「mrcImageAreaCalc」の版間の差分
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(ページの作成: '''mrcImageAreaCalc'''。 == オプション一覧 == <table border="1"> <tr> <th>オプション</th> <th>必須項目/選択項目</th> <th>説明</th> <th>...) |
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<td>-l</td> | <td>-l</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td> | + | <td>ラベリングされた画像の出力（中間ファイルとして計算されるもの）</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
| + | <td>-OH</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>面積のヒストグラム</td> | ||
| + | <td>NULL</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>面積のヒストグラムの際の刻み幅</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-N</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>ラベリングの際の近接の定義 [4(0)|8 or 6(0)|18|26]のいずれかの値</td> | ||
| + | <td>0</td> | ||
| + | </tr> <tr> | ||
<td>-h</td> | <td>-h</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
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<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[ | + | <td>[[画像:B120-mrcImageAreaCalc.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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<td>二値化した画像を使用<br> | <td>二値化した画像を使用<br> | ||
－－－－－－＞</td> | －－－－－－＞</td> | ||
| − | <td>[[ | + | <td>[[画像:Bin.m0t45-mrcImageAreaCalc.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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</table> | </table> | ||
| − | ===出力結果-=== | + | ===出力結果 -o=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[ | + | <td>[[画像:A.labe.binm0t45-mrcImageAreaCalc.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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0.00183481<br></p> | 0.00183481<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td> | + | <td>ボクセルの値は、所属するセグメントの体積（ボクセル数）を<br> |
| − | + | 表現している</td> | |
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===最大の面積の領域値（オプション -O）=== | ===最大の面積の領域値（オプション -O）=== | ||
以下のようにオプション-Oで出力先を指定する<br> | 以下のようにオプション-Oで出力先を指定する<br> | ||
この場合では「a.bin.m0t45.center.info2」が出力先となる<br> | この場合では「a.bin.m0t45.center.info2」が出力先となる<br> | ||
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この出力先をcatで見ると<br> | この出力先をcatで見ると<br> | ||
| − | + | <pre> | |
| − | + | MaxRegion: 107.000000 | |
| − | + | </pre> | |
| + | というように、最大の面積の画素数が出ている。この値は、-oの値での最大値と一致している<br> | ||
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===ラベリング（オプション -l）=== | ===ラベリング（オプション -l）=== | ||
[[mrcImageLabeling]] | [[mrcImageLabeling]] | ||
と同じ機能を持つ<br> | と同じ機能を持つ<br> | ||
※出力先はオプション-lで指定した出力先となる | ※出力先はオプション-lで指定した出力先となる | ||
| + | |||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata2-mrcImageAreaCalc.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0<br> | ||
| + | 9<br> | ||
| + | 0.0596875<br> | ||
| + | 0.603272<br> | ||
| + | 0.0075409<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
2015年11月11日 (水) 23:43時点における最新版
mrcImageAreaCalcとは２値画像を使った面積・体積の計算を行うEosのコマンドである。
オプション一覧
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル設定 | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル設定 | NULL |
| -O | 選択 | 面積が最大の画素数をとる | stdout |
| -l | 選択 | ラベリングされた画像の出力（中間ファイルとして計算されるもの） | NULL |
| -OH | 選択 | 面積のヒストグラム | NULL |
| -H | 選択 | 面積のヒストグラムの際の刻み幅 | 1 |
| -N | 選択 | ラベリングの際の近接の定義 [4(0)|8 or 6(0)|18|26]のいずれかの値 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
0 65.5929 |
二値化した画像を使用 －－－－－－＞ |
 |
最小 最大 |
0 1 |
出力結果 -o
 |
最小 最大 |
0 107 |
ボクセルの値は、所属するセグメントの体積（ボクセル数）を 表現している |
最大の面積の領域値（オプション -O）
以下のようにオプション-Oで出力先を指定する
この場合では「a.bin.m0t45.center.info2」が出力先となる
この出力先をcatで見ると
MaxRegion: 107.000000
というように、最大の面積の画素数が出ている。この値は、-oの値での最大値と一致している
ラベリング（オプション -l）
mrcImageLabeling
と同じ機能を持つ
※出力先はオプション-lで指定した出力先となる
 |
最小 最大 |
0 9 |
