l 平成２０年度～平成２１年度：特定領域研究・公募研究：領域５１３（生体超分子構造）、Ａ０１、研究代表者、６２０万円（３１０万円＋３１０万円）、電子顕微鏡画像処理システムの開発、20051018-A01-0001
l 平成２０年度～平成２２年度：基盤研究（Ｃ）（一般） 力発生中のミオシンの電子顕微鏡による観察技術の開発、研究代表者：安永卓生 （１２０万円＋ ＋ ）
l 平成２０年度～平成２３年度：基盤研究（B）（一般） プロテアソームの単粒子解析による構造研究、研究代表者 光岡薫、分担（３５万円＋ ＋ ＋）
l 平成１９年度～平成２０年度：基盤研究（Ｃ）（一般） 最速モーター車軸藻ミオシンのユニークなアクチン結合様式の研究 代表者：伊藤光二 分担 １２０万円（分担金）
l 平成１８年度～平成２３年度：ＣＲＥＳＴ：研究領域「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」（細胞内標識による生物分子トモグラフィー），主たる共同研究者，安永卓生（研究代表者，宮澤 淳夫，主たる共同研究者 岩崎憲治）
l 平成１８年度～平成２０年度：基盤研究（Ｃ）（一般） ヘムオキシゲナーゼの酵素化学的検討とヘム分解系マシーナリーへの展開 代表者：坂本寛 分担 ０円（分担金）
l 平成１７年度：特定領域研究・公募研究：領域５１３（生体超分子構造）、Ａ０１、研究代表者、２９０万円、電子顕微鏡像の単粒子解析での構造分類と３次元再構成法の開発、１７０３５０２１―０１４５
l 平成１６年度～２０年度： 特定領域研究（生体ナノシステム：領域代表 樋口秀男）・計画班（１）、研究分担者（研究代表者 広瀬恵子） １８００万円（分担金：２７０万円）
l 平成１５年度～１６年度： 萌芽研究、研究代表者：３２０万円 （１９０万円＋１３０万円）分担者：入佐正幸
l 平成１４年度： 生物分子工学研究所共同研究（産学連携）、研究代表者：１００万円
l 平成１３年度～１４年度： 若手Ｂ（旧奨励研究Ａ）、科学研究費補助金、研究代表者: ２３０万円
l 平成 ９年度～１２年度： 特別推進研究、科学研究費補助金、研究分担者（研究代表者：若林健之）：２億７６００万円（研究費総額）
l 平成 ９年度： 特定領域、公募研究： 特別推進研究の為辞退、研究代表者
l 平成 ９年度： 奨励研究A： 特別推進研究の為辞退、研究代表者
l 平成 ８年度： 一般研究Ｂ、研究分担者（研究代表者：若林健之）
l 平成 ６年度～ ７年度： 一般研究B、研究分担者（研究代表者：若林健之）
l 平成 ６年度～ ７年度： 奨励研究Ａ、研究代表者
l 平成 ３年度～ ４年度： 学振：特別研究員（博士）、研究代表者
