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  1. $HOME/.Eos/Display2
  2. (検証)リモートのDockerコンテナからVirtualGLでOpenGL飛ばせるのか
  3. 2D classificationジョブのSTARファイル
  4. 3D auto-refineのSTARファイル
  5. 3D classificationのSTARファイル
  6. 3次元再構成
  7. API
  8. API集
  9. ASCII
  10. ActorMaker(API)
  11. Anaconda覚書
  12. Array(API)
  13. Bashによる統合
  14. CCP4
  15. CTF
  16. CTF estimationジョブのSTARファイル
  17. CTF補正
  18. CUDA
  19. CheckCommonLineData
  20. CheckOfOrientation
  21. CheckOrientationByDegree
  22. Cluster(API)
  23. Command Line Tools
  24. CommonLineCalculation
  25. CommonLineRankCalc k
  26. Contour(API)
  27. Crystal(API)
  28. CtfDetemine
  29. Cufft
  30. DCDFile(API)
  31. DMフォーマット
  32. DataBase(API)
  33. DataBaseCorbaBank(API)
  34. DataBaseCorbaImpl(API)
  35. DataBaseCorbaManager(API)
  36. DataBaseJournal(API)
  37. DataBaseMaker(API)
  38. DataBaseNote(API)
  39. DataSearcher(API)
  40. DataStore(API)
  41. Descartes2Polar
  42. Display2
  43. Display2による粒子抽出
  44. DisplayListNumber(API)
  45. DockerでJupyterLab
  46. DockerでPythonによるデータ分析環境を作る
  47. DockerでRELION
  48. DockerでcryoSPARCクラスタ
  49. DockerとNVIDIA Dockerのインストール
  50. Dockerのインストール
  51. Dockerコマンド備忘録
  52. Dockerトラブルシューティング
  53. Docker関連
  54. EMAN2プロセッサ
  55. EMAN2関連
  56. EMPIAR
  57. EMPIARからのデータダウンロード方法
  58. Eos
  59. Eos(API)
  60. Eos/PIONE
  61. Eos/PIONE/Zephyr/WITs/VEM システム
  62. Eos/src/Objects
  63. Eos/src/Tools
  64. EosCuda
  65. EosEnvSet
  66. EosOnCUDA
  67. EosOnLinux
  68. EosOnMac
  69. EosPThread
  70. Eos env
  71. Eospediaの編集で使用しているツール
  72. EosのTIPS
  73. Eosのインストール
  74. Eosのコマンド
  75. Eosの構造
  76. Eosの開発
  77. Eosの開発におけるTIPS
  78. Eos関連ソフトウェアのTIPS
  79. EvaluateCorrelationMapwithCommonLine
  80. FAQ
  81. FEIの制御
  82. FETOrientationSearchByAnnealing
  83. FETOrientationSearchByFeatureAlignment
  84. FETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting
  85. FETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization
  86. FRET解析
  87. FigureFactory(API)
  88. File(API)
  89. GITHUB/PIONE
  90. GITの使い方
  91. GNU parallel
  92. GPGPU
  93. Gautomatch
  94. Gctf
  95. Git
  96. Gitコマンド備忘録
  97. HomologyStore(API)
  98. IMAGIC(API)
  99. IMOD/ETomo
  100. Integration Tools
  101. JSON
  102. JavaScript
  103. JavaScriptのTIPS
  104. JupyterLab
  105. JupyterLab設定
  106. LCalculationForOrientationSearch
  107. LD LIBRARY PATH
  108. LINDA
  109. LINUXに関連したソフトウェアのTIPS
  110. LVMの使い方
  111. Linuxコマンド備忘録
  112. Linux関連
  113. LoGピッキングのSTARファイル
  114. MPI(massage passing interface)
  115. MTF
  116. MTF無しでPostProcessing
  117. MacOSでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  118. MacOSでsshセッションが途切れる問題
  119. MacOSのzsh設定
  120. MachineIndependent
  121. Make
  122. Makefile
  123. Makefileによる統合
  124. Makegeneral
  125. Makeobj
  126. Maketool
  127. Map2D(API)
  128. Markdown
  129. Matplotlib tips
  130. Matrix3D(API)
  131. Memory(API)
  132. MicroED
  133. Moodle関連
  134. Motion correctionジョブのlogfile.pdf
  135. Motion correctionジョブのstarファイル
  136. MrcImage.h
  137. MrcImageBinarization
  138. MrcImageDensityConversion
  139. MrcImageTransepose
  140. NAMD
  141. NVIDIA Dockerのインストール
  142. NeuralNet(API)
  143. NoMachineでリモートデスクトップ
  144. Numpy tips
  145. OSXに関連したソフトウェアのTIPS
  146. OptionControlFile
  147. PDB
  148. PIONE
  149. PIONE Webclient
  150. PIONE Webclientチュートリアル
  151. PIONEによる統合
  152. PIONEのTIPS
  153. PIONEのインストール方法
  154. PIONEの式
  155. PIONEの詳細
  156. PIONEの起動方法
  157. PIONEコマンドのTIPS
  158. PIONEコマンド一覧
  159. PIONEチュートリアル
  160. PIONEチュートリアル-PNML
  161. PIONEチュートリアル-XES
  162. PIONEチュートリアル-package
  163. PIONE定義書
  164. PIONE定義書のTIPS
  165. PNML
  166. PSF
  167. PVM(API)
  168. Pandoc
  169. Particle extractionジョブのSTARファイル
  170. PickedDataStore(API)
  171. Polar2Descartes
  172. Polish後の3D auto-refineの標準出力
  173. ProM
  174. ProMの使い方
  175. Production system
  176. ProjectionDirectionMapCreate
  177. Property(API)
  178. PropertyTcl(API)
  179. ProtoObjectMethodCreate
  180. Pthread
  181. Python
  182. Python on Windows10
  183. Python tips
  184. PythonのためのVisual Studio Code設定覚書
  185. Pythonトラブルシューティング
  186. RELION
  187. RELION2のCentOSへの導入
  188. RELION2のScientificLinux7への導入
  189. RELION2のUbuntuへの導入
  190. RELION3.1チュートリアル
  191. RELION3のMacへの導入
  192. RELION3チュートリアル
  193. RELION tips
  194. RELIONのMacへの導入
  195. RELIONのSTARファイル
  196. RELIONの定義済みラベル
  197. RELIONチュートリアル
  198. RELIONトラブルシューティング
  199. RELIONビルド時のCMakeCache.txt
  200. RELIONビルド時のエラー1
  201. RELION備忘録
  202. RELION実装
  203. RELION理論
  204. ROI
  205. Random(API)
  206. Ref
  207. Ruby
  208. RubyのTIPS
  209. SBF-SEMからの3次元再構成
  210. SGDのアニーリングについて
  211. SIRT
  212. ShapeMaker(API)
  213. Sinatra
  214. Small Tools
  215. Socket(API)
  216. SpecialNumber(API)
  217. String(API)
  218. Support
  219. Tcl/Tk
  220. Test
  221. Topaz
  222. UbuntuでAnaconda3を用いてEMAN2仮想環境を構築する
  223. VEM
  224. VEM/WITs
  225. VNCでリモートデスクトップ(CentOS-MacOS編)
  226. VNCでリモートデスクトップ(Ubuntu-MacOS編)
  227. Vector(API)
  228. VirtualGLでリモートのOpenGLアプリをぬるぬる動かす
  229. Visual Studio Code
  230. Visual Studio CodeでPythonデバッグ実行
  231. Visual Studio CodeでRuby開発
  232. Visual Studio Codeでリモート開発
  233. Visualmake
  234. WITs
  235. WITs-CLEM
  236. WITs-CLEM チュートリアル
  237. WITsの実行例
  238. WITsの構成
  239. WITsの環境
  240. WSLでEMAN2
  241. WeightCalculationOfCommonLineSearch
  242. WeightCalculationOfCommonLineSearchByAllSinogram
  243. WoPeD
  244. XES
  245. XML Schema
  246. XQuartz
  247. Xcode
  248. Zephyr
  249. angleMatchTest k
  250. anglediffchk
  251. array2mrc
  252. arrayPCA
  253. avsFile(API)
  254. bin2mrc
  255. bmp2mrc
  256. bmpFile(API)
  257. bmpFileInfo
  258. cgi
  259. chimera
  260. chimerax
  261. chimeraのTips
  262. clusterLog2ToLog
  263. clusterLogASCII2Binary
  264. clusterShow
  265. coordRotation
  266. cryoDRGN
  267. cryoSPARC
  268. cryoSPARC tips
  269. cryoSPARCトラブルシューティング
  270. ctfDeterminationFromMultiImage
  271. ctfDeterminationFromPhaseComparison
  272. ctfDeterminationFromPhaseComparison(API)
  273. ctfDeterminationFromThonRing
  274. ctfDetermine
  275. ctfDisplay
  276. ctfEnvelopFunction
  277. ctfEnvelopFunctionEstimate
  278. ctfFunction
  279. ctfInfo(API)
  280. ctfInfoSet
  281. ctfInfoWrite2(API)
  282. ctfMultiFunction
  283. ctfWeightMapCreation
  284. ctfZeroPoint
  285. ctfZeroPoint(API)
  286. cufft
  287. dataAnalysis kayabuki
  288. defocusDeterminationFromThonRing
  289. dm2mrc
  290. dmInfo
  291. dos2unix
  292. dsn6File(API)
  293. e2boxer.py
  294. e2display.pyによる単粒子サイズ計測
  295. eTomoチュートリアル
  296. electronWaveLength
  297. emData(API)
  298. emData2mrc
  299. energyTransferModelCheck
  300. energyTransferModelResultCheck
  301. eosAlsa(API)
  302. eosAxisSource(API)
  303. eosCuda(API)
  304. eosDataPicker(API)
  305. eosFunc(API)
  306. eosInteractorMyStyle(API)
  307. eosInteractorStyleStereo(API)
  308. eosList(API)
  309. eosOpenGL(API)
  310. eosPThread(API)
  311. eosPoint(API)
  312. eosPointProjector
  313. eosPointRotation
  314. eosStereoRenderer(API)
  315. eosStereoWindow(API)
  316. eosTclNewCommandCreate(API)
  317. fftn(API)
  318. genUtil(API)
  319. gifFile(API)
  320. god
  321. hf2000(API)
  322. hostCondition
  323. html
  324. imagesView
  325. imodst2mrc
  326. instamatic
  327. ip2mrc
  328. ipyvolumeでインタラクティブ3Dプロット
  329. khorosData(API)
  330. lCommonLineCalculation(API)
  331. lDescartesIntoPolar(API)
  332. lEvaluateCorrelationMapwithCommonLine(API)
  333. lFETOrientationSearchByAnnealing(API)
  334. lFETOrientationSearchByFeatureAlignment(API)
  335. lFETmapOrientationSearchBySimultaneousFitting(API)
  336. lFETsmallMapSetCreate forSimultaneousMinimization(API)
  337. lFRET(API)
  338. largeIP(API)
  339. largeIPInfo
  340. larray2mrc(API)
  341. lastigmatismDetection(API)
  342. lctfDetermination(API)
  343. lhf2000LenzCurrent(API)
  344. lhf2000SpecimenPosition(API)
  345. ll2ltlg
  346. llData(API)
  347. llDataAverage
  348. llDataAxisSearch
  349. llDataCTFCompensate
  350. llDataCompare
  351. llDataContributionCalcDifferentN
  352. llDataDump
  353. llDataEquatorAdd
  354. llDataExtract
  355. llDataFit
  356. llDataInfo
  357. llDataLowPassFiltering
  358. llDataMultiCTFCompensation
  359. llDataNEstimation
  360. llDataNormalization
  361. llDataPrint
  362. llDataRescaling
  363. llDataResolutionCheck
  364. llDataSelectionEstimation
  365. llDataWeightSet
  366. llDatarMaxLimit
  367. llExtract
  368. llExtractCtfinfFileCreate
  369. llExtractCtrlFileCreate
  370. llExtractWithLayerSeparation
  371. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate
  372. llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateMyosin
  373. llExtractWithLayerSeparationFilamentInfo
  374. lldb
  375. lll2ltlg(API)
  376. lllDataAxisSearch(API)
  377. lllDataCTF(API)
  378. lllDataCTFCompensate(API)
  379. lllDataCTFCompensation(API)
  380. lllDataCompare(API)
  381. lllDataContributionCalcDifferentN(API)
  382. lllDataDifferenceCalc(API)
  383. lllDataEquatorAdd(API)
  384. lllDataExtract(API)
  385. lllDataFit(API)
  386. lllDataFitAndAverage(API)
  387. lllDataFitParamInverse(API)
  388. lllDataLowPassFiltering(API)
  389. lllDataMergeDifferentN(API)
  390. lllDataRescaling(API)
  391. lllDatarMaxLimit(API)
  392. lllExtract(API)
  393. lllExtractCtfinfFileCreate(API)
  394. lllExtractdYEstimate(API)
  395. lltlg2mrc(API)
  396. lmolvie(API)
  397. lmolvieProteinStatus(API)
  398. lmrc2Dto3D(API)
  399. lmrc3Dto2D(API)
  400. lmrcFETnormalizeBySD(API)
  401. lmrcFFTExpression(API)
  402. lmrcFFTInfo(API)
  403. lmrcFSInfoScatteringAngularDistributionAverageSection(API)
  404. lmrcImage3DPad(API)
  405. lmrcImage3DWindowing(API)
  406. lmrcImageAddValue(API)
  407. lmrcImageAsProbability(API)
  408. lmrcImageAverage(API)
  409. lmrcImageBilateralFilter(API)
  410. lmrcImageBinarization(API)
  411. lmrcImageBoundaryInfo(API)
  412. lmrcImageCTFCompensation(API)
  413. lmrcImageCTFDetermination(API)
  414. lmrcImageCalcArea(API)
  415. lmrcImageCentre(API)
  416. lmrcImageClusterAnalysis(API)
  417. lmrcImageCommonLine(API)
  418. lmrcImageConnection(API)
  419. lmrcImageConnectivityNumberCalc(API)
  420. lmrcImageContourSurface(API)
  421. lmrcImageContourSurfaceCreate
  422. lmrcImageCorrelation(API)
  423. lmrcImageCrystalCreate(API)
  424. lmrcImageDataMaxAndMinGetByImage(API)
  425. lmrcImageDataStraightCopy(API)
  426. lmrcImageDeconvolution(API)
  427. lmrcImageDensity(API)
  428. lmrcImageDensityInverse(API)
  429. lmrcImageDensityNormalizationByImage(API)
  430. lmrcImageDistanceConversion(API)
  431. lmrcImageEdge(API)
  432. lmrcImageEdgeAverage(API)
  433. lmrcImageEdgeEnhancement(API)
  434. lmrcImageFOMCalc(API)
  435. lmrcImageFeatureExtraction(API)
  436. lmrcImageFileListAndEulerAngleDataRead(API)
  437. lmrcImageFilterCreate(API)
  438. lmrcImageFirstNoiseReductionByRelaxation(API)
  439. lmrcImageFloating(API)
  440. lmrcImageFourierNeighborCorrelation(API)
  441. lmrcImageFourierShellCorrelation(API)
  442. lmrcImageHoughTransform(API)
  443. lmrcImageLabeling(API)
  444. lmrcImageLogic(API)
  445. lmrcImageMasking(API)
  446. lmrcImageMirroring(API)
  447. lmrcImageModeChange(API)
  448. lmrcImageModelCreate(API)
  449. lmrcImageMontage(API)
  450. lmrcImageMorphology(API)
  451. lmrcImageMove(API)
  452. lmrcImageMultiplying(API)
  453. lmrcImageNoiseCreate(API)
  454. lmrcImageNormalizing(API)
  455. lmrcImageOneLineSimilarityCalc(API)
  456. lmrcImageOrientationSearchBySimultaneousMinimization(API)
  457. lmrcImagePad(API)
  458. lmrcImagePixelSummationOfProbabilityGetByImage(API)
  459. lmrcImagePosterization(API)
  460. lmrcImagePrint(API)
  461. lmrcImageProjection(API)
  462. lmrcImageProportionalDensityLevelSetByImage(API)
  463. lmrcImageROI2D(API)
  464. lmrcImageROI3D(API)
  465. lmrcImageRadialDistribution(API)
  466. lmrcImageRhoFiltering(API)
  467. lmrcImageSSDA(API)
  468. lmrcImageSamplingUnitChange(API)
  469. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxation(API)
  470. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijDimensionSet(API)
  471. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueCalculate(API)
  472. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationDijValueSet(API)
  473. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationQValueSet(API)
  474. lmrcImageSecondNoiseReductionByRelaxationRValueSet(API)
  475. lmrcImageShapePCA(API)
  476. lmrcImageSigmaCalculate(API)
  477. lmrcImageSinogram(API)
  478. lmrcImageSinogramFFT(API)
  479. lmrcImageSolventFlattening(API)
  480. lmrcImageSpatialFrequencyFilter(API)
  481. lmrcImageSphere(API)
  482. lmrcImageSplit(API)
  483. lmrcImageStudentCalculate(API)
  484. lmrcImageSubtractionCalc(API)
  485. lmrcImageSummationCalculate(API)
  486. lmrcImageSymmetryFind(API)
  487. lmrcImageTone(API)
  488. lmrcImageTransformDescartesIntoPolar(API)
  489. lmrcImageTriming(API)
  490. lmrcImageVolumeCalc(API)
  491. lmrcImageWindowing(API)
  492. lmrcImagesStatDataGet(API)
  493. lmrcNeuralNet(API)
  494. lmrcSinogramFET(API)
  495. lmrcSinogramFETcalcWeight(API)
  496. lmrcSinogramFETcorrelationMap(API)
  497. lmrcSinogramFETnormalizedMap(API)
  498. lmrcSinogramFETreferredCorrelation(API)
  499. lmrcSinogramFETsmoothParameterMatching(API)
  500. lpdb2mrcInfo(API)

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