

目次

オプション一覧

メインオプション

-mの詳細

-M の詳細

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

-i2 のデータ

-i3 のデータ

-i4 のデータ

オプション必須項目のみの場合

オプション　-M

M=3で実行

他のオプション設定なし

v=1で実行

m=1で実行

M=5で実行

M=6で実行

M=7で実行

M=9で実行

M=10で実行

M=11で実行

M=12で実行

M=13で実行

M=14で実行

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WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram

目次

オプション一覧

メインオプション

-mの詳細

-M の詳細

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

-i2 のデータ

-i3 のデータ

-i4 のデータ

オプション必須項目のみの場合

オプション -M

M=3で実行

他のオプション設定なし

v=1で実行

m=1で実行

M=5で実行

M=6で実行

M=7で実行

M=9で実行

M=10で実行

M=11で実行

M=12で実行

M=13で実行

M=14で実行

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オプション　-M