WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram

WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogramとは複数のシノグラムの相関からコモンラインを算出するEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-In1	選択	入力ファイルリスト1: 正規相関	NULL
-In2	選択	入力ファイルリスト2: 1次元微分相関	NULL
-In3	選択	入力ファイルリスト3: 2次元微分相関	NULL
-In4	選択	入力ファイルリスト4: 相関長	NULL
-o	必須	出力ファイル設定	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-M	選択	Mode : choice of used Correlation	15
-v	選択	variance of Gaussian weight function	5
-h	選択	ヘルプを表示

-mの詳細

モード	説明
0	get memory of mrcImage
1	don't get memory of mrcImage

-M の詳細

モード	説明
1	-In1 を使用
2	-In2 を使用
4	-In3 を使用
8	-In4 を使用
15	全ての入力ファイルを使用

-i1, -12, -i3, -i4のフォーマット

相関ファイル1  相関ファイル2  Rot1  Rot2  Mode
         .                       .               .        .         .
         .                       .               .        .         .

相関ファイルはリストと同じディレクトリにあることを想定している

ファイル構成についてはmrcImagesSinogramCorrelationを参照

実行例

入力ファイルのデータ

-i1 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Normal.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Normal.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.925733 (174, 223, 0) 0.986152 (271, 281, 0) 0.203463 0.411921 0.00114423

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.969656 (10, 168, 0) 0.96977 (10, 357, 0) 0.199734 0.487223 0.0013534

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Normal.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.79716 (206, 183, 0) 0.986575 (190, 120, 0) 0.251101 0.368028 0.0010223

-i2 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation1D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation1D.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.999642 (131, 329, 0) 0.921779 (132, 73, 0) 0.0604004 0.241042 0.00066956

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.995358 (132, 121, 0) 0.991247 (133, 4, 0) 0.0859721 0.247723 0.000688118

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation1D.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.98175 (356, 217, 0) 0.97865 (0, 217, 0) 0.0731451 0.245175 0.000681042

-i3 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Derivation2D.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Derivation2D.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-1 (285, 75, 0) 1 (285, 61, 0) nan nan nan

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-1 (158, 33, 0) 1 (158, 30, 0) 0.0945901 0.227151 0.000630976

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Derivation2D.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.970911 (132, 30, 0) 1 (135, 30, 0) 0.104829 0.220026 0.000611183

-i4 のデータ

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1
Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 0.000000 0.000000 z-rotation
Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot1-2D-sin.Length.cor Input-1VOM-Rot-2D-sin.mrc Input-1VOM-Rot1-2D-sin.mrc 1.570796 1.570796 1

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot-2D-sin.Length.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.778626 (27, 38, 0) 1 (27, 0, 0) 0.946219 0.047809 0.000132803

Input-1VOM-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.699187 (27, 191, 0) 1 (0, 0, 0) 0.93032 0.0611702 0.000169917

Input-1VOM-Rot-2D-sin_Input-1VOM-Rot3-2D-sin.Length.cor

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.699187 (0, 191, 0) 1 (67, 0, 0) 0.93353 0.0580325 0.000161201