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  1. Dockerコマンド備忘録
  2. Dockerトラブルシューティング
  3. Docker関連
  4. EMAN2プロセッサ
  5. EMAN2関連
  6. EMPIAR
  7. EMPIARからのデータダウンロード方法
  8. Eos
  9. Eos(API)
  10. Eos/PIONE
  11. Eos/PIONE/Zephyr/WITs/VEM システム
  12. Eos/src/Objects
  13. Eos/src/Tools
  14. EosCuda
  15. EosEnvSet
  16. EosOnCUDA
  17. EosOnLinux
  18. EosOnMac
  19. EosPThread
  20. Eos env
  21. Eospediaの編集で使用しているツール
  22. EosのTIPS
  23. Eosのインストール
  24. Eosのコマンド
  25. Eosの構造
  26. Eosの開発
  27. Eosの開発におけるTIPS
  28. Eos関連ソフトウェアのTIPS
  29. EvaluateCorrelationMapwithCommonLine
  30. FAQ
  31. FEIの制御
  32. FETOrientationSearchByAnnealing
  33. FETOrientationSearchByFeatureAlignment
  34. FETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting
  35. FETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization
  36. FRET解析
  37. FigureFactory(API)
  38. File(API)
  39. File Formats and Other Documentation
  40. GITHUB/PIONE
  41. GITの使い方
  42. GNU parallel
  43. GPGPU
  44. Gaussian
  45. Gaussian Checkpoint Files
  46. Gautomatch
  47. Gctf
  48. Git
  49. Gitコマンド備忘録
  50. HDF5
  51. HDFView
  52. HomologyStore(API)
  53. IMAGIC(API)
  54. IMOD/ETomo
  55. Imaris
  56. Integration Tools
  57. JSON
  58. JavaScript
  59. JavaScriptのTIPS
  60. JupyterLab
  61. JupyterLab設定
  62. LCalculationForOrientationSearch
  63. LD LIBRARY PATH
  64. LINDA
  65. LINUXに関連したソフトウェアのTIPS
  66. LVMの使い方
  67. Linuxコマンド備忘録
  68. Linux関連
  69. LoGピッキングのSTARファイル
  70. MPI(massage passing interface)
  71. MTF
  72. MTF無しでPostProcessing
  73. MacOSでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  74. MacOSでsshセッションが途切れる問題
  75. MacOSのzsh設定
  76. MachineIndependent
  77. Make
  78. Makefile
  79. Makefileによる統合
  80. Makegeneral
  81. Makeobj
  82. Maketool
  83. Map2D(API)
  84. Markdown
  85. Matplotlib tips
  86. Matrix3D(API)
  87. Memory(API)
  88. MicroED
  89. Moodle関連
  90. Motion correctionジョブのlogfile.pdf
  91. Motion correctionジョブのstarファイル
  92. MrcImage.h
  93. MrcImageBinarization
  94. MrcImageDensityConversion
  95. MrcImageTransepose
  96. NAMD
  97. NVIDIA Dockerのインストール
  98. NeuralNet(API)
  99. NoMachineでリモートデスクトップ
  100. Numpy tips
  101. OSXに関連したソフトウェアのTIPS
  102. OptionControlFile
  103. PDB
  104. PIONE
  105. PIONE Webclient
  106. PIONE Webclientチュートリアル
  107. PIONEによる統合
  108. PIONEのTIPS
  109. PIONEのインストール方法
  110. PIONEの式
  111. PIONEの詳細
  112. PIONEの起動方法
  113. PIONEコマンドのTIPS
  114. PIONEコマンド一覧
  115. PIONEチュートリアル
  116. PIONEチュートリアル-PNML
  117. PIONEチュートリアル-XES
  118. PIONEチュートリアル-package
  119. PIONE定義書
  120. PIONE定義書のTIPS
  121. PNML
  122. PSF
  123. PVM(API)
  124. Pandoc
  125. Particle extractionジョブのSTARファイル
  126. PickedDataStore(API)
  127. Polar2Descartes
  128. Polish後の3D auto-refineの標準出力
  129. ProM
  130. ProMの使い方
  131. Production system
  132. ProjectionDirectionMapCreate
  133. Property(API)
  134. PropertyTcl(API)
  135. ProtoObjectMethodCreate
  136. Pthread
  137. Python
  138. Python on Windows10
  139. Python tips
  140. PythonのためのVisual Studio Code設定覚書
  141. Pythonトラブルシューティング
  142. RELION
  143. RELION2のCentOSへの導入
  144. RELION2のScientificLinux7への導入
  145. RELION2のUbuntuへの導入
  146. RELION3.1チュートリアル
  147. RELION3のMacへの導入
  148. RELION3チュートリアル
  149. RELION tips
  150. RELIONのMacへの導入
  151. RELIONのSTARファイル
  152. RELIONの定義済みラベル
  153. RELIONチュートリアル
  154. RELIONトラブルシューティング
  155. RELIONビルド時のCMakeCache.txt
  156. RELIONビルド時のエラー1
  157. RELION備忘録
  158. RELION実装
  159. RELION理論
  160. ROI
  161. Random(API)
  162. Ref
  163. Ruby
  164. RubyのTIPS
  165. SBF-SEMからの３次元再構成
  166. SGDのアニーリングについて
  167. SIRT
  168. SerialEM
  169. ShapeMaker(API)
  170. Sinatra
  171. Small Tools
  172. Socket(API)
  173. SpecialNumber(API)
  174. String(API)
  175. Support
  176. Tcl/Tk
  177. Test
  178. Topaz
  179. UbuntuでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  180. VEM
  181. VEM/WITs
  182. VNCでリモートデスクトップ(CentOS-MacOS編)
  183. VNCでリモートデスクトップ(Ubuntu-MacOS編)
  184. Vector(API)
  185. VirtualGLでリモートのOpenGLアプリをぬるぬる動かす
  186. Visual Studio Code
  187. Visual Studio CodeでPythonデバッグ実行
  188. Visual Studio CodeでRuby開発
  189. Visual Studio Codeでリモート開発
  190. Visualmake
  191. WITs
  192. WITs-CLEM
  193. WITs-CLEM チュートリアル
  194. WITsの実行例
  195. WITsの構成
  196. WITsの環境
  197. WSLでEMAN2
  198. WeightCalculationOfCommonLineSearch
  199. WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram
  200. WoPeD
  201. XES
  202. XML Schema
  203. XQuartz
  204. Xcode
  205. Zephyr
  206. angleMatchTest k
  207. anglediffchk
  208. array2mrc
  209. arrayPCA
  210. avsFile(API)
  211. bin2mrc
  212. bmp2mrc
  213. bmpFile(API)
  214. bmpFileInfo
  215. cgi
  216. chimera
  217. chimerax
  218. chimeraのTips
  219. clusterLog2ToLog
  220. clusterLogASCII2Binary
  221. clusterShow
  222. coordRotation
  223. cryoDRGN
  224. cryoSPARC
  225. cryoSPARC tips
  226. cryoSPARCトラブルシューティング
  227. ctfDeterminationFromMultiImage
  228. ctfDeterminationFromPhaseComparison
  229. ctfDeterminationFromPhaseComparison(API)
  230. ctfDeterminationFromThonRing
  231. ctfDetermine
  232. ctfDisplay
  233. ctfEnvelopFunction
  234. ctfEnvelopFunctionEstimate
  235. ctfFunction
  236. ctfInfo(API)
  237. ctfInfoSet
  238. ctfInfoWrite2(API)
  239. ctfMultiFunction
  240. ctfWeightMapCreation
  241. ctfZeroPoint
  242. ctfZeroPoint(API)
  243. cufft
  244. dataAnalysis kayabuki
  245. defocusDeterminationFromThonRing
  246. dm2mrc
  247. dmInfo
  248. dos2unix
  249. dsn6File(API)
  250. e2boxer.py
  251. e2display.pyによる単粒子サイズ計測
  252. eTomoチュートリアル
  253. electronWaveLength
  254. emData(API)
  255. emData2mrc
  256. energyTransferModelCheck
  257. energyTransferModelResultCheck
  258. eosAlsa(API)
  259. eosAxisSource(API)
  260. eosCuda(API)
  261. eosDataPicker(API)
  262. eosFunc(API)
  263. eosInteractorMyStyle(API)
  264. eosInteractorStyleStereo(API)
  265. eosList(API)
  266. eosMathAverage
  267. eosMathMedian
  268. eosMathSorting
  269. eosOpenGL(API)
  270. eosPThread(API)
  271. eosPoint(API)
  272. eosPointProjector
  273. eosPointRotation
  274. eosStereoRenderer(API)
  275. eosStereoWindow(API)
  276. eosTclNewCommandCreate(API)
  277. fftn(API)
  278. genUtil(API)
  279. gifFile(API)
  280. god
  281. hf2000(API)
  282. hostCondition
  283. html
  284. imagesView
  285. imodst2mrc
  286. instamatic
  287. ip2mrc
  288. ipyvolumeでインタラクティブ3Dプロット
  289. khorosData(API)
  290. lCommonLineCalculation(API)
  291. lDescartesIntoPolar(API)
  292. lEvaluateCorrelationMapwithCommonLine(API)
  293. lFETOrientationSearchByAnnealing(API)
  294. lFETOrientationSearchByFeatureAlignment(API)
  295. lFETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting(API)
  296. lFETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization(API)
  297. lFRET(API)
  298. largeIP(API)
  299. largeIPInfo
  300. larray2mrc(API)
  301. lastigmatismDetection(API)
  302. lctfDetermination(API)
  303. lhf2000LenzCurrent(API)
  304. lhf2000SpecimenPosition(API)
  305. ll2ltlg
  306. llData(API)
  307. llDataAverage
  308. llDataAxisSearch
  309. llDataCTFCompensate
  310. llDataCompare
  311. llDataContributionCalcDifferentN
  312. llDataDump
  313. llDataEquatorAdd
  314. llDataExtract
  315. llDataFit
  316. llDataInfo
  317. llDataLowPassFiltering
  318. llDataMultiCTFCompensation
  319. llDataNEstimation
  320. llDataNormalization
  321. llDataPrint
  322. llDataRescaling
  323. llDataResolutionCheck
  324. llDataSelectionEstimation
  325. llDataWeightSet
  326. llDatarMaxLimit
  327. llExtract
  328. llExtractCtfinfFileCreate
  329. llExtractCtrlFileCreate
  330. llExtractWithLayerSeparation
  331. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate
  332. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateMyosin
  333. llExtractWithLayerSeparationFilamentInfo
  334. lldb
  335. lll2ltlg(API)
  336. lllDataAxisSearch(API)
  337. lllDataCTF(API)
  338. lllDataCTFCompensate(API)
  339. lllDataCTFCompensation(API)
  340. lllDataCompare(API)
  341. lllDataContributionCalcDifferentN(API)
  342. lllDataDifferenceCalc(API)
  343. lllDataEquatorAdd(API)
  344. lllDataExtract(API)
  345. lllDataFit(API)
  346. lllDataFitAndAverage(API)
  347. lllDataFitParamInverse(API)
  348. lllDataLowPassFiltering(API)
  349. lllDataMergeDifferentN(API)
  350. lllDataRescaling(API)
  351. lllDatarMaxLimit(API)
  352. lllExtract(API)
  353. lllExtractCtfinfFileCreate(API)
  354. lllExtractdYEstimate(API)
  355. lltlg2mrc(API)
  356. lmolvie(API)
  357. lmolvieProteinStatus(API)
  358. lmrc2Dto3D(API)
  359. lmrc3Dto2D(API)
  360. lmrcFETnormalizeBySD(API)
  361. lmrcFFTExpression(API)
  362. lmrcFFTInfo(API)
  363. lmrcFSInfoScatteringAngularDistributionAverageSection(API)
  364. lmrcImage3DPad(API)
  365. lmrcImage3DWindowing(API)
  366. lmrcImageAddValue(API)
  367. lmrcImageAsProbability(API)
  368. lmrcImageAverage(API)
  369. lmrcImageBilateralFilter(API)
  370. lmrcImageBinarization(API)
  371. lmrcImageBoundaryInfo(API)
  372. lmrcImageCTFCompensation(API)
  373. lmrcImageCTFDetermination(API)
  374. lmrcImageCalcArea(API)
  375. lmrcImageCentre(API)
  376. lmrcImageClusterAnalysis(API)
  377. lmrcImageCommonLine(API)
  378. lmrcImageConnection(API)
  379. lmrcImageConnectivityNumberCalc(API)
  380. lmrcImageContourSurface(API)
  381. lmrcImageContourSurfaceCreate
  382. lmrcImageCorrelation(API)
  383. lmrcImageCrystalCreate(API)
  384. lmrcImageDataMaxAndMinGetByImage(API)
  385. lmrcImageDataStraightCopy(API)
  386. lmrcImageDeconvolution(API)
  387. lmrcImageDensity(API)
  388. lmrcImageDensityInverse(API)
  389. lmrcImageDensityNormalizationByImage(API)
  390. lmrcImageDistanceConversion(API)
  391. lmrcImageEdge(API)
  392. lmrcImageEdgeAverage(API)
  393. lmrcImageEdgeEnhancement(API)
  394. lmrcImageFOMCalc(API)
  395. lmrcImageFeatureExtraction(API)
  396. lmrcImageFileListAndEulerAngleDataRead(API)
  397. lmrcImageFilterCreate(API)
  398. lmrcImageFirstNoiseReductionByRelaxation(API)
  399. lmrcImageFloating(API)
  400. lmrcImageFourierNeighborCorrelation(API)
  401. lmrcImageFourierShellCorrelation(API)
  402. lmrcImageHoughTransform(API)
  403. lmrcImageLabeling(API)
  404. lmrcImageLogic(API)
  405. lmrcImageMasking(API)
  406. lmrcImageMirroring(API)
  407. lmrcImageModeChange(API)
  408. lmrcImageModelCreate(API)
  409. lmrcImageMontage(API)
  410. lmrcImageMorphology(API)
  411. lmrcImageMove(API)
  412. lmrcImageMultiplying(API)
  413. lmrcImageNoiseCreate(API)
  414. lmrcImageNormalizing(API)
  415. lmrcImageOneLineSimilarityCalc(API)
  416. lmrcImageOrientationSearchBySimultaneousMinimization(API)
  417. lmrcImagePad(API)
  418. lmrcImagePixelSummationOfProbabilityGetByImage(API)
  419. lmrcImagePosterization(API)
  420. lmrcImagePrint(API)
  421. lmrcImageProjection(API)
  422. lmrcImageProportionalDensityLevelSetByImage(API)
  423. lmrcImageROI2D(API)
  424. lmrcImageROI3D(API)
  425. lmrcImageRadialDistribution(API)
  426. lmrcImageRhoFiltering(API)
  427. lmrcImageSSDA(API)
  428. lmrcImageSamplingUnitChange(API)
  429. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxation(API)
  430. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijDimensionSet(API)
  431. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueCalculate(API)
  432. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueSet(API)
  433. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationQValueSet(API)
  434. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationRValueSet(API)
  435. lmrcImageShapePCA(API)
  436. lmrcImageSigmaCalculate(API)
  437. lmrcImageSinogram(API)
  438. lmrcImageSinogramFFT(API)
  439. lmrcImageSolventFlattening(API)
  440. lmrcImageSpatialFrequencyFilter(API)
  441. lmrcImageSphere(API)
  442. lmrcImageSplit(API)
  443. lmrcImageStudentCalculate(API)
  444. lmrcImageSubtractionCalc(API)
  445. lmrcImageSummationCalculate(API)
  446. lmrcImageSymmetryFind(API)
  447. lmrcImageTone(API)
  448. lmrcImageTransformDescartesIntoPolar(API)
  449. lmrcImageTriming(API)
  450. lmrcImageVolumeCalc(API)
  451. lmrcImageWindowing(API)
  452. lmrcImagesStatDataGet(API)
  453. lmrcNeuralNet(API)
  454. lmrcSinogramFET(API)
  455. lmrcSinogramFETcalcWeight(API)
  456. lmrcSinogramFETcorrelationMap(API)
  457. lmrcSinogramFETnormalizedMap(API)
  458. lmrcSinogramFETreferredCorrelation(API)
  459. lmrcSinogramFETsmoothParameterMatching(API)
  460. lpdb2mrcInfo(API)
  461. lpdbCoord(API)
  462. lpdbCoordInfo(API)
  463. lpdbSelectedAtom(API)
  464. lpdbSurface(API)
  465. ltlg2mrc
  466. ltlgData(API)
  467. ltlgDataInfo
  468. make
  469. makeobj
  470. maketool
  471. mapFile(API)
  472. marching cubes(API)
  473. marker2Dto3DEstimator
  474. matrix3DEulerAngleTransform
  475. matrix3DFromEulerAngle
  476. matrix3DInverse
  477. matrix3DToEulerAngle
  478. mediawiki
  479. minicondaにCMakeの検索パスを持ってかれる
  480. moi2mrc
  481. molecularEnvelopeResampling
  482. molvie
  483. molvieDefault(API)
  484. molvieDock
  485. molvieDockDefault(API)
  486. molvieFlight
  487. molvieFlightDefault(API)
  488. molvieMrcViewer
  489. molvieMrcViewerDefault(API)
  490. molvieProjection
  491. molvieProjectionDefault(API)
  492. molvieViewer
  493. molvieViewerDefault(API)
  494. mrc2Dto3D
  495. mrc2ascii
  496. mrc2bild
  497. mrc2fld
  498. mrc2gif
  499. mrc2hdf
  500. mrc2lattice

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