「mrcImageCTFCompensationForTiltImage」の版間の差分
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| − | '''mrcImageCTFCompensationForTiltImage''' | + | '''mrcImageCTFCompensationForTiltImage'''とは傾斜画像に関する[[CTF補正]]を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td> | + | <td>入力ファイル(ファイルサイズのみ使用)設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-I</td> | <td>-I</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td> | + | <td>ROI情報の設定: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](CTF)</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]([[CTF]])</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-cut</td> | <td>-cut</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>補正しない範囲(中心からのピクセル数)</td> |
<td>6</td> | <td>6</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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</table> | </table> | ||
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| + | ===-I のフォーマット=== | ||
| + | <div>ROI情報のフォーマットについては[[mrcImageROIs]]参照</div> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===入力ファイルのデータ=== | ||
| + | ====-i の画像==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-mrcImageCTFCompensationForTiltImage.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 255 (49, 32, 0)<br> | ||
| + | 21.0538<br> | ||
| + | 47.6709<br> | ||
| + | 0.595886<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | -iのファイルはファイルサイズのためだけに使用されます。<br> | ||
| + | <br> | ||
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| + | ====-I のデータ==== | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0000.roi Rect 6 6 26 6 26 26 6 26 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0001.roi Rect 20 6 40 6 40 26 20 26 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0002.roi Rect 40 6 60 6 60 26 40 26 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0003.roi Rect 54 6 74 6 74 26 54 26 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0004.roi Rect 6 20 26 20 26 40 6 40 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0005.roi Rect 20 20 40 20 40 40 20 40 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0006.roi Rect 40 20 60 20 60 40 40 40 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0007.roi Rect 54 20 74 20 74 40 54 40 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0008.roi Rect 6 40 26 40 26 60 6 60 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0009.roi Rect 20 40 40 40 40 60 20 60 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0010.roi Rect 40 40 60 40 60 60 40 60 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0011.roi Rect 54 40 74 40 74 60 54 60 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0012.roi Rect 6 54 26 54 26 74 6 74 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0013.roi Rect 20 54 40 54 40 74 20 74 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0014.roi Rect 40 54 60 54 60 74 40 74 | ||
| + | /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0015.roi Rect 54 54 74 54 74 74 54 74 | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | |||
| + | 使用するROIファイル: [[Media:Input-ROISet0.zip | 入力ファイル]] | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-mrcImageCTFCompensationForTiltImage.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">1 (7, 7, 0)<br> | ||
| + | 255 (22, 7, 0)<br> | ||
| + | 155.874<br> | ||
| + | 73.4908<br> | ||
| + | 0.918635<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ===オプション -cut=== | ||
| + | ====cut=20で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-cut-mrcImageCTFCompensationForTiltImage.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0.01 (7, 7, 0)<br> | ||
| + | 255 (25, 20, 0)<br> | ||
| + | 118.004<br> | ||
| + | 59.0793<br> | ||
| + | 0.738491<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
2015年3月11日 (水) 04:08時点における最新版
mrcImageCTFCompensationForTiltImageとは傾斜画像に関するCTF補正を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル(ファイルサイズのみ使用)設定: mrcImage | NULL |
| -I | 必須 | ROI情報の設定: ASCII | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage(CTF) | NULL |
| -cut | 選択 | 補正しない範囲(中心からのピクセル数) | 6 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
-I のフォーマット
ROI情報のフォーマットについてはmrcImageROIs参照
実行例
入力ファイルのデータ
-i の画像
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 255 (49, 32, 0) |
-iのファイルはファイルサイズのためだけに使用されます。
-I のデータ
/Eos/img/ROISet0/inputnoise-0000.roi Rect 6 6 26 6 26 26 6 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0001.roi Rect 20 6 40 6 40 26 20 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0002.roi Rect 40 6 60 6 60 26 40 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0003.roi Rect 54 6 74 6 74 26 54 26 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0004.roi Rect 6 20 26 20 26 40 6 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0005.roi Rect 20 20 40 20 40 40 20 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0006.roi Rect 40 20 60 20 60 40 40 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0007.roi Rect 54 20 74 20 74 40 54 40 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0008.roi Rect 6 40 26 40 26 60 6 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0009.roi Rect 20 40 40 40 40 60 20 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0010.roi Rect 40 40 60 40 60 60 40 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0011.roi Rect 54 40 74 40 74 60 54 60 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0012.roi Rect 6 54 26 54 26 74 6 74 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0013.roi Rect 20 54 40 54 40 74 20 74 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0014.roi Rect 40 54 60 54 60 74 40 74 /Eos/img/ROISet0/inputnoise-0015.roi Rect 54 54 74 54 74 74 54 74
使用するROIファイル: 入力ファイル
オプション必須項目のみの場合
 |
最小 最大 |
1 (7, 7, 0) 255 (22, 7, 0) |
オプション -cut
cut=20で実行
 |
最小 最大 |
0.01 (7, 7, 0) 255 (25, 20, 0) |
