mrcImageAbnormalValueRemove

mrcImageAbnormalValueRemoveとは電子顕微鏡画像の中の異常値を取り除くEosのコマンドである。電子顕微鏡画像の異常値は、CCDカメラの素子の個人差、結晶化した氷などが由来であることが多い。これにより、CTF補正などの画像処理への悪影響を低減することができる。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	NULL	デフォルト
-i	必須	入力ファイル設定	NULL
-o	必須	出力ファイル設定	NULL
-v	選択		3.0
-u	選択		UnsignedMax(65535) UnsignedHalf(16384)
-m	選択	モード	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	ランダム値
1	近似値
2	Random Value using SD and mean within Normal Area
3	Mean Value using SD and mean within Normal Area

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-65.0178 94.4699 4.85274 20.4635 0.255794

必須項目のオプションのみの場合

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-56.108 66.0024 4.49193 19.7521 0.246901

オプション　-v

v=1で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-62.7258 74.644 4.1715 14.3336 0.17917

v=5で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-65.0178 94.4699 4.85274 20.4635 0.255794

オプション　-mode

mode=0で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-56.108 66.0024 4.49193 19.7521 0.246901

mode=1で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-56.108 66.0024 4.6678 19.8468 0.248085