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  1. $HOME/.Eos/Display2
  2. (検証)リモートのDockerコンテナからVirtualGLでOpenGL飛ばせるのか
  3. 2D classificationジョブのSTARファイル
  4. 3D auto-refineのSTARファイル
  5. 3D classificationのSTARファイル
  6. 3次元再構成
  7. API
  8. API集
  9. ASCII
  10. ActorMaker(API)
  11. Anaconda覚書
  12. Array(API)
  13. Bashによる統合
  14. CCP4
  15. CTF
  16. CTF estimationジョブのSTARファイル
  17. CTF補正
  18. CUDA
  19. CheckCommonLineData
  20. CheckOfOrientation
  21. CheckOrientationByDegree
  22. Cluster(API)
  23. Command Line Tools
  24. CommonLineCalculation
  25. CommonLineRankCalc k
  26. Contour(API)
  27. Crystal(API)
  28. CtfDetemine
  29. Cufft
  30. DCDFile(API)
  31. DMフォーマット
  32. DataBase(API)
  33. DataBaseCorbaBank(API)
  34. DataBaseCorbaImpl(API)
  35. DataBaseCorbaManager(API)
  36. DataBaseJournal(API)
  37. DataBaseMaker(API)
  38. DataBaseNote(API)
  39. DataSearcher(API)
  40. DataStore(API)
  41. Descartes2Polar
  42. Display2
  43. Display2による粒子抽出
  44. DisplayListNumber(API)
  45. DockerでJupyterLab
  46. DockerでPythonによるデータ分析環境を作る
  47. DockerでRELION
  48. DockerでcryoSPARCクラスタ
  49. DockerとNVIDIA Dockerのインストール
  50. Dockerのインストール
  51. Dockerコマンド備忘録
  52. Dockerトラブルシューティング
  53. Docker関連
  54. EMAN2プロセッサ
  55. EMAN2関連
  56. EMPIAR
  57. EMPIARからのデータダウンロード方法
  58. Eos
  59. Eos(API)
  60. Eos/PIONE
  61. Eos/PIONE/Zephyr/WITs/VEM システム
  62. Eos/src/Objects
  63. Eos/src/Tools
  64. EosCuda
  65. EosEnvSet
  66. EosOnCUDA
  67. EosOnLinux
  68. EosOnMac
  69. EosPThread
  70. Eos env
  71. Eospediaの編集で使用しているツール
  72. EosのTIPS
  73. Eosのインストール
  74. Eosのコマンド
  75. Eosの構造
  76. Eosの開発
  77. Eosの開発におけるTIPS
  78. Eos関連ソフトウェアのTIPS
  79. EvaluateCorrelationMapwithCommonLine
  80. FAQ
  81. FEIの制御
  82. FETOrientationSearchByAnnealing
  83. FETOrientationSearchByFeatureAlignment
  84. FETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting
  85. FETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization
  86. FRET解析
  87. FigureFactory(API)
  88. File(API)
  89. File Formats and Other Documentation
  90. GITHUB/PIONE
  91. GITの使い方
  92. GNU parallel
  93. GPGPU
  94. Gaussian
  95. Gaussian Checkpoint Files
  96. Gautomatch
  97. Gctf
  98. Git
  99. Gitコマンド備忘録
  100. HDF5
  101. HDFView
  102. HomologyStore(API)
  103. IMAGIC(API)
  104. IMOD/ETomo
  105. Imaris
  106. Integration Tools
  107. JSON
  108. JavaScript
  109. JavaScriptのTIPS
  110. JupyterLab
  111. JupyterLab設定
  112. LCalculationForOrientationSearch
  113. LD LIBRARY PATH
  114. LINDA
  115. LINUXに関連したソフトウェアのTIPS
  116. LVMの使い方
  117. Linuxコマンド備忘録
  118. Linux関連
  119. LoGピッキングのSTARファイル
  120. MPI(massage passing interface)
  121. MTF
  122. MTF無しでPostProcessing
  123. MacOSでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  124. MacOSでsshセッションが途切れる問題
  125. MacOSのzsh設定
  126. MachineIndependent
  127. MaiML
  128. Make
  129. Makefile
  130. Makefileによる統合
  131. Makegeneral
  132. Makeobj
  133. Maketool
  134. Map2D(API)
  135. Markdown
  136. Matplotlib tips
  137. Matrix3D(API)
  138. Memory(API)
  139. MicroED
  140. Moodle関連
  141. Motion correctionジョブのlogfile.pdf
  142. Motion correctionジョブのstarファイル
  143. MrcImage.h
  144. MrcImageBinarization
  145. MrcImageDensityConversion
  146. MrcImageTransepose
  147. NAMD
  148. NVIDIA Dockerのインストール
  149. NeuralNet(API)
  150. NoMachineでリモートデスクトップ
  151. Numpy tips
  152. OSXに関連したソフトウェアのTIPS
  153. OptionControlFile
  154. PDB
  155. PIONE
  156. PIONE Webclient
  157. PIONE Webclientチュートリアル
  158. PIONEによる統合
  159. PIONEのTIPS
  160. PIONEのインストール方法
  161. PIONEの式
  162. PIONEの詳細
  163. PIONEの起動方法
  164. PIONEコマンドのTIPS
  165. PIONEコマンド一覧
  166. PIONEチュートリアル
  167. PIONEチュートリアル-PNML
  168. PIONEチュートリアル-XES
  169. PIONEチュートリアル-package
  170. PIONE定義書
  171. PIONE定義書のTIPS
  172. PNML
  173. PSF
  174. PVM(API)
  175. Pandoc
  176. Particle extractionジョブのSTARファイル
  177. PickedDataStore(API)
  178. Polar2Descartes
  179. Polish後の3D auto-refineの標準出力
  180. ProM
  181. ProMの使い方
  182. Production system
  183. ProjectionDirectionMapCreate
  184. Property(API)
  185. PropertyTcl(API)
  186. ProtoObjectMethodCreate
  187. Pthread
  188. Python
  189. Python on Windows10
  190. Python tips
  191. PythonのためのVisual Studio Code設定覚書
  192. Pythonトラブルシューティング
  193. RELION
  194. RELION2のCentOSへの導入
  195. RELION2のScientificLinux7への導入
  196. RELION2のUbuntuへの導入
  197. RELION3.1チュートリアル
  198. RELION3のMacへの導入
  199. RELION3チュートリアル
  200. RELION tips
  201. RELIONのMacへの導入
  202. RELIONのSTARファイル
  203. RELIONの定義済みラベル
  204. RELIONチュートリアル
  205. RELIONトラブルシューティング
  206. RELIONビルド時のCMakeCache.txt
  207. RELIONビルド時のエラー1
  208. RELION備忘録
  209. RELION実装
  210. RELION理論
  211. ROI
  212. Random(API)
  213. Ref
  214. Ruby
  215. RubyのTIPS
  216. SBF-SEMからの３次元再構成
  217. SGDのアニーリングについて
  218. SIRT
  219. SerialEM
  220. ShapeMaker(API)
  221. Sinatra
  222. Small Tools
  223. Socket(API)
  224. SpecialNumber(API)
  225. String(API)
  226. Support
  227. Tcl/Tk
  228. Test
  229. Topaz
  230. UbuntuでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  231. VEM
  232. VEM/WITs
  233. VNCでリモートデスクトップ(CentOS-MacOS編)
  234. VNCでリモートデスクトップ(Ubuntu-MacOS編)
  235. Vector(API)
  236. VirtualGLでリモートのOpenGLアプリをぬるぬる動かす
  237. Visual Studio Code
  238. Visual Studio CodeでPythonデバッグ実行
  239. Visual Studio CodeでRuby開発
  240. Visual Studio Codeでリモート開発
  241. Visualmake
  242. WITs
  243. WITs-CLEM
  244. WITs-CLEM チュートリアル
  245. WITsの実行例
  246. WITsの構成
  247. WITsの環境
  248. WSLでEMAN2
  249. WeightCalculationOfCommonLineSearch
  250. WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram
  251. WoPeD
  252. XES
  253. XML Schema
  254. XQuartz
  255. Xcode
  256. Zephyr
  257. angleMatchTest k
  258. anglediffchk
  259. array2mrc
  260. arrayPCA
  261. avsFile(API)
  262. bin2mrc
  263. bmp2mrc
  264. bmpFile(API)
  265. bmpFileInfo
  266. cgi
  267. chimera
  268. chimerax
  269. chimeraのTips
  270. clusterLog2ToLog
  271. clusterLogASCII2Binary
  272. clusterShow
  273. coordRotation
  274. cryoDRGN
  275. cryoSPARC
  276. cryoSPARC tips
  277. cryoSPARCトラブルシューティング
  278. ctfDeterminationFromMultiImage
  279. ctfDeterminationFromPhaseComparison
  280. ctfDeterminationFromPhaseComparison(API)
  281. ctfDeterminationFromThonRing
  282. ctfDetermine
  283. ctfDisplay
  284. ctfEnvelopFunction
  285. ctfEnvelopFunctionEstimate
  286. ctfFunction
  287. ctfInfo(API)
  288. ctfInfoSet
  289. ctfInfoWrite2(API)
  290. ctfMultiFunction
  291. ctfWeightMapCreation
  292. ctfZeroPoint
  293. ctfZeroPoint(API)
  294. cufft
  295. dataAnalysis kayabuki
  296. defocusDeterminationFromThonRing
  297. dm2mrc
  298. dmInfo
  299. dos2unix
  300. dsn6File(API)
  301. e2boxer.py
  302. e2display.pyによる単粒子サイズ計測
  303. eTomoチュートリアル
  304. electronWaveLength
  305. emData(API)
  306. emData2mrc
  307. energyTransferModelCheck
  308. energyTransferModelResultCheck
  309. eosAlsa(API)
  310. eosAxisSource(API)
  311. eosCuda(API)
  312. eosDataPicker(API)
  313. eosFunc(API)
  314. eosInteractorMyStyle(API)
  315. eosInteractorStyleStereo(API)
  316. eosList(API)
  317. eosMathAverage
  318. eosMathMedian
  319. eosMathSorting
  320. eosOpenGL(API)
  321. eosPThread(API)
  322. eosPoint(API)
  323. eosPointProjector
  324. eosPointRotation
  325. eosStereoRenderer(API)
  326. eosStereoWindow(API)
  327. eosTclNewCommandCreate(API)
  328. fftn(API)
  329. genUtil(API)
  330. gifFile(API)
  331. god
  332. hf2000(API)
  333. hostCondition
  334. html
  335. imagesView
  336. imodst2mrc
  337. instamatic
  338. ip2mrc
  339. ipyvolumeでインタラクティブ3Dプロット
  340. khorosData(API)
  341. lCommonLineCalculation(API)
  342. lDescartesIntoPolar(API)
  343. lEvaluateCorrelationMapwithCommonLine(API)
  344. lFETOrientationSearchByAnnealing(API)
  345. lFETOrientationSearchByFeatureAlignment(API)
  346. lFETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting(API)
  347. lFETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization(API)
  348. lFRET(API)
  349. largeIP(API)
  350. largeIPInfo
  351. larray2mrc(API)
  352. lastigmatismDetection(API)
  353. lctfDetermination(API)
  354. lhf2000LenzCurrent(API)
  355. lhf2000SpecimenPosition(API)
  356. ll2ltlg
  357. llData(API)
  358. llDataAverage
  359. llDataAxisSearch
  360. llDataCTFCompensate
  361. llDataCompare
  362. llDataContributionCalcDifferentN
  363. llDataDump
  364. llDataEquatorAdd
  365. llDataExtract
  366. llDataFit
  367. llDataInfo
  368. llDataLowPassFiltering
  369. llDataMultiCTFCompensation
  370. llDataNEstimation
  371. llDataNormalization
  372. llDataPrint
  373. llDataRescaling
  374. llDataResolutionCheck
  375. llDataSelectionEstimation
  376. llDataWeightSet
  377. llDatarMaxLimit
  378. llExtract
  379. llExtractCtfinfFileCreate
  380. llExtractCtrlFileCreate
  381. llExtractWithLayerSeparation
  382. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate
  383. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateMyosin
  384. llExtractWithLayerSeparationFilamentInfo
  385. lldb
  386. lll2ltlg(API)
  387. lllDataAxisSearch(API)
  388. lllDataCTF(API)
  389. lllDataCTFCompensate(API)
  390. lllDataCTFCompensation(API)
  391. lllDataCompare(API)
  392. lllDataContributionCalcDifferentN(API)
  393. lllDataDifferenceCalc(API)
  394. lllDataEquatorAdd(API)
  395. lllDataExtract(API)
  396. lllDataFit(API)
  397. lllDataFitAndAverage(API)
  398. lllDataFitParamInverse(API)
  399. lllDataLowPassFiltering(API)
  400. lllDataMergeDifferentN(API)
  401. lllDataRescaling(API)
  402. lllDatarMaxLimit(API)
  403. lllExtract(API)
  404. lllExtractCtfinfFileCreate(API)
  405. lllExtractdYEstimate(API)
  406. lltlg2mrc(API)
  407. lmolvie(API)
  408. lmolvieProteinStatus(API)
  409. lmrc2Dto3D(API)
  410. lmrc3Dto2D(API)
  411. lmrcFETnormalizeBySD(API)
  412. lmrcFFTExpression(API)
  413. lmrcFFTInfo(API)
  414. lmrcFSInfoScatteringAngularDistributionAverageSection(API)
  415. lmrcImage3DPad(API)
  416. lmrcImage3DWindowing(API)
  417. lmrcImageAddValue(API)
  418. lmrcImageAsProbability(API)
  419. lmrcImageAverage(API)
  420. lmrcImageBilateralFilter(API)
  421. lmrcImageBinarization(API)
  422. lmrcImageBoundaryInfo(API)
  423. lmrcImageCTFCompensation(API)
  424. lmrcImageCTFDetermination(API)
  425. lmrcImageCalcArea(API)
  426. lmrcImageCentre(API)
  427. lmrcImageClusterAnalysis(API)
  428. lmrcImageCommonLine(API)
  429. lmrcImageConnection(API)
  430. lmrcImageConnectivityNumberCalc(API)
  431. lmrcImageContourSurface(API)
  432. lmrcImageContourSurfaceCreate
  433. lmrcImageCorrelation(API)
  434. lmrcImageCrystalCreate(API)
  435. lmrcImageDataMaxAndMinGetByImage(API)
  436. lmrcImageDataStraightCopy(API)
  437. lmrcImageDeconvolution(API)
  438. lmrcImageDensity(API)
  439. lmrcImageDensityInverse(API)
  440. lmrcImageDensityNormalizationByImage(API)
  441. lmrcImageDistanceConversion(API)
  442. lmrcImageEdge(API)
  443. lmrcImageEdgeAverage(API)
  444. lmrcImageEdgeEnhancement(API)
  445. lmrcImageFOMCalc(API)
  446. lmrcImageFeatureExtraction(API)
  447. lmrcImageFileListAndEulerAngleDataRead(API)
  448. lmrcImageFilterCreate(API)
  449. lmrcImageFirstNoiseReductionByRelaxation(API)
  450. lmrcImageFloating(API)
  451. lmrcImageFourierNeighborCorrelation(API)
  452. lmrcImageFourierShellCorrelation(API)
  453. lmrcImageHoughTransform(API)
  454. lmrcImageLabeling(API)
  455. lmrcImageLogic(API)
  456. lmrcImageMasking(API)
  457. lmrcImageMirroring(API)
  458. lmrcImageModeChange(API)
  459. lmrcImageModelCreate(API)
  460. lmrcImageMontage(API)
  461. lmrcImageMorphology(API)
  462. lmrcImageMove(API)
  463. lmrcImageMultiplying(API)
  464. lmrcImageNoiseCreate(API)
  465. lmrcImageNormalizing(API)
  466. lmrcImageOneLineSimilarityCalc(API)
  467. lmrcImageOrientationSearchBySimultaneousMinimization(API)
  468. lmrcImagePad(API)
  469. lmrcImagePixelSummationOfProbabilityGetByImage(API)
  470. lmrcImagePosterization(API)
  471. lmrcImagePrint(API)
  472. lmrcImageProjection(API)
  473. lmrcImageProportionalDensityLevelSetByImage(API)
  474. lmrcImageROI2D(API)
  475. lmrcImageROI3D(API)
  476. lmrcImageRadialDistribution(API)
  477. lmrcImageRhoFiltering(API)
  478. lmrcImageSSDA(API)
  479. lmrcImageSamplingUnitChange(API)
  480. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxation(API)
  481. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijDimensionSet(API)
  482. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueCalculate(API)
  483. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueSet(API)
  484. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationQValueSet(API)
  485. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationRValueSet(API)
  486. lmrcImageShapePCA(API)
  487. lmrcImageSigmaCalculate(API)
  488. lmrcImageSinogram(API)
  489. lmrcImageSinogramFFT(API)
  490. lmrcImageSolventFlattening(API)
  491. lmrcImageSpatialFrequencyFilter(API)
  492. lmrcImageSphere(API)
  493. lmrcImageSplit(API)
  494. lmrcImageStudentCalculate(API)
  495. lmrcImageSubtractionCalc(API)
  496. lmrcImageSummationCalculate(API)
  497. lmrcImageSymmetryFind(API)
  498. lmrcImageTone(API)
  499. lmrcImageTransformDescartesIntoPolar(API)
  500. lmrcImageTriming(API)

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