「mrcImagesSinogramCorrelation」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内、検索
 
(同じ利用者による、間の1版が非表示)
行1: 行1:
−
'''mrcImagesSinogramCorrelation'''とは複数のシノグラムに対して相関を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。
+
'''mrcImagesSinogramCorrelation'''とは複数のシノグラムに対して相関を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。出力ファイルは[[WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram]]などで使用することができる。
  
  
行269: 行269:
 
Input-1VOM-2D-sin.mrc, YOYS 0 0 0
 
Input-1VOM-2D-sin.mrc, YOYS 0 0 0
 
Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc, YOYS 90 0 0
 
Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc, YOYS 90 0 0
−
Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc, YOYS 180 0 0
+
Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc, YOYS 0 90 0
  
 
</pre>
 
</pre>
行314: 行314:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>[[Media:Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc|Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc]]の画像</div>
+
<div>[[Media:Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc|Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc]]の画像</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot1-2D-sin.png]]</td>  
+
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot3-2D-sin.png]]</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行324: 行324:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-1794.29 (78, 8, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-1732.14 (3, 3, 0)<br>  
−
1.43582e+06 (52, 1, 0)<br>  
+
1.39371e+06 (51, 202, 0)<br>  
−
537888<br>  
+
533594<br>  
−
381064<br>  
+
366888<br>  
−
2245.44<br></p>  
+
2161.91<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行342: 行342:
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[3]=80
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[3]=80
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[4]=80
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[4]=80
 +
LengthCorrelation=0.872180 InLength[0]=58 RefLength[5]=75
 +
LengthCorrelation=0.872180 InLength[0]=58 RefLength[6]=75
  
 
-中略-
 
-中略-
行350: 行352:
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[358]=80
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[358]=80
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[359]=80
 
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[359]=80
−
LengthCorrelation=0.991453 InLength[0]=58 RefLength[0]=59
+
LengthCorrelation=1.000000 InLength[0]=58 RefLength[0]=58
−
LengthCorrelation=0.991453 InLength[0]=58 RefLength[1]=59
+
LengthCorrelation=0.945455 InLength[0]=58 RefLength[1]=52
−
LengthCorrelation=0.991453 InLength[0]=58 RefLength[2]=59
+
LengthCorrelation=0.905660 InLength[0]=58 RefLength[2]=48
−
LengthCorrelation=0.983051 InLength[0]=58 RefLength[3]=60
+
LengthCorrelation=0.862745 InLength[0]=58 RefLength[3]=44
−
LengthCorrelation=0.974790 InLength[0]=58 RefLength[4]=61
+
LengthCorrelation=0.925926 InLength[0]=58 RefLength[4]=50
  
 
-中略-
 
-中略-
  
−
LengthCorrelation=0.848921 InLength[359]=80 RefLength[355]=59
+
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[355]=55
−
LengthCorrelation=0.848921 InLength[359]=80 RefLength[356]=59
+
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[356]=55
−
LengthCorrelation=0.848921 InLength[359]=80 RefLength[357]=59
+
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[357]=55
−
LengthCorrelation=0.848921 InLength[359]=80 RefLength[358]=59
+
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[358]=55
−
LengthCorrelation=0.848921 InLength[359]=80 RefLength[359]=59
+
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[359]=55
 +
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=80 RefLength[0]=58
 +
LengthCorrelation=0.787879 InLength[0]=80 RefLength[1]=52
 +
LengthCorrelation=0.750000 InLength[0]=80 RefLength[2]=48
 +
LengthCorrelation=0.709677 InLength[0]=80 RefLength[3]=44
 +
LengthCorrelation=0.769231 InLength[0]=80 RefLength[4]=50
 +
 
 +
-中略-
 +
 
 +
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=80 RefLength[350]=58
 +
LengthCorrelation=0.881119 InLength[359]=80 RefLength[351]=63
 +
LengthCorrelation=0.881119 InLength[359]=80 RefLength[352]=63
 +
LengthCorrelation=0.873239 InLength[359]=80 RefLength[353]=62
 +
LengthCorrelation=0.796992 InLength[359]=80 RefLength[354]=53
 +
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[355]=55
 +
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[356]=55
 +
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[357]=55
 +
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[358]=55
 +
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[359]=55
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>
行371: 行391:
 
<pre>
 
<pre>
 
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor
 
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor
−
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor
+
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
−
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor
+
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
 
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/test-Derivation1D.list
 
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/test-Derivation1D.list
 
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor
 
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor
−
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor
+
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
−
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor
+
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
 
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/test-Derivation2D.list
 
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/test-Derivation2D.list
 
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor
 
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor
−
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor
+
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
−
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor
+
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
 
$EOS_HOME/Result/Length/test-Length.list
 
$EOS_HOME/Result/Length/test-Length.list
 
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor
 
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor
−
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor
+
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
−
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor
+
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
 
$EOS_HOME/Result/Normal/test-Normal.list
 
$EOS_HOME/Result/Normal/test-Normal.list
 
</pre>
 
</pre>
行414: 行434:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行424: 行444:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-0.973223 (5, 25, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-0.969656 (10, 168, 0)<br>  
−
0.997794 (206, 26, 0)<br>  
+
0.96977 (10, 357, 0)<br>  
−
0.201244<br>  
+
0.199734<br>  
−
0.509957<br>  
+
0.487223<br>  
−
0.00141655<br></p>  
+
0.0013534<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行434: 行454:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行444: 行464:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-0.820537 (24, 172, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-0.79716 (206, 183, 0)<br>  
−
0.994204 (280, 90, 0)<br>  
+
0.986575 (190, 120, 0)<br>  
−
0.23289<br>  
+
0.251101<br>  
−
0.392112<br>  
+
0.368028<br>  
−
0.0010892<br></p>  
+
0.0010223<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行457: 行477:
 
<pre>
 
<pre>
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
−
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
+
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
−
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
+
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>
行487: 行507:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行497: 行517:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left"> -1 (139, 151, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-0.995358 (132, 121, 0)<br>  
−
1 (133, 155, 0)<br>  
+
0.991247 (133, 4, 0)<br>  
−
nan<br>  
+
0.0859721<br>  
−
nan<br>  
+
0.247723<br>  
−
nan<br></p>  
+
0.000688118<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行507: 行527:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行517: 行537:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-0.932761 (183, 311, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-0.98175 (356, 217, 0)<br>  
−
0.978167 (100, 270, 0)<br>  
+
0.97865 (0, 217, 0)<br>  
−
0.0722883<br>  
+
0.0731451<br>  
−
0.246154<br>  
+
0.245175<br>  
−
0.000683761<br></p>  
+
0.000681042<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行530: 行550:
 
<pre>
 
<pre>
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
−
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
+
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
−
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
+
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>
行560: 行580:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行570: 行590:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-1 (78, 3, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-1 (158, 33, 0)<br>  
−
1 (308, 3, 0)<br>  
+
1 (158, 30, 0)<br>  
−
nan<br>  
+
0.0945901<br>  
−
nan<br>  
+
0.227151<br>  
−
nan<br></p>  
+
0.000630976<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行580: 行600:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行590: 行610:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-1 (61, 105, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-0.970911 (132, 30, 0)<br>  
−
1 (241, 158, 0)<br>  
+
1 (135, 30, 0)<br>  
−
nan<br>  
+
0.104829<br>  
−
nan<br>  
+
0.220026<br>  
−
nan<br></p>  
+
0.000611183<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行603: 行623:
 
<pre>
 
<pre>
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
−
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
+
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
−
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
+
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>
行633: 行653:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行643: 行663:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0.75969 (27, 152, 0)<br>  
+
<td><p align="left">0.699187 (27, 191, 0)<br>  
−
1 (170, 0, 0)<br>  
+
1 (0, 0, 0)<br>  
−
0.932097<br>  
+
0.93032<br>  
−
0.0565568<br>  
+
0.0611702<br>  
−
0.000157102<br></p>  
+
0.000169917<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行653: 行673:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行663: 行683:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0.75969 (0, 152, 0)<br>  
+
<td><p align="left">0.699187 (0, 191, 0)<br>  
−
1 (78, 0, 0)<br>  
+
1 (67, 0, 0)<br>  
−
0.935747<br>  
+
0.93353<br>  
−
0.0535635<br>  
+
0.0580325<br>  
−
0.000148787<br></p>  
+
0.000161201<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行676: 行696:
 
<pre>
 
<pre>
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
−
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
+
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
−
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
+
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>
行706: 行726:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行716: 行736:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0.4 (355, 25, 0)<br>  
+
<td><p align="left">0.16092 (28, 68, 0)<br>  
−
1 (171, 0, 0)<br>  
+
1 (1, 0, 0)<br>  
−
0.861956<br>  
+
0.849408<br>  
−
0.102308<br>  
+
0.121498<br>  
−
0.000284188<br></p>  
+
0.000337494<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行726: 行746:
 
<br>
 
<br>
  
−
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor</div>
+
<div>Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行736: 行756:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0.0487805 (303, 25, 0)<br>  
+
<td><p align="left">0.0487805 (303, 31, 0)<br>  
−
1 (46, 0, 0)<br>  
+
1 (31, 0, 0)<br>  
−
0.863088<br>  
+
0.849326<br>  
−
0.119772<br>  
+
0.135625<br>  
−
0.000332701<br></p>  
+
0.000376735<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行749: 行769:
 
<pre>
 
<pre>
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
−
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
+
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
−
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
+
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
 
</pre>
 
</pre>
 
<br>
 
<br>

2014年3月11日 (火) 06:19時点における最新版

mrcImagesSinogramCorrelationとは複数のシノグラムに対して相関を行うEosのコマンドである。出力ファイルはWeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramなどで使用することができる。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-I 必須 入力ファイルリスト: ASCII NULL
-oH 選択 リストファイル名のヘッダ test
-Rd 選択 出力ディレクトリ Result
-Nd 選択 正規相関の出力ディレクトリ(-Rd 内に作成される) Normal
-D1d 選択 1次元微分相関の出力ディレクトリ(-Rd 内に作成される) Derivation1D
-D2d 選択 2次元微分相関の出力ディレクトリ(-Rd 内に作成される) Derivation2D
-Ld 選択 相関長の出力ディレクトリ(-Rd 内に作成される) Length
-CE 選択 相関ファイルの拡張子 cor
-LE 選択 リストファイルの拡張子 list
-Nm 選択 正規相関の出力 0
-D1m 選択 1次元微分相関の出力 0
-D2m 選択 2次元微分相関の出力 0
-Lm 選択 相関長の出力 0
-LTM 選択 LengthThresholdMode 0
-LTR 選択 LengthThresholdRatio 0.25
-CM 選択 出力するファイルの設定 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　


モードの詳細

モード 説明
0


-Nm の詳細

モード 説明
0 正規相関を出力する(-Nd で出力ディレクトリ指定)
1 正規相関を出力しない


-D1m の詳細

モード 説明
0 1次元微分相関を出力する(-D1d で出力ディレクトリ指定)
1 1次元微分相関を出力しない


-D2m の詳細

モード 説明
0 2次元微分相関を出力する(-D2d で出力ディレクトリ指定)
1 2次元微分相関を出力しない


-Lm の詳細

モード 説明
0 相関長を出力する (-Ld で出力ディレクトリ指定, -LTM, -LTR)
1 相関長を出力しない


-CM の詳細

モード 説明
0 相関データとリストを出力する
1 リストのみ出力する


-I のフォーマット

ファイル1,  EA1  Rot1-1  Rot1-2  Rot1-3
ファイル2,  EA2  Rot2-1  Rot2-2  Rot2-3
ファイル3,  EA3  Rot3-1  Rot3-2  Rot3-3
      .       ,     .        .            .           .
      .       ,     .        .            .           .
      .       ,     .        .            .           .
ファイル名とEAの間には,(カンマ)を入れなければならない。
ファイル名の先頭を/にすると命名規則により相関ファイルを作成できないので注意。


作成されるディレクトリおよびファイル

ディレクトリ

Rd
Rd/Nd (D1d, D2d, Ld)
例: Result/Normal/
ディレクトリが既に存在している場合はデータを作成できないので注意。


リストファイル

Rd/Nd/oH-Nd.LE
例: Result/Normal/test-Normal.list


相関ファイル

Rd/Nd/infile1_infile2.Nd.CE
例: Result/Normal/test1_test2.Normal.cor


実行例

入力ファイルのデータ

Input-1VOM-2D-sin.mrc,	YOYS	0	0	0
Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc,	YOYS	90	0	0
Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc,	YOYS	0	90	0


Input-1VOM-2D-sin.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-3045.85 (79, 268, 0)

1.53325e+06 (27, 1, 0)
589315
378411

2229.81


Input-1VOM-Rot-2D-sin.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-16429.6 (78, 357, 0)

1.31372e+06 (44, 38, 0)
536988
293780

1731.11


Input-1VOM-Rot3-2D-sin.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1732.14 (3, 3, 0)

1.39371e+06 (51, 202, 0)
533594
366888

2161.91


オプション必須項目のみの場合

出力結果
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[0]=80
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[1]=80
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[2]=80
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[3]=80
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=58 RefLength[4]=80
LengthCorrelation=0.872180 InLength[0]=58 RefLength[5]=75
LengthCorrelation=0.872180 InLength[0]=58 RefLength[6]=75

-中略-

LengthCorrelation=0.852941 InLength[359]=58 RefLength[355]=78
LengthCorrelation=0.852941 InLength[359]=58 RefLength[356]=78
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[357]=80
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[358]=80
LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=58 RefLength[359]=80
LengthCorrelation=1.000000 InLength[0]=58 RefLength[0]=58
LengthCorrelation=0.945455 InLength[0]=58 RefLength[1]=52
LengthCorrelation=0.905660 InLength[0]=58 RefLength[2]=48
LengthCorrelation=0.862745 InLength[0]=58 RefLength[3]=44
LengthCorrelation=0.925926 InLength[0]=58 RefLength[4]=50

-中略-

LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[355]=55
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[356]=55
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[357]=55
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[358]=55
LengthCorrelation=0.973451 InLength[359]=58 RefLength[359]=55
LengthCorrelation=0.840580 InLength[0]=80 RefLength[0]=58
LengthCorrelation=0.787879 InLength[0]=80 RefLength[1]=52
LengthCorrelation=0.750000 InLength[0]=80 RefLength[2]=48
LengthCorrelation=0.709677 InLength[0]=80 RefLength[3]=44
LengthCorrelation=0.769231 InLength[0]=80 RefLength[4]=50

-中略-

LengthCorrelation=0.840580 InLength[359]=80 RefLength[350]=58
LengthCorrelation=0.881119 InLength[359]=80 RefLength[351]=63
LengthCorrelation=0.881119 InLength[359]=80 RefLength[352]=63
LengthCorrelation=0.873239 InLength[359]=80 RefLength[353]=62
LengthCorrelation=0.796992 InLength[359]=80 RefLength[354]=53
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[355]=55
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[356]=55
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[357]=55
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[358]=55
LengthCorrelation=0.814815 InLength[359]=80 RefLength[359]=55


出力ファイル一覧
デフォルト設定の場合、以下のようなファイル構成となる。
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
$EOS_HOME/Result/Derivation1D/test-Derivation1D.list
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
$EOS_HOME/Result/Derivation2D/test-Derivation2D.list
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
$EOS_HOME/Result/Length/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
$EOS_HOME/Result/Length/test-Length.list
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
$EOS_HOME/Result/Normal/Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
$EOS_HOME/Result/Normal/test-Normal.list


オプション　-Nm

Nm=0(デフォルト)で実行

Normalディレクトリ以下のデータ


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor
Outdata-Nm-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.925733 (174, 223, 0)

0.986152 (271, 281, 0)
0.203463
0.411921

0.00114423


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
Outdata-Nm1-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.969656 (10, 168, 0)

0.96977 (10, 357, 0)
0.199734
0.487223

0.0013534


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor
Outdata-Nm2-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.79716 (206, 183, 0)

0.986575 (190, 120, 0)
0.251101
0.368028

0.0010223


test-Normal.list
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1


オプション　-D1d

D1d=0(デフォルト)で実行

Derivation1Dディレクトリ以下のデータ


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor
Outdata-D1d-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.999642 (131, 329, 0)

0.921779 (132, 73, 0)
0.0604004
0.241042

0.00066956


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
Outdata-D1d1-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.995358 (132, 121, 0)

0.991247 (133, 4, 0)
0.0859721
0.247723

0.000688118


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor
Outdata-D1d2-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.98175 (356, 217, 0)

0.97865 (0, 217, 0)
0.0731451
0.245175

0.000681042


test-Derivation1D.list
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1


オプション　-D2d

D2d=0(デフォルト)で実行

Derivation2Dディレクトリ以下のデータ


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor
Outdata-D2d-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (285, 75, 0)

1 (285, 61, 0)
nan
nan

nan


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
Outdata-D2d1-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (158, 33, 0)

1 (158, 30, 0)
0.0945901
0.227151

0.000630976


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor
Outdata-D2d2-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.970911 (132, 30, 0)

1 (135, 30, 0)
0.104829
0.220026

0.000611183


test-Derivation2D.list
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1


オプション　-Ld

Ld=0(デフォルト)で実行

Lengthディレクトリ以下のデータ


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor
Outdata-Ld-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.778626 (27, 38, 0)

1 (27, 0, 0)
0.946219
0.047809

0.000132803


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
Outdata-Ld2-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (27, 191, 0)

1 (0, 0, 0)
0.93032
0.0611702

0.000169917


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
Outdata-Ld1-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (0, 191, 0)

1 (67, 0, 0)
0.93353
0.0580325

0.000161201


test-Length.list
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 1
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 4.712389 1


オプション　-LTR

LTR=0.5で実行

Lengthディレクトリ以下のデータ


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor
Outdata-LTR-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.0487805 (28, 303, 0)

1 (28, 0, 0)
0.864734
0.122153

0.000339315


Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
Outdata-LTR1-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.16092 (28, 68, 0)

1 (1, 0, 0)
0.849408
0.121498

0.000337494


Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor
Outdata-LTR2-mrcImagesSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.0487805 (303, 31, 0)

1 (31, 0, 0)
0.849326
0.135625

0.000376735


test-Length.list
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot3-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1



「https://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/index.php?title=mrcImagesSinogramCorrelation&oldid=6872」から取得