「WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram」の版間の差分
行98: | 行98: | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>1</td> | + | <td>+1</td> |
<td>-In1 を使用</td> | <td>-In1 を使用</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>2</td> | + | <td>+2</td> |
<td>-In2 を使用</td> | <td>-In2 を使用</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>4</td> | + | <td>+4</td> |
<td>-In3 を使用</td> | <td>-In3 を使用</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>8</td> | + | <td>+8</td> |
<td>-In4 を使用</td> | <td>-In4 を使用</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行118: | 行118: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <div>2つ以上のモードを組み合わせて使用する</div> | ||
<br> | <br> | ||
行133: | 行134: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
===[[Media:Input-1VOM-SinCor.zip|入力ファイル]]のデータ=== | ===[[Media:Input-1VOM-SinCor.zip|入力ファイル]]のデータ=== | ||
− | + | ====-i1 のデータ==== | |
<pre> | <pre> | ||
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
行201: | 行202: | ||
<br> | <br> | ||
− | + | ====-i2 のデータ==== | |
<pre> | <pre> | ||
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
行270: | 行271: | ||
<br> | <br> | ||
− | + | ====-i3 のデータ==== | |
<pre> | <pre> | ||
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
行339: | 行340: | ||
<br> | <br> | ||
− | + | ====-i4 のデータ==== | |
<pre> | <pre> | ||
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 | ||
行406: | 行407: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -M=== | ||
+ | ====M=3で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.771105 | ||
+ | Weight of I2 is 3.459215 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=5で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I2 is 0.000000 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=6で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I2 is 0.000000 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=9で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.840327 | ||
+ | Weight of I2 is 3.769748 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=10で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.840327 | ||
+ | Weight of I2 is 3.769748 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=12で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I2 is 0.000000 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=7で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I2 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I3 is 0.000000 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=11で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.766941 | ||
+ | Weight of I2 is 0.766941 | ||
+ | Weight of I3 is 11.505344 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=13で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I2 is 0.000000 | ||
+ | Weight of I3 is 0.000000 | ||
+ | </pre> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====M=14で実行==== | ||
+ | <pre> | ||
+ | Weight of I1 is 0.766941 | ||
+ | Weight of I2 is 0.766941 | ||
+ | Weight of I3 is 11.505344 | ||
+ | </pre> | ||
<br> | <br> |
2014年3月11日 (火) 06:53時点における版
WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramとは複数のシノグラムの相関からコモンラインを算出するEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-In1 | 選択 | 入力ファイルリスト1: 正規相関 | NULL |
-In2 | 選択 | 入力ファイルリスト2: 1次元微分相関 | NULL |
-In3 | 選択 | 入力ファイルリスト3: 2次元微分相関 | NULL |
-In4 | 選択 | 入力ファイルリスト4: 相関長 | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定 | NULL |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-M | 選択 | Mode : choice of used Correlation | 15 |
-v | 選択 | variance of Gaussian weight function | 5 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-mの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | get memory of mrcImage |
1 | don't get memory of mrcImage |
-M の詳細
モード | 説明 |
---|---|
+1 | -In1 を使用 |
+2 | -In2 を使用 |
+4 | -In3 を使用 |
+8 | -In4 を使用 |
15 | 全ての入力ファイルを使用 |
-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット
相関ファイル1 相関ファイル2 Rot1 Rot2 Mode . . . . . . . . . .
実行例
入力ファイルのデータ
-i1 のデータ
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
![]() |
最小 最大 |
-0.925733 (174, 223, 0) 0.986152 (271, 281, 0) |
![]() |
最小 最大 |
-0.969656 (10, 168, 0) 0.96977 (10, 357, 0) |
![]() |
最小 最大 |
-0.79716 (206, 183, 0) 0.986575 (190, 120, 0) |
-i2 のデータ
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
![]() |
最小 最大 |
-0.999642 (131, 329, 0) 0.921779 (132, 73, 0) |
![]() |
最小 最大 |
-0.995358 (132, 121, 0) 0.991247 (133, 4, 0) |
![]() |
最小 最大 |
-0.98175 (356, 217, 0) 0.97865 (0, 217, 0) |
-i3 のデータ
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
![]() |
最小 最大 |
-1 (285, 75, 0) 1 (285, 61, 0) |
![]() |
最小 最大 |
-1 (158, 33, 0) 1 (158, 30, 0) |
![]() |
最小 最大 |
-0.970911 (132, 30, 0) 1 (135, 30, 0) |
-i4 のデータ
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1 Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
![]() |
最小 最大 |
0.778626 (27, 38, 0) 1 (27, 0, 0) |
![]() |
最小 最大 |
0.699187 (27, 191, 0) 1 (0, 0, 0) |
![]() |
最小 最大 |
0.699187 (0, 191, 0) 1 (67, 0, 0) |
オプション -M
M=3で実行
Weight of I1 is 0.771105 Weight of I2 is 3.459215
M=5で実行
Weight of I1 is 0.000000 Weight of I2 is 0.000000
M=6で実行
Weight of I1 is 0.000000 Weight of I2 is 0.000000
M=9で実行
Weight of I1 is 0.840327 Weight of I2 is 3.769748
M=10で実行
Weight of I1 is 0.840327 Weight of I2 is 3.769748
M=12で実行
Weight of I1 is 0.000000 Weight of I2 is 0.000000
M=7で実行
Weight of I1 is 0.000000 Weight of I2 is 0.000000 Weight of I3 is 0.000000
M=11で実行
Weight of I1 is 0.766941 Weight of I2 is 0.766941 Weight of I3 is 11.505344
M=13で実行
Weight of I1 is 0.000000 Weight of I2 is 0.000000 Weight of I3 is 0.000000
M=14で実行
Weight of I1 is 0.766941 Weight of I2 is 0.766941 Weight of I3 is 11.505344