「WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram」の版間の差分

2014年3月11日 (火) 06:53時点における版

WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramとは複数のシノグラムの相関からコモンラインを算出するEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-In1	選択	入力ファイルリスト1: 正規相関	NULL
-In2	選択	入力ファイルリスト2: 1次元微分相関	NULL
-In3	選択	入力ファイルリスト3: 2次元微分相関	NULL
-In4	選択	入力ファイルリスト4: 相関長	NULL
-o	必須	出力ファイル設定	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-M	選択	Mode : choice of used Correlation	15
-v	選択	variance of Gaussian weight function	5
-h	選択	ヘルプを表示

-mの詳細

モード	説明
0	get memory of mrcImage
1	don't get memory of mrcImage

-M の詳細

モード	説明
+1	-In1 を使用
+2	-In2 を使用
+4	-In3 を使用
+8	-In4 を使用
15	全ての入力ファイルを使用

2つ以上のモードを組み合わせて使用する

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

相関ファイル1  相関ファイル2  Rot1  Rot2  Mode
         .                       .               .        .         .
         .                       .               .        .         .

相関ファイルはリストと同じディレクトリにあることを想定している

ファイル構成についてはmrcImagesSinogramCorrelationを参照

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.925733 (174, 223, 0)

0.986152 (271, 281, 0)
0.203463
0.411921

0.00114423

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.969656 (10, 168, 0)

0.96977 (10, 357, 0)
0.199734
0.487223

0.0013534

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.79716 (206, 183, 0)

0.986575 (190, 120, 0)
0.251101
0.368028

0.0010223

-i2 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.999642 (131, 329, 0)

0.921779 (132, 73, 0)
0.0604004
0.241042

0.00066956

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.995358 (132, 121, 0)

0.991247 (133, 4, 0)
0.0859721
0.247723

0.000688118

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.98175 (356, 217, 0)

0.97865 (0, 217, 0)
0.0731451
0.245175

0.000681042

-i3 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (285, 75, 0)

1 (285, 61, 0)
nan
nan

nan

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1 (158, 33, 0)

1 (158, 30, 0)
0.0945901
0.227151

0.000630976

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.970911 (132, 30, 0)

1 (135, 30, 0)
0.104829
0.220026

0.000611183

-i4 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.778626 (27, 38, 0)

1 (27, 0, 0)
0.946219
0.047809

0.000132803

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (27, 191, 0)

1 (0, 0, 0)
0.93032
0.0611702

0.000169917

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.699187 (0, 191, 0)

1 (67, 0, 0)
0.93353
0.0580325

0.000161201

オプション　-M

M=3で実行

Weight of I1 is 0.771105
Weight of I2 is 3.459215

M=5で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000

M=6で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000

M=9で実行

Weight of I1 is 0.840327
Weight of I2 is 3.769748

M=10で実行

Weight of I1 is 0.840327
Weight of I2 is 3.769748

M=12で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000

M=7で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000

M=11で実行

Weight of I1 is 0.766941
Weight of I2 is 0.766941
Weight of I3 is 11.505344

M=13で実行

Weight of I1 is 0.000000
Weight of I2 is 0.000000
Weight of I3 is 0.000000

M=14で実行

Weight of I1 is 0.766941
Weight of I2 is 0.766941
Weight of I3 is 11.505344

@@ 行98: / 行98: @@
 			</tr>
 			<tr>
-				<td>1</td>
+				<td>+1</td>
 				<td>-In1 を使用</td>
 			</tr>
 			<tr>
-				<td>2</td>
+				<td>+2</td>
 				<td>-In2 を使用</td>
 			</tr>
 			<tr>
-				<td>4</td>
+				<td>+4</td>
 				<td>-In3 を使用</td>
 			</tr>
 			<tr>
-				<td>8</td>
+				<td>+8</td>
 				<td>-In4 を使用</td>
 			</tr>
@@ 行118: / 行118: @@
 			</tr>
 		</table>
+<div>2つ以上のモードを組み合わせて使用する</div>
 <br>
@@ 行133: / 行134: @@
 == 実行例 ==
 ===[[Media:Input-1VOM-SinCor.zip|入力ファイル]]のデータ===
-<div>-i1 のデータ</div>
+====-i1 のデータ====
 <pre>
 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
@@ 行201: / 行202: @@
 <br>
-<div>-i2 のデータ</div>
+====-i2 のデータ====
 <pre>
 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
@@ 行270: / 行271: @@
 <br>
-<div>-i3 のデータ</div>
+====-i3 のデータ====
 <pre>
 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
@@ 行339: / 行340: @@
 <br>
-<div>-i4 のデータ</div>
+====-i4 のデータ====
 <pre>
 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
@@ 行406: / 行407: @@
 		</tr>
 	</table>
+<br>
+===オプション　-M===
+====M=3で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.771105
+Weight of I2 is 3.459215
+</pre>
+<br>
+====M=5で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.000000
+Weight of I2 is 0.000000
+</pre>
+<br>
+====M=6で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.000000
+Weight of I2 is 0.000000
+</pre>
+<br>
+====M=9で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.840327
+Weight of I2 is 3.769748
+</pre>
+<br>
+====M=10で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.840327
+Weight of I2 is 3.769748
+</pre>
+<br>
+====M=12で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.000000
+Weight of I2 is 0.000000
+</pre>
+<br>
+====M=7で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.000000
+Weight of I2 is 0.000000
+Weight of I3 is 0.000000
+</pre>
+<br>
+====M=11で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.766941
+Weight of I2 is 0.766941
+Weight of I3 is 11.505344
+</pre>
+<br>
+====M=13で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.000000
+Weight of I2 is 0.000000
+Weight of I3 is 0.000000
+</pre>
+<br>
+====M=14で実行====
+<pre>
+Weight of I1 is 0.766941
+Weight of I2 is 0.766941
+Weight of I3 is 11.505344
+</pre>
 <br>

「WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram」の版間の差分

2014年3月11日 (火) 06:53時点における版

目次

オプション一覧

メインオプション

-mの詳細

-M の詳細

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

-i2 のデータ

-i3 のデータ

-i4 のデータ

オプション　-M

M=3で実行

M=5で実行

M=6で実行

M=9で実行

M=10で実行

M=12で実行

M=7で実行

M=11で実行

M=13で実行

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「WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram」の版間の差分

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オプション一覧

メインオプション

-mの詳細

-M の詳細

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

-i2 のデータ

-i3 のデータ

-i4 のデータ

オプション -M

M=3で実行

M=5で実行

M=6で実行

M=9で実行

M=10で実行

M=12で実行

M=7で実行

M=11で実行

M=13で実行

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