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  1. $HOME/.Eos/Display2
  2. (検証)リモートのDockerコンテナからVirtualGLでOpenGL飛ばせるのか
  3. 2D classificationジョブのSTARファイル
  4. 3D auto-refineのSTARファイル
  5. 3D classificationのSTARファイル
  6. 3次元再構成
  7. API
  8. API集
  9. ASCII
  10. ActorMaker(API)
  11. Anaconda覚書
  12. Array(API)
  13. Bashによる統合
  14. CCP4
  15. CTF
  16. CTF estimationジョブのSTARファイル
  17. CTF補正
  18. CUDA
  19. CheckCommonLineData
  20. CheckOfOrientation
  21. CheckOrientationByDegree
  22. Cluster(API)
  23. Command Line Tools
  24. CommonLineCalculation
  25. CommonLineRankCalc k
  26. Contour(API)
  27. Crystal(API)
  28. CtfDetemine
  29. Cufft
  30. DCDFile(API)
  31. DMフォーマット
  32. DataBase(API)
  33. DataBaseCorbaBank(API)
  34. DataBaseCorbaImpl(API)
  35. DataBaseCorbaManager(API)
  36. DataBaseJournal(API)
  37. DataBaseMaker(API)
  38. DataBaseNote(API)
  39. DataSearcher(API)
  40. DataStore(API)
  41. Descartes2Polar
  42. Display2
  43. Display2による粒子抽出
  44. DisplayListNumber(API)
  45. DockerでJupyterLab
  46. DockerでPythonによるデータ分析環境を作る
  47. DockerでRELION
  48. DockerでcryoSPARCクラスタ
  49. DockerとNVIDIA Dockerのインストール
  50. Dockerのインストール
  51. Dockerコマンド備忘録
  52. Dockerトラブルシューティング
  53. Docker関連
  54. EMAN2プロセッサ
  55. EMAN2関連
  56. EMPIAR
  57. EMPIARからのデータダウンロード方法
  58. Eos
  59. Eos(API)
  60. Eos/PIONE
  61. Eos/PIONE/Zephyr/WITs/VEM システム
  62. Eos/src/Objects
  63. Eos/src/Tools
  64. EosCuda
  65. EosEnvSet
  66. EosOnCUDA
  67. EosOnLinux
  68. EosOnMac
  69. EosPThread
  70. Eos env
  71. Eospediaの編集で使用しているツール
  72. EosのTIPS
  73. Eosのインストール
  74. Eosのコマンド
  75. Eosの構造
  76. Eosの開発
  77. Eosの開発におけるTIPS
  78. Eos関連ソフトウェアのTIPS
  79. EvaluateCorrelationMapwithCommonLine
  80. FAQ
  81. FEIの制御
  82. FETOrientationSearchByAnnealing
  83. FETOrientationSearchByFeatureAlignment
  84. FETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting
  85. FETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization
  86. FRET解析
  87. FigureFactory(API)
  88. File(API)
  89. File Formats and Other Documentation
  90. GITHUB/PIONE
  91. GITの使い方
  92. GNU parallel
  93. GPGPU
  94. Gaussian
  95. Gaussian Checkpoint Files
  96. Gautomatch
  97. Gctf
  98. Git
  99. Gitコマンド備忘録
  100. HDF5
  101. HDFView
  102. HomologyStore(API)
  103. IMAGIC(API)
  104. IMOD/ETomo
  105. Imaris
  106. Integration Tools
  107. JSON
  108. JavaScript
  109. JavaScriptのTIPS
  110. JupyterLab
  111. JupyterLab設定
  112. LCalculationForOrientationSearch
  113. LD LIBRARY PATH
  114. LINDA
  115. LINUXに関連したソフトウェアのTIPS
  116. LVMの使い方
  117. Linuxコマンド備忘録
  118. Linux関連
  119. LoGピッキングのSTARファイル
  120. MPI(massage passing interface)
  121. MTF
  122. MTF無しでPostProcessing
  123. MacOSでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  124. MacOSでsshセッションが途切れる問題
  125. MacOSのzsh設定
  126. MachineIndependent
  127. Make
  128. Makefile
  129. Makefileによる統合
  130. Makegeneral
  131. Makeobj
  132. Maketool
  133. Map2D(API)
  134. Markdown
  135. Matplotlib tips
  136. Matrix3D(API)
  137. Memory(API)
  138. MicroED
  139. Moodle関連
  140. Motion correctionジョブのlogfile.pdf
  141. Motion correctionジョブのstarファイル
  142. MrcImage.h
  143. MrcImageBinarization
  144. MrcImageDensityConversion
  145. MrcImageTransepose
  146. NAMD
  147. NVIDIA Dockerのインストール
  148. NeuralNet(API)
  149. NoMachineでリモートデスクトップ
  150. Numpy tips
  151. OSXに関連したソフトウェアのTIPS
  152. OptionControlFile
  153. PDB
  154. PIONE
  155. PIONE Webclient
  156. PIONE Webclientチュートリアル
  157. PIONEによる統合
  158. PIONEのTIPS
  159. PIONEのインストール方法
  160. PIONEの式
  161. PIONEの詳細
  162. PIONEの起動方法
  163. PIONEコマンドのTIPS
  164. PIONEコマンド一覧
  165. PIONEチュートリアル
  166. PIONEチュートリアル-PNML
  167. PIONEチュートリアル-XES
  168. PIONEチュートリアル-package
  169. PIONE定義書
  170. PIONE定義書のTIPS
  171. PNML
  172. PSF
  173. PVM(API)
  174. Pandoc
  175. Particle extractionジョブのSTARファイル
  176. PickedDataStore(API)
  177. Polar2Descartes
  178. Polish後の3D auto-refineの標準出力
  179. ProM
  180. ProMの使い方
  181. Production system
  182. ProjectionDirectionMapCreate
  183. Property(API)
  184. PropertyTcl(API)
  185. ProtoObjectMethodCreate
  186. Pthread
  187. Python
  188. Python on Windows10
  189. Python tips
  190. PythonのためのVisual Studio Code設定覚書
  191. Pythonトラブルシューティング
  192. RELION
  193. RELION2のCentOSへの導入
  194. RELION2のScientificLinux7への導入
  195. RELION2のUbuntuへの導入
  196. RELION3.1チュートリアル
  197. RELION3のMacへの導入
  198. RELION3チュートリアル
  199. RELION tips
  200. RELIONのMacへの導入
  201. RELIONのSTARファイル
  202. RELIONの定義済みラベル
  203. RELIONチュートリアル
  204. RELIONトラブルシューティング
  205. RELIONビルド時のCMakeCache.txt
  206. RELIONビルド時のエラー1
  207. RELION備忘録
  208. RELION実装
  209. RELION理論
  210. ROI
  211. Random(API)
  212. Ref
  213. Ruby
  214. RubyのTIPS
  215. SBF-SEMからの３次元再構成
  216. SGDのアニーリングについて
  217. SIRT
  218. SerialEM
  219. ShapeMaker(API)
  220. Sinatra
  221. Small Tools
  222. Socket(API)
  223. SpecialNumber(API)
  224. String(API)
  225. Support
  226. Tcl/Tk
  227. Test
  228. Topaz
  229. UbuntuでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  230. VEM
  231. VEM/WITs
  232. VNCでリモートデスクトップ(CentOS-MacOS編)
  233. VNCでリモートデスクトップ(Ubuntu-MacOS編)
  234. Vector(API)
  235. VirtualGLでリモートのOpenGLアプリをぬるぬる動かす
  236. Visual Studio Code
  237. Visual Studio CodeでPythonデバッグ実行
  238. Visual Studio CodeでRuby開発
  239. Visual Studio Codeでリモート開発
  240. Visualmake
  241. WITs
  242. WITs-CLEM
  243. WITs-CLEM チュートリアル
  244. WITsの実行例
  245. WITsの構成
  246. WITsの環境
  247. WSLでEMAN2
  248. WeightCalculationOfCommonLineSearch
  249. WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram
  250. WoPeD
  251. XES
  252. XML Schema
  253. XQuartz
  254. Xcode
  255. Zephyr
  256. angleMatchTest k
  257. anglediffchk
  258. array2mrc
  259. arrayPCA
  260. avsFile(API)
  261. bin2mrc
  262. bmp2mrc
  263. bmpFile(API)
  264. bmpFileInfo
  265. cgi
  266. chimera
  267. chimerax
  268. chimeraのTips
  269. clusterLog2ToLog
  270. clusterLogASCII2Binary
  271. clusterShow
  272. coordRotation
  273. cryoDRGN
  274. cryoSPARC
  275. cryoSPARC tips
  276. cryoSPARCトラブルシューティング
  277. ctfDeterminationFromMultiImage
  278. ctfDeterminationFromPhaseComparison
  279. ctfDeterminationFromPhaseComparison(API)
  280. ctfDeterminationFromThonRing
  281. ctfDetermine
  282. ctfDisplay
  283. ctfEnvelopFunction
  284. ctfEnvelopFunctionEstimate
  285. ctfFunction
  286. ctfInfo(API)
  287. ctfInfoSet
  288. ctfInfoWrite2(API)
  289. ctfMultiFunction
  290. ctfWeightMapCreation
  291. ctfZeroPoint
  292. ctfZeroPoint(API)
  293. cufft
  294. dataAnalysis kayabuki
  295. defocusDeterminationFromThonRing
  296. dm2mrc
  297. dmInfo
  298. dos2unix
  299. dsn6File(API)
  300. e2boxer.py
  301. e2display.pyによる単粒子サイズ計測
  302. eTomoチュートリアル
  303. electronWaveLength
  304. emData(API)
  305. emData2mrc
  306. energyTransferModelCheck
  307. energyTransferModelResultCheck
  308. eosAlsa(API)
  309. eosAxisSource(API)
  310. eosCuda(API)
  311. eosDataPicker(API)
  312. eosFunc(API)
  313. eosInteractorMyStyle(API)
  314. eosInteractorStyleStereo(API)
  315. eosList(API)
  316. eosMathAverage
  317. eosMathMedian
  318. eosMathSorting
  319. eosOpenGL(API)
  320. eosPThread(API)
  321. eosPoint(API)
  322. eosPointProjector
  323. eosPointRotation
  324. eosStereoRenderer(API)
  325. eosStereoWindow(API)
  326. eosTclNewCommandCreate(API)
  327. fftn(API)
  328. genUtil(API)
  329. gifFile(API)
  330. god
  331. hf2000(API)
  332. hostCondition
  333. html
  334. imagesView
  335. imodst2mrc
  336. instamatic
  337. ip2mrc
  338. ipyvolumeでインタラクティブ3Dプロット
  339. khorosData(API)
  340. lCommonLineCalculation(API)
  341. lDescartesIntoPolar(API)
  342. lEvaluateCorrelationMapwithCommonLine(API)
  343. lFETOrientationSearchByAnnealing(API)
  344. lFETOrientationSearchByFeatureAlignment(API)
  345. lFETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting(API)
  346. lFETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization(API)
  347. lFRET(API)
  348. largeIP(API)
  349. largeIPInfo
  350. larray2mrc(API)
  351. lastigmatismDetection(API)
  352. lctfDetermination(API)
  353. lhf2000LenzCurrent(API)
  354. lhf2000SpecimenPosition(API)
  355. ll2ltlg
  356. llData(API)
  357. llDataAverage
  358. llDataAxisSearch
  359. llDataCTFCompensate
  360. llDataCompare
  361. llDataContributionCalcDifferentN
  362. llDataDump
  363. llDataEquatorAdd
  364. llDataExtract
  365. llDataFit
  366. llDataInfo
  367. llDataLowPassFiltering
  368. llDataMultiCTFCompensation
  369. llDataNEstimation
  370. llDataNormalization
  371. llDataPrint
  372. llDataRescaling
  373. llDataResolutionCheck
  374. llDataSelectionEstimation
  375. llDataWeightSet
  376. llDatarMaxLimit
  377. llExtract
  378. llExtractCtfinfFileCreate
  379. llExtractCtrlFileCreate
  380. llExtractWithLayerSeparation
  381. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate
  382. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateMyosin
  383. llExtractWithLayerSeparationFilamentInfo
  384. lldb
  385. lll2ltlg(API)
  386. lllDataAxisSearch(API)
  387. lllDataCTF(API)
  388. lllDataCTFCompensate(API)
  389. lllDataCTFCompensation(API)
  390. lllDataCompare(API)
  391. lllDataContributionCalcDifferentN(API)
  392. lllDataDifferenceCalc(API)
  393. lllDataEquatorAdd(API)
  394. lllDataExtract(API)
  395. lllDataFit(API)
  396. lllDataFitAndAverage(API)
  397. lllDataFitParamInverse(API)
  398. lllDataLowPassFiltering(API)
  399. lllDataMergeDifferentN(API)
  400. lllDataRescaling(API)
  401. lllDatarMaxLimit(API)
  402. lllExtract(API)
  403. lllExtractCtfinfFileCreate(API)
  404. lllExtractdYEstimate(API)
  405. lltlg2mrc(API)
  406. lmolvie(API)
  407. lmolvieProteinStatus(API)
  408. lmrc2Dto3D(API)
  409. lmrc3Dto2D(API)
  410. lmrcFETnormalizeBySD(API)
  411. lmrcFFTExpression(API)
  412. lmrcFFTInfo(API)
  413. lmrcFSInfoScatteringAngularDistributionAverageSection(API)
  414. lmrcImage3DPad(API)
  415. lmrcImage3DWindowing(API)
  416. lmrcImageAddValue(API)
  417. lmrcImageAsProbability(API)
  418. lmrcImageAverage(API)
  419. lmrcImageBilateralFilter(API)
  420. lmrcImageBinarization(API)
  421. lmrcImageBoundaryInfo(API)
  422. lmrcImageCTFCompensation(API)
  423. lmrcImageCTFDetermination(API)
  424. lmrcImageCalcArea(API)
  425. lmrcImageCentre(API)
  426. lmrcImageClusterAnalysis(API)
  427. lmrcImageCommonLine(API)
  428. lmrcImageConnection(API)
  429. lmrcImageConnectivityNumberCalc(API)
  430. lmrcImageContourSurface(API)
  431. lmrcImageContourSurfaceCreate
  432. lmrcImageCorrelation(API)
  433. lmrcImageCrystalCreate(API)
  434. lmrcImageDataMaxAndMinGetByImage(API)
  435. lmrcImageDataStraightCopy(API)
  436. lmrcImageDeconvolution(API)
  437. lmrcImageDensity(API)
  438. lmrcImageDensityInverse(API)
  439. lmrcImageDensityNormalizationByImage(API)
  440. lmrcImageDistanceConversion(API)
  441. lmrcImageEdge(API)
  442. lmrcImageEdgeAverage(API)
  443. lmrcImageEdgeEnhancement(API)
  444. lmrcImageFOMCalc(API)
  445. lmrcImageFeatureExtraction(API)
  446. lmrcImageFileListAndEulerAngleDataRead(API)
  447. lmrcImageFilterCreate(API)
  448. lmrcImageFirstNoiseReductionByRelaxation(API)
  449. lmrcImageFloating(API)
  450. lmrcImageFourierNeighborCorrelation(API)
  451. lmrcImageFourierShellCorrelation(API)
  452. lmrcImageHoughTransform(API)
  453. lmrcImageLabeling(API)
  454. lmrcImageLogic(API)
  455. lmrcImageMasking(API)
  456. lmrcImageMirroring(API)
  457. lmrcImageModeChange(API)
  458. lmrcImageModelCreate(API)
  459. lmrcImageMontage(API)
  460. lmrcImageMorphology(API)
  461. lmrcImageMove(API)
  462. lmrcImageMultiplying(API)
  463. lmrcImageNoiseCreate(API)
  464. lmrcImageNormalizing(API)
  465. lmrcImageOneLineSimilarityCalc(API)
  466. lmrcImageOrientationSearchBySimultaneousMinimization(API)
  467. lmrcImagePad(API)
  468. lmrcImagePixelSummationOfProbabilityGetByImage(API)
  469. lmrcImagePosterization(API)
  470. lmrcImagePrint(API)
  471. lmrcImageProjection(API)
  472. lmrcImageProportionalDensityLevelSetByImage(API)
  473. lmrcImageROI2D(API)
  474. lmrcImageROI3D(API)
  475. lmrcImageRadialDistribution(API)
  476. lmrcImageRhoFiltering(API)
  477. lmrcImageSSDA(API)
  478. lmrcImageSamplingUnitChange(API)
  479. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxation(API)
  480. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijDimensionSet(API)
  481. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueCalculate(API)
  482. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueSet(API)
  483. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationQValueSet(API)
  484. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationRValueSet(API)
  485. lmrcImageShapePCA(API)
  486. lmrcImageSigmaCalculate(API)
  487. lmrcImageSinogram(API)
  488. lmrcImageSinogramFFT(API)
  489. lmrcImageSolventFlattening(API)
  490. lmrcImageSpatialFrequencyFilter(API)
  491. lmrcImageSphere(API)
  492. lmrcImageSplit(API)
  493. lmrcImageStudentCalculate(API)
  494. lmrcImageSubtractionCalc(API)
  495. lmrcImageSummationCalculate(API)
  496. lmrcImageSymmetryFind(API)
  497. lmrcImageTone(API)
  498. lmrcImageTransformDescartesIntoPolar(API)
  499. lmrcImageTriming(API)
  500. lmrcImageVolumeCalc(API)

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