mrcImageCTFCompensationForTiltImage
提供: Eospedia
mrcImageCTFCompensationForTiltImageとは傾斜画像に関するCTF補正を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル(ファイルサイズのみ使用)設定: mrcImage | NULL |
-I | 必須 | ROI情報の設定: ASCII | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage(CTF) | NULL |
-cut | 選択 | 補正しない範囲(中心からのピクセル数) | 6 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
-I のフォーマット
ROI情報のフォーマットについてはmrcImageROIs参照
実行例
入力ファイルのデータ
-i の画像
![]() |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 255 (49, 32, 0) |
-iのファイルはファイルサイズのためだけに使用されます。
-I のデータ
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0000.roi Rect 6 6 26 6 26 26 6 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0001.roi Rect 20 6 40 6 40 26 20 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0002.roi Rect 40 6 60 6 60 26 40 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0003.roi Rect 54 6 74 6 74 26 54 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0004.roi Rect 6 20 26 20 26 40 6 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0005.roi Rect 20 20 40 20 40 40 20 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0006.roi Rect 40 20 60 20 60 40 40 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0007.roi Rect 54 20 74 20 74 40 54 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0008.roi Rect 6 40 26 40 26 60 6 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0009.roi Rect 20 40 40 40 40 60 20 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0010.roi Rect 40 40 60 40 60 60 40 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0011.roi Rect 54 40 74 40 74 60 54 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0012.roi Rect 6 54 26 54 26 74 6 74 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0013.roi Rect 20 54 40 54 40 74 20 74 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0014.roi Rect 40 54 60 54 60 74 40 74 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0015.roi Rect 54 54 74 54 74 74 54 74
使用するROIファイル: 入力ファイル
オプション必須項目のみの場合
![]() |
最小 最大 |
1 (7, 7, 0) 255 (22, 7, 0) |
オプション -cut
cut=20で実行
![]() |
最小 最大 |
0.01 (7, 7, 0) 255 (25, 20, 0) |